RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 LCP2Q13094 533 aa23.69■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 SHHQ15465 462 aa23.69■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 DUSP6Q16828 381 aa23.69■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 TCEAL5Q5H9L2 206 aa23.69■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 ULK2Q8IYT8 1036 aa23.69■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 FRS2Q8WU20 508 aa23.69■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 NAT14Q8WUY8 206 aa23.69■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa23.69■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 PRSS21Q9Y6M0 314 aa23.69■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 KLK8O60259 260 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 GPC4O75487 556 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 DGKAP23743 735 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 ST8SIA6P61647 398 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 ARSIQ5FYB1 569 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 MYO1HQ8N1T3 1032 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 RSPRY1Q96DX4 576 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 RTKNQ9BST9 563 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF385DQ9H6B1 395 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 PKD2L2Q9NZM6 624 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 ANKRD12Q6UB98 2062 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 AZIN1O14977 448 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 CRCPO75575 148 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 LMNAP02545 664 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 FGF4P08620 206 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 C1SP09871 688 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 GM2AP17900 193 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 NSG1P42857 185 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 MACC1Q6ZN28 852 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 SNX32Q86XE0 403 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 BPIFB1Q8TDL5 484 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 ULK4Q96C45 1275 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 C19orf60Q96EN9 201 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 COPS8Q99627 209 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 NUDT4Q9NZJ9 180 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 IL36AQ9UHA7 158 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 WASF2Q9Y6W5 498 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 LAMA3Q16787 3333 aa23.68■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 AGAP14A8MT82 685 aa23.67■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 PEX11AO75192 247 aa23.67■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 NFATC1O95644 943 aa23.67■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 RPS17P08708 135 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF30P17039 623 aa23.67■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 XPAP23025 273 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 SPINT3P49223 89 aa23.67■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 TGFBIQ15582 683 aa23.67■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa23.67■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 FBXO48Q5FWF7 155 aa23.67■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM78AQ5JUQ0 283 aa23.67■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 NPAS3Q8IXF0 933 aa23.67■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa23.67■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 ZBTB26Q9HCK0 441 aa23.67■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 L3MBTL1Q9Y468 752 aa23.67■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 C2orf16Q68DN1 1984 aa23.67■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 PPP6CO00743 305 aa23.66■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 UBDO15205 165 aa23.66■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 S100BP04271 92 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 CISD3P0C7P0 127 aa23.66■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 FSHRP23945 695 aa23.66■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 ZBTB2Q8N680 514 aa23.66■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 CLPTM1LQ96KA5 538 aa23.66■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa23.66■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa23.66■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 GIPC1O14908 333 aa23.66■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 TULP3O75386 442 aa23.66■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 VIPR1P32241 457 aa23.66■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 PBX2P40425 430 aa23.66■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 HK3P52790 923 aa23.66■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 E2F5Q15329 346 aa23.66■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 TTLL9Q3SXZ7 439 aa23.66■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 C12orf40Q86WS4 652 aa23.66■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 PELI3Q8N2H9 469 aa23.66■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa23.66■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 SMARCD2Q92925 531 aa23.66■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 STMN2Q93045 179 aa23.66■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 ASB16Q96NS5 453 aa23.66■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 MLYCDO95822 493 aa23.65■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 AGTR2P50052 363 aa23.65■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 HERC3Q15034 1050 aa23.65■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 RFLNAQ6ZTI6 216 aa23.65■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 WDR60Q8WVS4 1066 aa23.65■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 LRIG1Q96JA1 1093 aa23.65■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 PANX3Q96QZ0 392 aa23.65■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 EBF3Q9H4W6 596 aa23.65■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 PCTPQ9UKL6 214 aa23.65■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa23.65■■□□□ 1.38
RPUSD1-201ENST00000007264 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms