RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 VWA8A3KMH1 1905 aa27.74■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 INSIG1O15503 277 aa27.74■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 PKMP14618 531 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 HTR1EP28566 365 aa27.74■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 TTPAP49638 278 aa27.74■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 APLP1P51693 650 aa27.74■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 DEFB115Q30KQ5 88 aa27.74■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa27.74■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 PRR23BQ6ZRT6 265 aa27.74■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 ZNF225Q9UK10 706 aa27.74■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 AGTR2P50052 363 aa27.73■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 UFM1P61960 85 aa27.73■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa27.73■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 IFNEQ86WN2 208 aa27.73■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 KIAA2013Q8IYS2 634 aa27.73■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 MDGA1Q8NFP4 955 aa27.73■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 TSPAN12O95859 305 aa27.72■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa27.72■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 CES1P23141 567 aa27.72■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 NUP107P57740 925 aa27.72■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa27.72■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 CFAP52Q8N1V2 620 aa27.72■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 OSCP1Q8WVF1 389 aa27.72■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 ZNF382Q96SR6 550 aa27.72■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 CCSER2Q9H7U1 834 aa27.72■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 CLOCKO15516 846 aa27.72■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 TLR5O60602 858 aa27.72■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 LPOP22079 712 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 CAPGP40121 348 aa27.72■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 IL2P60568 153 aa27.72■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 EMX2Q04743 252 aa27.72■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 TRAF7Q6Q0C0 670 aa27.72■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 GPSM1Q86YR5 675 aa27.72■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 DHRSXQ8N5I4 330 aa27.72■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 OR7D4Q8NG98 312 aa27.72■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 CYGBQ8WWM9 190 aa27.72■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 COMMD10Q9Y6G5 202 aa27.72■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 EI24O14681 340 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 KDELR3O43731 214 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 LDLRP01130 860 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 CKBP12277 381 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 CR2P20023 1033 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 TTKP33981 857 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 CLCN4P51793 760 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 CDH4P55283 916 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 OXCT1P55809 520 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 FBXO48Q5FWF7 155 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 NANOGP8Q6NSW7 305 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 OR2T11Q8NH01 316 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 PXYLP1Q8TE99 480 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 GLT1D1Q96MS3 346 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 LRRC3Q9BY71 257 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 TRIM8Q9BZR9 551 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 NANOGQ9H9S0 305 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 ZNF639Q9UID6 485 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 FADS3Q9Y5Q0 445 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 ACSL4O60488 711 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 C1RP00736 705 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 RPS9P46781 194 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 SCNN1BP51168 640 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 FAM189BP81408 668 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 C6orf136Q5SQH8 315 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 UGT3A1Q6NUS8 523 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 DPP10Q8N608 796 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 SCUBE2Q9NQ36 999 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 GALPQ9UBC7 116 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa27.71■■■□□ 2.03
UBP1-201ENST00000283628 E2F3O00716 465 aa27.7■■■□□ 2.02
UBP1-201ENST00000283628 RGRP47804 291 aa27.7■■■□□ 2.02
UBP1-201ENST00000283628 KCNQ1P51787 676 aa27.7■■■□□ 2.02
UBP1-201ENST00000283628 PRKG2Q13237 762 aa27.7■■■□□ 2.02
UBP1-201ENST00000283628 FUT11Q495W5 492 aa27.7■■■□□ 2.02
UBP1-201ENST00000283628 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa27.7■■■□□ 2.02
UBP1-201ENST00000283628 ZFAND4Q86XD8 727 aa27.7■■■□□ 2.02
UBP1-201ENST00000283628 LEMD2Q8NC56 503 aa27.7■■■□□ 2.02
UBP1-201ENST00000283628 RAET1EQ8TD07 263 aa27.7■■■□□ 2.02
UBP1-201ENST00000283628 KCNJ9Q92806 393 aa27.7■■■□□ 2.02
UBP1-201ENST00000283628 ISOC1Q96CN7 298 aa27.7■■■□□ 2.02
UBP1-201ENST00000283628 NSMCE3Q96MG7 304 aa27.7■■■□□ 2.02
UBP1-201ENST00000283628 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
UBP1-201ENST00000283628 SLC30A3Q99726 388 aa27.7■■■□□ 2.02
UBP1-201ENST00000283628 CD274Q9NZQ7 290 aa27.7■■■□□ 2.02
UBP1-201ENST00000283628 ACTL7AQ9Y615 435 aa27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms