RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630951.1

RAB28-208, Transcript of RAB28, member RAS oncogene family, human

TSL 5 BASIC

Gene RAB28, Length 1,679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB28-208	ENST00000630951	MORC1	Q86VD1	984 aa		29.25	■■■□□ 2.27
RAB28-208	ENST00000630951	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	29.24	■■■□□ 2.27
RAB28-208	ENST00000630951	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	29.24	■■■□□ 2.27
RAB28-208	ENST00000630951	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		29.24	■■■□□ 2.27
RAB28-208	ENST00000630951	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	29.23	■■■□□ 2.27
RAB28-208	ENST00000630951	NBPF14	Q5TI25	921 aa		29.23	■■■□□ 2.27
RAB28-208	ENST00000630951	NHS	Q6T4R5	1651 aa		29.23	■■■□□ 2.27
RAB28-208	ENST00000630951	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	29.21	■■■□□ 2.27
RAB28-208	ENST00000630951	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		29.21	■■■□□ 2.27
RAB28-208	ENST00000630951	NCAPD2	Q15021	1401 aa		29.21	■■■□□ 2.27
RAB28-208	ENST00000630951	PROM2	Q8N271	834 aa		29.19	■■■□□ 2.26
RAB28-208	ENST00000630951	EYA1	Q99502	592 aa		29.18	■■■□□ 2.26
RAB28-208	ENST00000630951	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	29.17	■■■□□ 2.26
RAB28-208	ENST00000630951	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		29.17	■■■□□ 2.26
RAB28-208	ENST00000630951	TXNRD1	Q16881	649 aa		29.16	■■■□□ 2.26
RAB28-208	ENST00000630951	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		29.15	■■■□□ 2.26
RAB28-208	ENST00000630951	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		29.15	■■■□□ 2.26
RAB28-208	ENST00000630951	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		29.14	■■■□□ 2.26
RAB28-208	ENST00000630951	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
RAB28-208	ENST00000630951	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	29.11	■■■□□ 2.25	1e-6	■■□□□ 13.8
RAB28-208	ENST00000630951	BTAF1	O14981	1849 aa		29.11	■■■□□ 2.25
RAB28-208	ENST00000630951	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
RAB28-208	ENST00000630951	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		29.09	■■■□□ 2.25
RAB28-208	ENST00000630951	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		29.09	■■■□□ 2.25
RAB28-208	ENST00000630951	CYP27B1	O15528	508 aa		29.09	■■■□□ 2.25
RAB28-208	ENST00000630951	SPG7	Q9UQ90	795 aa		29.09	■■■□□ 2.25
RAB28-208	ENST00000630951	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		29.07	■■■□□ 2.24
RAB28-208	ENST00000630951	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
RAB28-208	ENST00000630951	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
RAB28-208	ENST00000630951	LRP5	O75197	1615 aa		29.07	■■■□□ 2.24
RAB28-208	ENST00000630951	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		29.07	■■■□□ 2.24
RAB28-208	ENST00000630951	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		29.06	■■■□□ 2.24
RAB28-208	ENST00000630951	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
RAB28-208	ENST00000630951	MTHFS	P49914	203 aa		29.02	■■■□□ 2.24
RAB28-208	ENST00000630951	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		29.02	■■■□□ 2.24
RAB28-208	ENST00000630951	STK32B	Q9NY57	414 aa		29.02	■■■□□ 2.24
RAB28-208	ENST00000630951	IL13	P35225	146 aa		29	■■■□□ 2.23
RAB28-208	ENST00000630951	SLC15A2	Q16348	729 aa		29	■■■□□ 2.23
RAB28-208	ENST00000630951	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		28.99	■■■□□ 2.23
RAB28-208	ENST00000630951	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		28.99	■■■□□ 2.23
RAB28-208	ENST00000630951	PHKG2	P15735	406 aa		28.96	■■■□□ 2.23
RAB28-208	ENST00000630951	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		28.95	■■■□□ 2.22
RAB28-208	ENST00000630951	KDR	P35968	1356 aa		28.95	■■■□□ 2.22
RAB28-208	ENST00000630951	PAPPA	Q13219	1627 aa		28.94	■■■□□ 2.22
RAB28-208	ENST00000630951	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		28.94	■■■□□ 2.22
RAB28-208	ENST00000630951	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
RAB28-208	ENST00000630951	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		28.94	■■■□□ 2.22
RAB28-208	ENST00000630951	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		28.93	■■■□□ 2.22
RAB28-208	ENST00000630951	SPON1	Q9HCB6	807 aa		28.93	■■■□□ 2.22
RAB28-208	ENST00000630951	LY75	O60449	1722 aa		28.92	■■■□□ 2.22
RAB28-208	ENST00000630951	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
RAB28-208	ENST00000630951	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		28.91	■■■□□ 2.22
RAB28-208	ENST00000630951	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
RAB28-208	ENST00000630951	CASZ1	Q86V15	1759 aa		28.9	■■■□□ 2.22
RAB28-208	ENST00000630951	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
RAB28-208	ENST00000630951	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
RAB28-208	ENST00000630951	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.21
RAB28-208	ENST00000630951	PIGB	Q92521	554 aa		28.89	■■■□□ 2.21
RAB28-208	ENST00000630951	AKT1S1	Q96B36	256 aa		28.89	■■■□□ 2.21
RAB28-208	ENST00000630951	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
RAB28-208	ENST00000630951	ZNF827	Q17R98	1081 aa		28.88	■■■□□ 2.21
RAB28-208	ENST00000630951	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
RAB28-208	ENST00000630951	ITGB4	P16144	1822 aa		28.88	■■■□□ 2.21
RAB28-208	ENST00000630951	KCNQ4	P56696	695 aa		28.87	■■■□□ 2.21
RAB28-208	ENST00000630951	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		28.86	■■■□□ 2.21
RAB28-208	ENST00000630951	PALLD	Q8WX93	1383 aa		28.86	■■■□□ 2.21
RAB28-208	ENST00000630951	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
RAB28-208	ENST00000630951	DCAF5	Q96JK2	942 aa		28.86	■■■□□ 2.21
RAB28-208	ENST00000630951	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RAB28-208	ENST00000630951	ZBTB7A	O95365	584 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RAB28-208	ENST00000630951	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RAB28-208	ENST00000630951	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
RAB28-208	ENST00000630951	MTFR1L	Q9H019	292 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RAB28-208	ENST00000630951	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RAB28-208	ENST00000630951	HMOX1	P09601	288 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RAB28-208	ENST00000630951	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
RAB28-208	ENST00000630951	CFAP53	Q96M91	514 aa		28.77	■■■□□ 2.2
RAB28-208	ENST00000630951	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		28.77	■■■□□ 2.2
RAB28-208	ENST00000630951	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
RAB28-208	ENST00000630951	PPP2R1A	P30153	589 aa		28.77	■■■□□ 2.2
RAB28-208	ENST00000630951	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
RAB28-208	ENST00000630951	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		28.76	■■■□□ 2.19
RAB28-208	ENST00000630951	PTGER2	P43116	358 aa		28.76	■■■□□ 2.19
RAB28-208	ENST00000630951	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		28.76	■■■□□ 2.19
RAB28-208	ENST00000630951	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		28.76	■■■□□ 2.19
RAB28-208	ENST00000630951	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RAB28-208	ENST00000630951	SIK1	P57059	783 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RAB28-208	ENST00000630951	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RAB28-208	ENST00000630951	ATG3	Q9NT62	314 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RAB28-208	ENST00000630951	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
RAB28-208	ENST00000630951	CABP4	P57796	275 aa		28.74	■■■□□ 2.19
RAB28-208	ENST00000630951	C5	P01031	1676 aa		28.73	■■■□□ 2.19
RAB28-208	ENST00000630951	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		28.71	■■■□□ 2.19
RAB28-208	ENST00000630951	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		28.7	■■■□□ 2.19
RAB28-208	ENST00000630951	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.18
RAB28-208	ENST00000630951	NUDC	Q9Y266	331 aa		28.69	■■■□□ 2.18
RAB28-208	ENST00000630951	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		28.68	■■■□□ 2.18
RAB28-208	ENST00000630951	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		28.68	■■■□□ 2.18
RAB28-208	ENST00000630951	ATP6V1A	P38606	617 aa		28.67	■■■□□ 2.18
RAB28-208	ENST00000630951	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		28.67	■■■□□ 2.18

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