RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000642034.1

MFSD8-258, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-258	ENST00000642034	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	TECPR2	O15040	1411 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	RIPK4	P57078	832 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	KIF3B	O15066	747 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	RLBP1	P12271	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	SCN7A	Q01118	1682 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	GGT6	Q6P531	493 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	JPH4	Q96JJ6	628 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	MCC	P23508	829 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	RILPL2	Q969X0	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	KCNJ4	P48050	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	SYCE3	A1L190	88 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	DSG3	P32926	999 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	NUCB2	P80303	420 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	A2M	P01023	1474 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	TSPOAP1	O95153	1857 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	CBX1	P83916	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	ZNF592	Q92610	1267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	PLCH2	O75038	1416 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	HMOX1	P09601	288 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	MAP7D2	Q96T17	732 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	CDC45	O75419	566 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	CAPN15	O75808	1086 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	NEK4	P51957	841 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	NGEF	Q8N5V2	710 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	SPC24	Q8NBT2	197 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	FAM177B	A6PVY3	158 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	CABP2	Q9NPB3	220 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	TRIM27	P14373	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	AAMP	Q13685	434 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	CCDC27	Q2M243	656 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	KANK1	Q14678	1352 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	TESK2	Q96S53	571 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	IGSF3	O75054	1194 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	PHF14	O94880	888 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	NECTIN2	Q92692	538 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	TSPY26P	Q9H489	355 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MFSD8-258	ENST00000642034	KIF16B	Q96L93	1317 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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