RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619257.4

PLP1-222, Transcript of proteolipid protein 1, human

TSL 4

Gene PLP1, Length 596 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLP1-222	ENST00000619257	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PLP1-222	ENST00000619257	NHS	Q6T4R5	1651 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PLP1-222	ENST00000619257	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PLP1-222	ENST00000619257	BTAF1	O14981	1849 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PLP1-222	ENST00000619257	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PLP1-222	ENST00000619257	MEGF6	O75095	1541 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PLP1-222	ENST00000619257	TXNRD1	Q16881	649 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PLP1-222	ENST00000619257	MORC1	Q86VD1	984 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PLP1-222	ENST00000619257	POLK	Q9UBT6	870 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PLP1-222	ENST00000619257	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PLP1-222	ENST00000619257	NSD2	O96028	1365 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PLP1-222	ENST00000619257	LRP5	O75197	1615 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PLP1-222	ENST00000619257	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PLP1-222	ENST00000619257	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PLP1-222	ENST00000619257	PROM2	Q8N271	834 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PLP1-222	ENST00000619257	STK32B	Q9NY57	414 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PLP1-222	ENST00000619257	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PLP1-222	ENST00000619257	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PLP1-222	ENST00000619257	EYA1	Q99502	592 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PLP1-222	ENST00000619257	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PLP1-222	ENST00000619257	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PLP1-222	ENST00000619257	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PLP1-222	ENST00000619257	SPG7	Q9UQ90	795 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PLP1-222	ENST00000619257	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PLP1-222	ENST00000619257	SPON1	Q9HCB6	807 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PLP1-222	ENST00000619257	SLC15A2	Q16348	729 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PLP1-222	ENST00000619257	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PLP1-222	ENST00000619257	CYP27B1	O15528	508 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	ITGB4	P16144	1822 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	NCAPD2	Q15021	1401 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	13.5	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	ZBTB7A	O95365	584 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	KCNQ4	P56696	695 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	CASZ1	Q86V15	1759 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	LY75	O60449	1722 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	MTHFS	P49914	203 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	PHKG2	P15735	406 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	ZNF827	Q17R98	1081 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PLP1-222	ENST00000619257	PAPPA	Q13219	1627 aa		13.46	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	AKT1S1	Q96B36	256 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	MTFR1L	Q9H019	292 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	PALLD	Q8WX93	1383 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	IL13	P35225	146 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	PIGB	Q92521	554 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	MSH5	O43196	834 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	C5	P01031	1676 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	DCAF5	Q96JK2	942 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	HMOX1	P09601	288 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	PTGER2	P43116	358 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	CABP4	P57796	275 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PLP1-222	ENST00000619257	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PLP1-222	ENST00000619257	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PLP1-222	ENST00000619257	POLD1	P28340	1107 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PLP1-222	ENST00000619257	SIK1	P57059	783 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PLP1-222	ENST00000619257	AK7	Q96M32	723 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PLP1-222	ENST00000619257	KDR	P35968	1356 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PLP1-222	ENST00000619257	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
PLP1-222	ENST00000619257	CFAP53	Q96M91	514 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PLP1-222	ENST00000619257	ARX	Q96QS3	562 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PLP1-222	ENST00000619257	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PLP1-222	ENST00000619257	ATP6V1A	P38606	617 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PLP1-222	ENST00000619257	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PLP1-222	ENST00000619257	KLHL34	Q8N239	644 aa		13.37	□□□□□ -0.27

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