RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 TLE6Q9H808 572 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 ARHGEF3Q9NR81 526 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 ABCB10Q9NRK6 738 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 ANGPT4Q9Y264 503 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 KLHL20Q9Y2M5 609 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 DGKBQ9Y6T7 804 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 MYH7P12883 1935 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 GSAPA4D1B5 854 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 FAM25AB3EWG3 89 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 FAM25CB3EWG5 89 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 FAM25GB3EWG6 89 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 PER2O15055 1255 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 NDUFB5O43674 189 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 GMFGO60234 142 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 OR10H3O60404 316 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 VPS4BO75351 444 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 TRBC1P01850 177 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 UQCRBP14927 111 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 ECHS1P30084 290 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 KIR3DL1P43629 444 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 ST13P50502 369 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 AIF1P55008 147 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 CDH15P55291 814 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 PURAQ00577 322 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 SLC9A5Q14940 896 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 SF1Q15637 639 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 ADRM1Q16186 407 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 SNAP47Q5SQN1 464 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 ARMC4Q5T2S8 1044 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 TTC23Q5W5X9 447 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 ZNF549Q6P9A3 640 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 DEF8Q6ZN54 512 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 AGMOQ6ZNB7 445 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 DSG4Q86SJ6 1040 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 TREML1Q86YW5 311 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 IFNL1Q8IU54 200 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 SFRP1Q8N474 314 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 TMEM199Q8N511 208 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 CANT1Q8WVQ1 401 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 CRYGNQ8WXF5 182 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 PHF12Q96QT6 1004 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 APOL4Q9BPW4 351 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 TRMOQ9BU70 441 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 NUAK2Q9H093 628 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 RAD21L1Q9H4I0 556 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 SGK2Q9HBY8 427 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 C3orf18Q9UK00 162 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 ENTPD4Q9Y227 616 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 TPRKBQ9Y3C4 175 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 SLIT2O94813 1529 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 MYADML2A6NDP7 307 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 LRRC14BA6NHZ5 514 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 UPK3BL1B0FP48 263 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 UPK3BL2E5RIL1 263 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 CLIC3O95833 236 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 GBAP04062 536 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 IFNA16P05015 189 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 SLC35G4P0C7Q5 338 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 PAICSP22234 425 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 HPCAL1P37235 193 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 CSKP41240 450 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 SSR2P43308 183 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 PLA2G16P53816 162 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 MANFP55145 182 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 TNK2Q07912 1038 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 LCP2Q13094 533 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 C1DQ13901 141 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 RFX4Q33E94 735 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 C2orf27AQ580R0 203 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 SIRPB2Q5JXA9 342 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 RNF44Q7L0R7 432 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 CHST9Q7L1S5 443 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 NPAS4Q8IUM7 802 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 ARMC8Q8IUR7 673 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 RDH11Q8TC12 318 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 ASZ1Q8WWH4 475 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-201ENST00000261169 ART5Q96L15 291 aa5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms