RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 PRSS56P0CW18 603 aa15.18■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 UNC50Q53HI1 259 aa15.18■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 PAQR3Q6TCH7 311 aa15.18■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 P2RY8Q86VZ1 359 aa15.18■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 KLRG1Q96E93 195 aa15.18■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 SNX27Q96L92 541 aa15.18■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 MYRFLQ96LU7 910 aa15.18■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 ZBED2Q9BTP6 218 aa15.18■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 SYTL2Q9HCH5 934 aa15.18■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 CATSPERZQ9NTU4 200 aa15.18■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 SPATA7Q9P0W8 599 aa15.18■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 VPS4AQ9UN37 437 aa15.18■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 PDZK1P1A8MUH7 402 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 PCSK1P29120 753 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 SHMT2P34897 504 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 ARSDP51689 593 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 TBPL2Q6SJ96 375 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 DSG4Q86SJ6 1040 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 SLC30A3Q99726 388 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 PRDM8Q9NQV8 689 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 KLQ9UEF7 1012 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 POU2F3Q9UKI9 436 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 A8MV72 311 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 ZBTB42B2RXF5 422 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 H0YJX3 145 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 BCKDKO14874 412 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 KCNC1P48547 511 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 CTBSQ01459 385 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 GPSM1Q86YR5 675 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 LZTR1Q8N653 840 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 TRPM4Q8TD43 1214 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 GPR21Q99679 349 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 MYOCQ99972 504 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 MAP10Q9P2G4 905 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 NME7Q9Y5B8 376 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 CDC7O00311 574 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 PRKD3O94806 890 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 NR4A2P43354 598 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 DGKEP52429 567 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 NCS1P62166 190 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 GSTM4Q03013 218 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 AP5B1Q2VPB7 878 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 OR56A4Q8NGH8 313 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 ADAMTS10Q9H324 1103 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 TPRKBQ9Y3C4 175 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 VPS26AO75436 327 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 CCNKO75909 580 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 GOT2P00505 430 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 UGT2B4P06133 528 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 DNAJB2P25686 324 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 SLC10A7Q0GE19 358 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 LCP2Q13094 533 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 CYBRD1Q53TN4 286 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 ARMCX6Q7L4S7 300 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 SLC10A4Q96EP9 437 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 VRTNQ9H8Y1 702 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 ARMC1Q9NVT9 282 aa15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 GALNT2Q10471 571 aa15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 ATP6AP1Q15904 470 aa15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 ADHFE1Q8IWW8 467 aa15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 MYLPFQ96A32 169 aa15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 ZUFSPQ96AP4 578 aa15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 SMARCD1Q96GM5 515 aa15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 GSTO2Q9H4Y5 243 aa15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 IGSF5Q9NSI5 407 aa15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 CDH9Q9ULB4 789 aa15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 A0A1W2PP18 115 aa15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 J3KR12 359 aa15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 IDH3BO43837 385 aa15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 TSC22D2O75157 780 aa15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 DEFA1P59665 94 aa15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 DEFA3P59666 94 aa15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 PFKPQ01813 784 aa15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 ANKRD34AQ69YU3 496 aa15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 PTERQ96BW5 349 aa15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78 ms