RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616614.4

FMR1-216, Transcript of fragile X mental retardation 1, human

TSL 5

Gene FMR1, Length 1,409 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FMR1-216	ENST00000616614	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		42.87	■■■■■ 4.45
FMR1-216	ENST00000616614	CFAP53	Q96M91	514 aa		42.86	■■■■■ 4.45
FMR1-216	ENST00000616614	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	42.85	■■■■■ 4.45
FMR1-216	ENST00000616614	KDR	P35968	1356 aa		42.82	■■■■■ 4.45
FMR1-216	ENST00000616614	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	42.8	■■■■■ 4.44
FMR1-216	ENST00000616614	HMOX1	P09601	288 aa		42.8	■■■■■ 4.44
FMR1-216	ENST00000616614	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	42.79	■■■■■ 4.44
FMR1-216	ENST00000616614	BCL9	O00512	1426 aa		42.78	■■■■■ 4.44
FMR1-216	ENST00000616614	TRIM37	O94972	964 aa		42.78	■■■■■ 4.44
FMR1-216	ENST00000616614	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		42.77	■■■■■ 4.44
FMR1-216	ENST00000616614	CYP27B1	O15528	508 aa		42.75	■■■■■ 4.43
FMR1-216	ENST00000616614	CCDC125	Q86Z20	511 aa		42.75	■■■■■ 4.43
FMR1-216	ENST00000616614	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		42.73	■■■■■ 4.43
FMR1-216	ENST00000616614	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	42.73	■■■■■ 4.43	2e-7	■■■□□ 15.7
FMR1-216	ENST00000616614	SPG7	Q9UQ90	795 aa		42.71	■■■■■ 4.43
FMR1-216	ENST00000616614	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		42.71	■■■■■ 4.43
FMR1-216	ENST00000616614	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		42.71	■■■■■ 4.43
FMR1-216	ENST00000616614	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		42.7	■■■■■ 4.43
FMR1-216	ENST00000616614	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		42.68	■■■■■ 4.42
FMR1-216	ENST00000616614	NUDC	Q9Y266	331 aa		42.68	■■■■■ 4.42
FMR1-216	ENST00000616614	KCNQ2	O43526	872 aa		42.67	■■■■■ 4.42
FMR1-216	ENST00000616614	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		42.67	■■■■■ 4.42
FMR1-216	ENST00000616614	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	42.64	■■■■■ 4.42
FMR1-216	ENST00000616614	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		42.64	■■■■■ 4.42
FMR1-216	ENST00000616614	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	42.63	■■■■■ 4.42
FMR1-216	ENST00000616614	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	42.63	■■■■■ 4.42
FMR1-216	ENST00000616614	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	42.63	■■■■■ 4.41
FMR1-216	ENST00000616614	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	42.63	■■■■■ 4.41
FMR1-216	ENST00000616614	PHKG2	P15735	406 aa		42.62	■■■■■ 4.41
FMR1-216	ENST00000616614	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		42.62	■■■■■ 4.41
FMR1-216	ENST00000616614	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		42.61	■■■■■ 4.41
FMR1-216	ENST00000616614	SBF2	Q86WG5	1849 aa		42.6	■■■■■ 4.41
FMR1-216	ENST00000616614	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	42.6	■■■■■ 4.41
FMR1-216	ENST00000616614	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	42.59	■■■■■ 4.41
FMR1-216	ENST00000616614	APBA3	O96018	575 aa		42.58	■■■■■ 4.41
FMR1-216	ENST00000616614	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		42.58	■■■■■ 4.41
FMR1-216	ENST00000616614	ANP32C	O43423	234 aa		42.57	■■■■■ 4.41
FMR1-216	ENST00000616614	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	42.56	■■■■■ 4.4
FMR1-216	ENST00000616614	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	42.55	■■■■■ 4.4
FMR1-216	ENST00000616614	PRKAR2B	P31323	418 aa		42.54	■■■■■ 4.4
FMR1-216	ENST00000616614	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	42.54	■■■■■ 4.4
FMR1-216	ENST00000616614	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	42.54	■■■■■ 4.4
FMR1-216	ENST00000616614	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		42.53	■■■■■ 4.4
FMR1-216	ENST00000616614	FCHSD2	O94868	740 aa		42.52	■■■■■ 4.4
FMR1-216	ENST00000616614	BAG6	P46379	1132 aa		42.52	■■■■■ 4.4
FMR1-216	ENST00000616614	NHS	Q6T4R5	1651 aa		42.51	■■■■■ 4.4
FMR1-216	ENST00000616614	CCDC184	Q52MB2	194 aa		42.51	■■■■■ 4.4
FMR1-216	ENST00000616614	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	42.49	■■■■■ 4.39
FMR1-216	ENST00000616614	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		42.47	■■■■■ 4.39
FMR1-216	ENST00000616614	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		42.47	■■■■■ 4.39
FMR1-216	ENST00000616614	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	42.46	■■■■■ 4.39
FMR1-216	ENST00000616614	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		42.45	■■■■■ 4.39
FMR1-216	ENST00000616614	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		42.44	■■■■■ 4.39
FMR1-216	ENST00000616614	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	42.43	■■■■■ 4.38
FMR1-216	ENST00000616614	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		42.43	■■■■■ 4.38
FMR1-216	ENST00000616614	PLSCR1	O15162	318 aa		42.42	■■■■■ 4.38
FMR1-216	ENST00000616614	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		42.42	■■■■■ 4.38
FMR1-216	ENST00000616614	DCAF5	Q96JK2	942 aa		42.42	■■■■■ 4.38
FMR1-216	ENST00000616614	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		42.42	■■■■■ 4.38
FMR1-216	ENST00000616614	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	42.4	■■■■■ 4.38
FMR1-216	ENST00000616614	PROM2	Q8N271	834 aa		42.37	■■■■■ 4.37
FMR1-216	ENST00000616614	PIGB	Q92521	554 aa		42.37	■■■■■ 4.37
FMR1-216	ENST00000616614	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		42.36	■■■■■ 4.37
FMR1-216	ENST00000616614	LGR6	Q9HBX8	967 aa		42.36	■■■■■ 4.37
FMR1-216	ENST00000616614	BTAF1	O14981	1849 aa		42.36	■■■■■ 4.37
FMR1-216	ENST00000616614	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		42.34	■■■■■ 4.37
FMR1-216	ENST00000616614	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		42.32	■■■■■ 4.37
FMR1-216	ENST00000616614	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		42.32	■■■■■ 4.37
FMR1-216	ENST00000616614	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	42.32	■■■■■ 4.37
FMR1-216	ENST00000616614	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		42.29	■■■■■ 4.36
FMR1-216	ENST00000616614	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	42.29	■■■■■ 4.36
FMR1-216	ENST00000616614	MAP3K5	Q99683	1374 aa		42.28	■■■■■ 4.36
FMR1-216	ENST00000616614	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		42.28	■■■■■ 4.36
FMR1-216	ENST00000616614	ITGB4	P16144	1822 aa		42.27	■■■■■ 4.36
FMR1-216	ENST00000616614	TXNRD1	Q16881	649 aa		42.27	■■■■■ 4.36
FMR1-216	ENST00000616614	MRS2	Q9HD23	443 aa		42.27	■■■■■ 4.36
FMR1-216	ENST00000616614	CABP4	P57796	275 aa		42.26	■■■■■ 4.36
FMR1-216	ENST00000616614	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		42.26	■■■■■ 4.36
FMR1-216	ENST00000616614	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	42.26	■■■■■ 4.36
FMR1-216	ENST00000616614	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		42.25	■■■■■ 4.35
FMR1-216	ENST00000616614	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		42.24	■■■■■ 4.35
FMR1-216	ENST00000616614	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	42.22	■■■■■ 4.35
FMR1-216	ENST00000616614	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		42.22	■■■■■ 4.35
FMR1-216	ENST00000616614	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	42.22	■■■■■ 4.35
FMR1-216	ENST00000616614	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		42.22	■■■■■ 4.35
FMR1-216	ENST00000616614	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		42.21	■■■■■ 4.35
FMR1-216	ENST00000616614	NEFM	P07197	916 aa		42.2	■■■■■ 4.35
FMR1-216	ENST00000616614	RREB1	Q92766	1687 aa		42.2	■■■■■ 4.35
FMR1-216	ENST00000616614	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		42.2	■■■■■ 4.35
FMR1-216	ENST00000616614	ATG3	Q9NT62	314 aa		42.2	■■■■■ 4.35
FMR1-216	ENST00000616614	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		42.2	■■■■■ 4.35
FMR1-216	ENST00000616614	NFE2L2	Q16236	605 aa		42.19	■■■■■ 4.34
FMR1-216	ENST00000616614	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		42.19	■■■■■ 4.34
FMR1-216	ENST00000616614	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		42.19	■■■■■ 4.34
FMR1-216	ENST00000616614	PALLD	Q8WX93	1383 aa		42.18	■■■■■ 4.34
FMR1-216	ENST00000616614	KCNQ4	P56696	695 aa		42.18	■■■■■ 4.34
FMR1-216	ENST00000616614	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	42.17	■■■■■ 4.34
FMR1-216	ENST00000616614	MRC1	P22897	1456 aa		42.15	■■■■■ 4.34
FMR1-216	ENST00000616614	DCTN1	Q14203	1278 aa		42.15	■■■■■ 4.34
FMR1-216	ENST00000616614	RUNDC1	Q96C34	613 aa		42.15	■■■■■ 4.34

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