RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 FAM83GA6ND36 823 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 WDR63Q8IWG1 891 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 TSPY26PQ9H489 355 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 ZDHHC9Q9Y397 364 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 DTNBO60941 627 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM27P14373 513 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 ST7Q9NRC1 585 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 PYCARDQ9ULZ3 195 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 ADCY5O95622 1261 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 IQGAP1P46940 1657 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 EVC2Q86UK5 1308 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 SLFN14P0C7P3 912 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 CAPN2P17655 700 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM57Q8N5G2 664 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 NUCB2P80303 420 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 TAF3Q5VWG9 929 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 V9GYY5 206 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 NINLQ9Y2I6 1382 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 LMOD2Q6P5Q4 547 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 CHD1LQ86WJ1 897 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 TMX1Q9H3N1 280 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 NME9Q86XW9 330 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 CLEC17AQ6ZS10 378 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 SSH1Q8WYL5 1049 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 OGFRQ9NZT2 677 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 ATP7AQ04656 1500 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 NPHP1O15259 732 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 NUCB1Q02818 461 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 TIGD1Q96MW7 591 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 ATAD2Q6PL18 1390 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 ANKRD7Q92527 254 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 ZMYM3Q14202 1370 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 VGFO15240 615 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 TMPOP42166 694 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 CTNNA3Q9UI47 895 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 KLHL34Q8N239 644 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF592Q92610 1267 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 CDK19Q9BWU1 502 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 MYOM1P52179 1685 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 BMP2KLQ5H9B9 411 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 KCNF1Q9H3M0 494 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 DDX19BQ9UMR2 479 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 TERF2Q15554 542 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 PHACTR3Q96KR7 559 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 CEP152O94986 1710 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 ABCA6Q8N139 1617 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 REREQ9P2R6 1566 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 TET3O43151 1660 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC66A2RUB6 948 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRT-211ENST00000618610 AP5Z1O43299 807 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC27Q2M243 656 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRT-211ENST00000618610 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRT-211ENST00000618610 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRT-211ENST00000618610 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRT-211ENST00000618610 RABEP1Q15276 862 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRT-211ENST00000618610 USHBP1Q8N6Y0 703 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRT-211ENST00000618610 RGS22Q8NE09 1264 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRT-211ENST00000618610 FEZ1Q99689 392 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRT-211ENST00000618610 SPTLC3Q9NUV7 552 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRT-211ENST00000618610 TERF2IPQ9NYB0 399 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRT-211ENST00000618610 MYOM2P54296 1465 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRT-211ENST00000618610 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRT-211ENST00000618610 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRT-211ENST00000618610 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRT-211ENST00000618610 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRT-211ENST00000618610 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRT-211ENST00000618610 LRMPQ12912 555 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRT-211ENST00000618610 NPATQ14207 1427 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRT-211ENST00000618610 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRT-211ENST00000618610 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRT-211ENST00000618610 CDC45O75419 566 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRT-211ENST00000618610 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRT-211ENST00000618610 KIAA1524Q8TCG1 905 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRT-211ENST00000618610 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
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