RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283351.8

TRAPPC8-201, Transcript of trafficking protein particle complex 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC8, Length 6,226 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8-201ENST00000283351 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 SNPHO15079 494 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 HSPA7P48741 367 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 SQLEQ14534 574 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 SLC30A6Q6NXT4 461 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 CERS6Q6ZMG9 384 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 HIPK1Q86Z02 1210 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 SLC22A15Q8IZD6 547 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 COX18Q8N8Q8 333 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 NPLOC4Q8TAT6 608 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 KLHDC7BQ96G42 594 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 Q96MT0 163 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 PDCD10Q9BUL8 212 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 C9orf16Q9BUW7 83 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 MIOSQ9NXC5 875 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 GABRQQ9UN88 632 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 SESN1Q9Y6P5 492 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 LRIG2O94898 1065 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 ACADSP16219 412 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 PTPN4P29074 926 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 RFC2P35250 354 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 GNALP38405 381 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 TAS2R40P59535 323 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 NAA20P61599 178 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 MC1RQ01726 317 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 TAF5Q15542 800 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 MAPK11Q15759 364 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 CYP2S1Q96SQ9 504 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 SNX15Q9NRS6 342 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 GRIN2DO15399 1336 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 ITSN1Q15811 1721 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 CBX5P45973 191 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 BBS12Q6ZW61 710 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 CMC1Q7Z7K0 106 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 GPR151Q8TDV0 419 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 FKBPLQ9UIM3 349 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 PACSIN3Q9UKS6 424 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 GMPPBQ9Y5P6 360 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 TYRP1P17643 537 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 LDLRAP1Q5SW96 308 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 KRT74Q7RTS7 529 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 SLC4A11Q8NBS3 891 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 SPATA22Q8NHS9 363 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 STYXQ8WUJ0 223 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 BAP1Q92560 729 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 H0YGN5 161 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 CCR3P51677 355 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 ITIH4Q14624 930 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 TMPRSS6Q8IU80 811 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 UBASH3BQ8TF42 649 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 COL20A1Q9P218 1284 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 HCN2Q9UL51 889 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 CHRNA1P02708 482 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 ALOX12P18054 663 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 CHIT1Q13231 466 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 RFX4Q33E94 735 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 SLC40A1Q9NP59 571 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 CKLFQ9UBR5 152 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 BIRC5O15392 142 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 AKIRIN2Q53H80 203 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 SLC25A36Q96CQ1 311 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 ADAP2Q9NPF8 381 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 GGA2Q9UJY4 613 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 H7C0S8 307 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 WFS1O76024 890 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 MED26O95402 600 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 CHRNGP07510 517 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 MYL9P24844 172 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 TIGD2Q4W5G0 525 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 GDPD4Q6W3E5 623 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 PACS2Q86VP3 889 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 SH3GL3Q99963 347 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 KLRF1Q9NZS2 232 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC8-201ENST00000283351 PSMD9O00233 223 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms