RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 NANOGQ9H9S0 305 aa17.96■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa17.96■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 COMMD10Q9Y6G5 202 aa17.96■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 TSPAN12O95859 305 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 C1QCP02747 245 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 TCF3P15923 654 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 DNAJB1P25685 340 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 RPL26P61254 145 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 MERTKQ12866 999 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 PMS2P3Q13401 168 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 BEND5Q7L4P6 421 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 STAG3L4Q8TBR4 150 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 TRMOQ9BU70 441 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 BOCQ9BWV1 1114 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 PDFQ9HBH1 243 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 PNPLA3Q9NST1 481 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 TAS2R13Q9NYV9 303 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 K7ERQ8 282 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 OAZ2O95190 189 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 TYMPP19971 482 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 HRH2P25021 359 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 FASP25445 335 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 ENTPD1P49961 510 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 GNA12Q03113 381 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 Q6ZSR9 355 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 TMEM126BQ8IUX1 230 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 KIAA1191Q96A73 305 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 EID2BQ96D98 161 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 TBCDQ9BTW9 1192 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 ANKRD60Q9BZ19 345 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 TM6SF2Q9BZW4 377 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 FBXO44Q9H4M3 255 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 PCTPQ9UKL6 214 aa17.95■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 MTMR11A4FU01 709 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 CCDC154A6NI56 674 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 INSIG1O15503 277 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 CA12O43570 354 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 KERAO60938 352 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 FGF1P05230 155 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 G6PDP11413 515 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 BMP2P12643 396 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 ATF6P18850 670 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 KCNK10P57789 538 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 TWF1Q12792 350 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 PTGR1Q14914 329 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 SLC22A15Q8IZD6 547 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 ANKFN1Q8N957 763 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 ABCD2Q9UBJ2 740 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 F5H5T6 163 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 CLOCKO15516 846 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 ATE1O95260 518 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 NDST3O95803 873 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 CAPN1P07384 714 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 FGF4P08620 206 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 CCT8P50990 548 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 USP41Q3LFD5 358 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 IL27RAQ6UWB1 636 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 TMEM26Q6ZUK4 368 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 MILR1Q7Z6M3 343 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 PROKR1Q8TCW9 393 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 BIRC7Q96CA5 298 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 FEM1CQ96JP0 617 aa17.94■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 DRGXA6NNA5 263 aa17.93■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 ATP6V1G1O75348 118 aa17.93■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 IL10P22301 178 aa17.93■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 EMP3P54852 163 aa17.93■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 NFKB2Q00653 900 aa17.93■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 HMGCS1Q01581 520 aa17.93■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 RAD51Q06609 339 aa17.93■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 C6orf136Q5SQH8 315 aa17.93■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 SFRP1Q8N474 314 aa17.93■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 ROPN1LQ96C74 230 aa17.93■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 ITCHQ96J02 903 aa17.93■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 MYRFLQ96LU7 910 aa17.93■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 ZNF711Q9Y462 761 aa17.93■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 RAI2Q9Y5P3 530 aa17.93■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 FADS3Q9Y5Q0 445 aa17.93■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 VCANP13611 3396 aa17.93■□□□□ 0.46
PANX1-201ENST00000227638 SLC22A3O75751 556 aa17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 209.7 ms