RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPNS1-215	ENST00000628018	MAP3K5	Q99683	1374 aa		32.35	■■■□□ 2.77
CAPNS1-215	ENST00000628018	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		32.35	■■■□□ 2.77
CAPNS1-215	ENST00000628018	GNAI1	P63096	354 aa		32.35	■■■□□ 2.77
CAPNS1-215	ENST00000628018	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
CAPNS1-215	ENST00000628018	CFAP44	Q96MT7	982 aa		32.34	■■■□□ 2.77
CAPNS1-215	ENST00000628018	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		32.33	■■■□□ 2.77
CAPNS1-215	ENST00000628018	CRB1	P82279	1406 aa		32.32	■■■□□ 2.77
CAPNS1-215	ENST00000628018	FKBP8	Q14318	412 aa		32.32	■■■□□ 2.76
CAPNS1-215	ENST00000628018	LRRC37A3	O60309	1634 aa		32.32	■■■□□ 2.76
CAPNS1-215	ENST00000628018	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CAPNS1-215	ENST00000628018	MEGF6	O75095	1541 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CAPNS1-215	ENST00000628018	BTG4	Q9NY30	223 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CAPNS1-215	ENST00000628018	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
CAPNS1-215	ENST00000628018	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
CAPNS1-215	ENST00000628018	EVA1C	P58658	441 aa		32.3	■■■□□ 2.76
CAPNS1-215	ENST00000628018	JCAD	Q9P266	1359 aa		32.29	■■■□□ 2.76
CAPNS1-215	ENST00000628018	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
CAPNS1-215	ENST00000628018	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		32.29	■■■□□ 2.76
CAPNS1-215	ENST00000628018	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
CAPNS1-215	ENST00000628018	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
CAPNS1-215	ENST00000628018	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		32.28	■■■□□ 2.76
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
CAPNS1-215	ENST00000628018	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
CAPNS1-215	ENST00000628018	STRN4	Q9NRL3	753 aa		32.28	■■■□□ 2.76
CAPNS1-215	ENST00000628018	MBIP	Q9NS73	344 aa		32.27	■■■□□ 2.76
CAPNS1-215	ENST00000628018	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	32.27	■■■□□ 2.76
CAPNS1-215	ENST00000628018	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		32.26	■■■□□ 2.76
CAPNS1-215	ENST00000628018	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		32.25	■■■□□ 2.75
CAPNS1-215	ENST00000628018	CHL1	O00533	1208 aa		32.25	■■■□□ 2.75
CAPNS1-215	ENST00000628018	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		32.25	■■■□□ 2.75
CAPNS1-215	ENST00000628018	ADAMTS2	O95450	1211 aa		32.24	■■■□□ 2.75
CAPNS1-215	ENST00000628018	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
CAPNS1-215	ENST00000628018	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
CAPNS1-215	ENST00000628018	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		32.23	■■■□□ 2.75
CAPNS1-215	ENST00000628018	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
CAPNS1-215	ENST00000628018	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
CAPNS1-215	ENST00000628018	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		32.22	■■■□□ 2.75
CAPNS1-215	ENST00000628018	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
CAPNS1-215	ENST00000628018	SPG7	Q9UQ90	795 aa		32.22	■■■□□ 2.75
CAPNS1-215	ENST00000628018	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		32.22	■■■□□ 2.75
CAPNS1-215	ENST00000628018	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.74
CAPNS1-215	ENST00000628018	NRAP	Q86VF7	1730 aa		32.19	■■■□□ 2.74
CAPNS1-215	ENST00000628018	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		32.19	■■■□□ 2.74
CAPNS1-215	ENST00000628018	BCAR3	O75815	825 aa		32.18	■■■□□ 2.74
CAPNS1-215	ENST00000628018	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
CAPNS1-215	ENST00000628018	LGR6	Q9HBX8	967 aa		32.17	■■■□□ 2.74
CAPNS1-215	ENST00000628018	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		32.16	■■■□□ 2.74
CAPNS1-215	ENST00000628018	IL2RB	P14784	551 aa		32.16	■■■□□ 2.74
CAPNS1-215	ENST00000628018	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		32.16	■■■□□ 2.74
CAPNS1-215	ENST00000628018	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		32.16	■■■□□ 2.74
CAPNS1-215	ENST00000628018	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		32.15	■■■□□ 2.74
CAPNS1-215	ENST00000628018	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
CAPNS1-215	ENST00000628018	HSPA1L	P34931	641 aa		32.15	■■■□□ 2.74
CAPNS1-215	ENST00000628018	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		32.15	■■■□□ 2.74
CAPNS1-215	ENST00000628018	SLIT2	O94813	1529 aa		32.14	■■■□□ 2.74
CAPNS1-215	ENST00000628018	PLIN1	O60240	522 aa		32.14	■■■□□ 2.74
CAPNS1-215	ENST00000628018	PHKG2	P15735	406 aa		32.14	■■■□□ 2.74
CAPNS1-215	ENST00000628018	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
CAPNS1-215	ENST00000628018	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		32.13	■■■□□ 2.73
CAPNS1-215	ENST00000628018	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
CAPNS1-215	ENST00000628018	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		32.13	■■■□□ 2.73
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZNF428	Q96B54	188 aa		32.12	■■■□□ 2.73
CAPNS1-215	ENST00000628018	VAMP4	O75379	141 aa		32.11	■■■□□ 2.73
CAPNS1-215	ENST00000628018	TSPYL6	Q8N831	410 aa		32.11	■■■□□ 2.73
CAPNS1-215	ENST00000628018	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		32.11	■■■□□ 2.73
CAPNS1-215	ENST00000628018	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		32.11	■■■□□ 2.73
CAPNS1-215	ENST00000628018	CYP27B1	O15528	508 aa		32.1	■■■□□ 2.73
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
CAPNS1-215	ENST00000628018	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		32.09	■■■□□ 2.73
CAPNS1-215	ENST00000628018	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
CAPNS1-215	ENST00000628018	USP35	Q9P2H5	1018 aa		32.09	■■■□□ 2.73
CAPNS1-215	ENST00000628018	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		32.08	■■■□□ 2.73
CAPNS1-215	ENST00000628018	DISP2	A7MBM2	1401 aa		32.08	■■■□□ 2.73
CAPNS1-215	ENST00000628018	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
CAPNS1-215	ENST00000628018	TEF	Q10587	303 aa		32.07	■■■□□ 2.72
CAPNS1-215	ENST00000628018	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		32.07	■■■□□ 2.72
CAPNS1-215	ENST00000628018	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
CAPNS1-215	ENST00000628018	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		32.07	■■■□□ 2.72
CAPNS1-215	ENST00000628018	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		32.07	■■■□□ 2.72
CAPNS1-215	ENST00000628018	LRP6	O75581	1613 aa		32.06	■■■□□ 2.72
CAPNS1-215	ENST00000628018	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		32.06	■■■□□ 2.72
CAPNS1-215	ENST00000628018	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		32.05	■■■□□ 2.72
CAPNS1-215	ENST00000628018	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
CAPNS1-215	ENST00000628018	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
CAPNS1-215	ENST00000628018	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		32.05	■■■□□ 2.72
CAPNS1-215	ENST00000628018	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		32.04	■■■□□ 2.72
CAPNS1-215	ENST00000628018	DCAF5	Q96JK2	942 aa		32.04	■■■□□ 2.72
CAPNS1-215	ENST00000628018	KRT24	Q2M2I5	525 aa		32.03	■■■□□ 2.72
CAPNS1-215	ENST00000628018	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		32.03	■■■□□ 2.72
CAPNS1-215	ENST00000628018	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		32.03	■■■□□ 2.72
CAPNS1-215	ENST00000628018	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		32.01	■■■□□ 2.72
CAPNS1-215	ENST00000628018	C8orf37	Q96NL8	207 aa		32	■■■□□ 2.71
CAPNS1-215	ENST00000628018	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
CAPNS1-215	ENST00000628018	MRC1	P22897	1456 aa		32	■■■□□ 2.71
CAPNS1-215	ENST00000628018	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
CAPNS1-215	ENST00000628018	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		32	■■■□□ 2.71
CAPNS1-215	ENST00000628018	NGLY1	Q96IV0	654 aa		32	■■■□□ 2.71
CAPNS1-215	ENST00000628018	BTBD11	A6QL63	1104 aa		31.99	■■■□□ 2.71
CAPNS1-215	ENST00000628018	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
CAPNS1-215	ENST00000628018	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms