RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 DMWDQ09019 674 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
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CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKHG6Q3KR16 790 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 PITRM1Q5JRX3 1037 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM151AQ8N4L1 468 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 NETO2Q8NC67 525 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 OR51B4Q9Y5P0 310 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 H0Y858 1186 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
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CAPNS1-201ENST00000246533 OR1E1P30953 314 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 IL12RB1P42701 662 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 STX5Q13190 355 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 ANGPT1Q15389 498 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 CHPFQ8IZ52 775 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 METTL25Q8N6Q8 603 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 CATSPER2Q96P56 530 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 FEM1AQ9BSK4 669 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 C8BP07358 591 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 CXCL12P48061 93 aa26.11■■□□□ 1.77
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CAPNS1-201ENST00000246533 PRPSAP1Q14558 356 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF234Q14588 700 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 LILRA2Q8N149 483 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFP28Q8NHY6 868 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R14BQ96C90 147 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 HDAC11Q96DB2 347 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 PKP2Q99959 881 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 OSBPL11Q9BXB4 747 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 MTG2Q9H4K7 406 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 CAB39LQ9H9S4 337 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC39A10Q9ULF5 831 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 NEMP1O14524 444 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC166P0CW27 439 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 HLA-EP13747 358 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 COL9A1P20849 921 aa26.1■■□□□ 1.77
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF33AQ06730 810 aa26.1■■□□□ 1.77
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CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA1211LQ6NV74 962 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 OR7D4Q8NG98 312 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 CEP70Q8NHQ1 597 aa26.1■■□□□ 1.77
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CAPNS1-201ENST00000246533 CEP41Q9BYV8 373 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 NUF2Q9BZD4 464 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 SDK1Q7Z5N4 2213 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 TARM1B6A8C7 271 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 K7ESF4 209 aa26.1■■□□□ 1.77
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CAPNS1-201ENST00000246533 DLG2Q15700 870 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 MYLK3Q32MK0 819 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 NUDT18Q6ZVK8 323 aa26.1■■□□□ 1.77
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CAPNS1-201ENST00000246533 MYO19Q96H55 970 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF597Q96LX8 424 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 GRIP2Q9C0E4 1043 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 MMP17Q9ULZ9 603 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC160A6NGH7 325 aa26.09■■□□□ 1.77
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CAPNS1-201ENST00000246533 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
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CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJB13P59910 316 aa26.09■■□□□ 1.77
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CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D25Q3MII6 688 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 SYT13Q7L8C5 426 aa26.09■■□□□ 1.77
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CAPNS1-201ENST00000246533 MFSD3Q96ES6 412 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 SCYL1Q96KG9 808 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 SARDHQ9UL12 918 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 ACOT9Q9Y305 439 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 AK5Q9Y6K8 562 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNK1O00180 336 aa26.08■■□□□ 1.77
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