RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248139.7

RAB40C-201, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB40C, Length 2,699 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-201ENST00000248139 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 MAGEH1Q9H213 219 aa25.3■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 RNF186Q9NXI6 227 aa25.3■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 TET1Q8NFU7 2136 aa25.3■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 H0YJX3 145 aa25.3■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 EI24O14681 340 aa25.3■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 SLC22A3O75751 556 aa25.3■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 ALDH2P05091 517 aa25.3■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 ZNF23P17027 643 aa25.3■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 CR2P20023 1033 aa25.3■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 TRAF2Q12933 501 aa25.3■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 LETMD1Q6P1Q0 360 aa25.3■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 SMPD4Q9NXE4 827 aa25.3■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 OR6C75A6NL08 312 aa25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 VPS26AO75436 327 aa25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 LPOP22079 712 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 CA5AP35218 305 aa25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 RPS6KA3P51812 740 aa25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 TWF1Q12792 350 aa25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 RCAN2Q14206 197 aa25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 LCN8Q6JVE9 175 aa25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 MYRFLQ96LU7 910 aa25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 ADI1Q9BV57 179 aa25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 DNMT3LQ9UJW3 386 aa25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 ANKRD36A6QL64 1941 aa25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 AQP12BA6NM10 295 aa25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 ANKRD66B4E2M5 251 aa25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 E5RI56 91 aa25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 E2F3O00716 465 aa25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 CNPP09543 421 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 PIK3CGP48736 1102 aa25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 ALG1LQ6GMV1 187 aa25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 NANOGP8Q6NSW7 305 aa25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 Q6ZSR9 355 aa25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 AQP12AQ8IXF9 295 aa25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 DBF4BQ8NFT6 615 aa25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 PPM1MQ96MI6 270 aa25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 NANOGQ9H9S0 305 aa25.29■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 STX7O15400 261 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 COCHO43405 550 aa25.28■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa25.28■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 DGKQP52824 942 aa25.28■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 SELPLGQ14242 412 aa25.28■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 C6orf136Q5SQH8 315 aa25.28■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 KDELR3O43731 214 aa25.28■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 PRR35P0CG20 571 aa25.28■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 OR4D2P58180 307 aa25.28■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 IL2P60568 153 aa25.28■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 PRMT9Q6P2P2 845 aa25.28■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa25.28■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 PROKR1Q8TCW9 393 aa25.28■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 FRMPD3Q5JV73 1810 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 SYCE1LA8MT33 242 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 ACOX3O15254 700 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 TRMUO75648 421 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 GUCA1CO95843 209 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 F11P03951 625 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 ALPIP09923 528 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 UROSP10746 265 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 CCT8P50990 548 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 MERTKQ12866 999 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 TGFBIQ15582 683 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 XKR7Q5GH72 579 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 LPCAT2Q7L5N7 544 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 CAMK1DQ8IU85 385 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 EID2BQ96D98 161 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 HAUS8Q9BT25 410 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 RNF38Q9H0F5 515 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 ZMYM5Q9UJ78 669 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 GIPC1O14908 333 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 PYGLP06737 847 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 YAP1P46937 504 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 SLC11A2P49281 568 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 CDH4P55283 916 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 MTPNP58546 118 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 TBPL2Q6SJ96 375 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.642e-6■■■■■ 54.9
RAB40C-201ENST00000248139 TRIM15Q9C019 465 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 COMMD10Q9Y6G5 202 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB40C-201ENST00000248139 CAPN1P07384 714 aa25.26■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 ARF5P84085 180 aa25.26■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 BNIP2Q12982 314 aa25.26■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 PLCL1Q15111 1095 aa25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms