RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 HOXC9P31274 260 aa23.33■■□□□ 1.33
CLN8-211ENST00000636934 NBR1Q14596 966 aa23.33■■□□□ 1.33
CLN8-211ENST00000636934 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CLN8-211ENST00000636934 NUCB1Q02818 461 aa23.32■■□□□ 1.32
CLN8-211ENST00000636934 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CLN8-211ENST00000636934 PTPRCP08575 1304 aa23.31■■□□□ 1.32
CLN8-211ENST00000636934 USP19O94966 1318 aa23.31■■□□□ 1.32
CLN8-211ENST00000636934 USP35Q9P2H5 1018 aa23.3■■□□□ 1.32
CLN8-211ENST00000636934 BECN1Q14457 450 aa23.29■■□□□ 1.32
CLN8-211ENST00000636934 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CLN8-211ENST00000636934 C14orf37Q86TY3 774 aa23.27■■□□□ 1.32
CLN8-211ENST00000636934 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.27■■□□□ 1.32
CLN8-211ENST00000636934 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.27■■□□□ 1.32
CLN8-211ENST00000636934 SEC24BO95487 1268 aa23.27■■□□□ 1.32
CLN8-211ENST00000636934 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.27■■□□□ 1.32
CLN8-211ENST00000636934 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.26■■□□□ 1.31
CLN8-211ENST00000636934 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.26■■□□□ 1.31
CLN8-211ENST00000636934 LRRC37A3O60309 1634 aa23.25■■□□□ 1.31
CLN8-211ENST00000636934 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CLN8-211ENST00000636934 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.25■■□□□ 1.31
CLN8-211ENST00000636934 PSME1Q06323 249 aa23.25■■□□□ 1.31
CLN8-211ENST00000636934 NWD1Q149M9 1564 aa23.25■■□□□ 1.31
CLN8-211ENST00000636934 FOXO3O43524 673 aa23.24■■□□□ 1.31
CLN8-211ENST00000636934 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.24■■□□□ 1.31
CLN8-211ENST00000636934 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.24■■□□□ 1.31
CLN8-211ENST00000636934 IP6K1Q92551 441 aa23.23■■□□□ 1.31
CLN8-211ENST00000636934 LTN1O94822 1766 aa23.23■■□□□ 1.31
CLN8-211ENST00000636934 MAP3K5Q99683 1374 aa23.23■■□□□ 1.31
CLN8-211ENST00000636934 NFAT5O94916 1531 aa23.22■■□□□ 1.31
CLN8-211ENST00000636934 KRT24Q2M2I5 525 aa23.21■■□□□ 1.31
CLN8-211ENST00000636934 LNPKQ9C0E8 428 aa23.21■■□□□ 1.31
CLN8-211ENST00000636934 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.21■■□□□ 1.31
CLN8-211ENST00000636934 RGS12O14924 1447 aa23.21■■□□□ 1.31
CLN8-211ENST00000636934 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.31
CLN8-211ENST00000636934 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.2■■□□□ 1.3
CLN8-211ENST00000636934 SLC4A3P48751 1232 aa23.19■■□□□ 1.3
CLN8-211ENST00000636934 SLC4A2P04920 1241 aa23.19■■□□□ 1.3
CLN8-211ENST00000636934 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CLN8-211ENST00000636934 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.18■■□□□ 1.3
CLN8-211ENST00000636934 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
CLN8-211ENST00000636934 STK31Q9BXU1 1019 aa23.18■■□□□ 1.3
CLN8-211ENST00000636934 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.17■■□□□ 1.3
CLN8-211ENST00000636934 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.17■■□□□ 1.3
CLN8-211ENST00000636934 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CLN8-211ENST00000636934 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CLN8-211ENST00000636934 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.16■■□□□ 1.3
CLN8-211ENST00000636934 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CLN8-211ENST00000636934 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.15■■□□□ 1.3
CLN8-211ENST00000636934 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
CLN8-211ENST00000636934 DCTPP1Q9H773 170 aa23.14■■□□□ 1.3
CLN8-211ENST00000636934 KIF1AQ12756 1690 aa23.14■■□□□ 1.29
CLN8-211ENST00000636934 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.14■■□□□ 1.29
CLN8-211ENST00000636934 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.14■■□□□ 1.29
CLN8-211ENST00000636934 MSH6P52701 1360 aa23.13■■□□□ 1.29
CLN8-211ENST00000636934 SLIT3O75094 1523 aa23.13■■□□□ 1.29
CLN8-211ENST00000636934 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CLN8-211ENST00000636934 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CLN8-211ENST00000636934 IL17REQ8NFR9 667 aa23.12■■□□□ 1.29
CLN8-211ENST00000636934 CACNA1FO60840 1977 aa23.11■■□□□ 1.29
CLN8-211ENST00000636934 ATP10DQ9P241 1426 aa23.11■■□□□ 1.29
CLN8-211ENST00000636934 HMMRO75330 724 aa23.1■■□□□ 1.29
CLN8-211ENST00000636934 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CLN8-211ENST00000636934 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CLN8-211ENST00000636934 CEP85Q6P2H3 762 aa23.09■■□□□ 1.29
CLN8-211ENST00000636934 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.07■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.07■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.07■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 NBPF4Q96M43 638 aa23.07■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 ORAI2Q96SN7 254 aa23.07■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.07■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 GCP02774 474 aa23.06■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 NFKBIBQ15653 356 aa23.06■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.06■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.06■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 MST1RQ04912 1400 aa23.06■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 G2E3Q7L622 706 aa23.06■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 MEIS3Q99687 375 aa23.06■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 FLIIQ13045 1269 aa23.05■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.05■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.04■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.04■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.04■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.04■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 NCAPD2Q15021 1401 aa23.04■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 GNAI3P08754 354 aa23.04■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 HOXB7P09629 217 aa23.04■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.04■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.04■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 CDC45O75419 566 aa23.02■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 GNAI2P04899 355 aa23.02■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.02■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.02■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.02■■□□□ 1.28
CLN8-211ENST00000636934 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CLN8-211ENST00000636934 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23.01■■□□□ 1.27
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