RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gdf7P43029 461 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MtpnP62774 118 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdh6P97326 790 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gdpgp1Q3TLS3 386 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Krt2Q3TTY5 707 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Brms1lQ3U1T3 323 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrgprb1Q3UG61 350 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Thrap3Q569Z6 951 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TsnQ62348 228 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tatdn1Q6P8M1 295 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bend6Q6PFX2 281 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdc14bQ6PFY9 485 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hmgxb4Q80Y32 594 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fut11Q8BHC9 489 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rdh12Q8BYK4 316 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slfn5Q8CBA2 884 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ifi205aQ8CGE8 404 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zbtb6Q8K088 423 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 BfarQ8R079 450 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hid1Q8R1F6 788 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpn2Q8VEJ1 310 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr801Q8VEU1 318 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NlnQ91YP2 704 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 EedQ921E6 441 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf639Q99KZ6 485 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gstt3Q99L20 241 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gins4Q99LZ3 223 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ist1Q9CX00 362 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem53Q9D0Z3 276 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rpl34Q9D1R9 117 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kif12Q9D2Z8 642 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dlgap1Q9D415 992 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q9D9D9 101 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp3a44Q9EQW4 504 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MkksQ9JI70 570 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trpc5Q9QX29 975 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Numa1E9Q7G0 2094 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Usp34Q6ZQ93 3582 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4930558K02RikE0CXC6 182 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp2c69E9PXC3 491 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmigd3G3X8R9 209 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 B020004C17RikJ3QP07 232 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r54K7N649 806 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Polr2jO08740 117 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ctnnd2O35927 1247 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dkk1O54908 272 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Igf2bp1O88477 577 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ApoeP08226 311 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp2c40P56657 491 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Serpinb5P70124 375 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sap25Q1EHW4 186 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 KrtdapQ3V2T4 102 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tead4Q62296 427 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ddx51Q6P9R1 639 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eif2s1Q6ZWX6 315 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prickle2Q80Y24 845 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 B3gnt5Q8BGY6 376 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pdcd2lQ8C5N5 364 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nox1Q8CIZ9 591 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 IlkapQ8R0F6 392 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tspan33Q8R3S2 283 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr330Q8VGD9 315 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Setd7Q8VHL1 366 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Paip2bQ91W45 136 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lactb2Q99KR3 288 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Scd3Q99PL7 359 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AasdhpptQ9CQF6 309 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Serpinb11Q9CQV3 388 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem9Q9CR23 183 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Art4Q9CRA0 300 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ribc2Q9D4Q1 309 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spesp1Q9D5A0 399 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SgshQ9EQ08 502 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pias4Q9JM05 507 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Epb41l4bQ9JMC8 527 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trpm7Q923J1 1863 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm13040A2A8C4 496 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Man1b1A2AJ15 658 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Itga8A2ARA8 1062 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lgr4A2ARI4 951 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm13101A2ASJ0 481 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm13119B1ARV5 481 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc28a1E9PXX9 648 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r86G5E8Y4 848 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc153P0C7Q1 202 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Etv4P28322 485 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SykP48025 629 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mex3cQ05A36 652 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NkaplQ5SZT7 395 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rbbp7Q60973 425 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rbl1Q64701 1063 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pex11gQ6P6M5 241 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dpy19l3Q71B07 716 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ofcc1Q8BGX4 166 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DglucyQ8BH86 617 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smarcal1Q8BJL0 910 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppp1r1cQ8BKK4 108 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lacc1Q8BZT9 430 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppp1r8Q8R3G1 351 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Usb1Q91W78 267 aa6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.6 ms