RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613424.4

IRF1-211, Transcript of interferon regulatory factor 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene IRF1, Length 821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1-211ENST00000613424 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.34■■□□□ 1.17
IRF1-211ENST00000613424 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
IRF1-211ENST00000613424 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.32■■□□□ 1.16
IRF1-211ENST00000613424 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
IRF1-211ENST00000613424 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
IRF1-211ENST00000613424 CCDC125Q86Z20 511 aa22.31■■□□□ 1.16
IRF1-211ENST00000613424 HMOX1P09601 288 aa22.3■■□□□ 1.16
IRF1-211ENST00000613424 KDRP35968 1356 aa22.29■■□□□ 1.16
IRF1-211ENST00000613424 TRIM37O94972 964 aa22.29■■□□□ 1.16
IRF1-211ENST00000613424 NUDCQ9Y266 331 aa22.29■■□□□ 1.16
IRF1-211ENST00000613424 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
IRF1-211ENST00000613424 SPG7Q9UQ90 795 aa22.28■■□□□ 1.16
IRF1-211ENST00000613424 BCL9O00512 1426 aa22.27■■□□□ 1.16
IRF1-211ENST00000613424 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.27■■□□□ 1.16
IRF1-211ENST00000613424 CYP27B1O15528 508 aa22.26■■□□□ 1.15
IRF1-211ENST00000613424 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.26■■□□□ 1.15
IRF1-211ENST00000613424 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.26■■□□□ 1.15
IRF1-211ENST00000613424 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
IRF1-211ENST00000613424 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
IRF1-211ENST00000613424 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.25■■□□□ 1.15
IRF1-211ENST00000613424 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.24■■□□□ 1.15
IRF1-211ENST00000613424 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.24■■□□□ 1.15
IRF1-211ENST00000613424 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.24■■□□□ 1.15
IRF1-211ENST00000613424 ANP32CO43423 234 aa22.23■■□□□ 1.15
IRF1-211ENST00000613424 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
IRF1-211ENST00000613424 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
IRF1-211ENST00000613424 SBF2Q86WG5 1849 aa22.22■■□□□ 1.15
IRF1-211ENST00000613424 KCNQ2O43526 872 aa22.22■■□□□ 1.15
IRF1-211ENST00000613424 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.22■■□□□ 1.15
IRF1-211ENST00000613424 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
IRF1-211ENST00000613424 PHKG2P15735 406 aa22.21■■□□□ 1.15
IRF1-211ENST00000613424 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.21■■□□□ 1.15
IRF1-211ENST00000613424 APBA3O96018 575 aa22.2■■□□□ 1.14
IRF1-211ENST00000613424 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
IRF1-211ENST00000613424 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.2■■□□□ 1.14
IRF1-211ENST00000613424 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
IRF1-211ENST00000613424 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.19■■□□□ 1.14
IRF1-211ENST00000613424 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.19■■□□□ 1.14
IRF1-211ENST00000613424 FCHSD2O94868 740 aa22.18■■□□□ 1.14
IRF1-211ENST00000613424 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
IRF1-211ENST00000613424 PRKAR2BP31323 418 aa22.17■■□□□ 1.14
IRF1-211ENST00000613424 BAG6P46379 1132 aa22.17■■□□□ 1.14
IRF1-211ENST00000613424 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
IRF1-211ENST00000613424 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
IRF1-211ENST00000613424 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
IRF1-211ENST00000613424 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.15■■□□□ 1.14
IRF1-211ENST00000613424 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
IRF1-211ENST00000613424 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.15■■□□□ 1.14
IRF1-211ENST00000613424 NHSQ6T4R5 1651 aa22.14■■□□□ 1.13
IRF1-211ENST00000613424 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
IRF1-211ENST00000613424 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.13■■□□□ 1.13
IRF1-211ENST00000613424 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.12■■□□□ 1.13
IRF1-211ENST00000613424 CCDC184Q52MB2 194 aa22.12■■□□□ 1.13
IRF1-211ENST00000613424 DCAF5Q96JK2 942 aa22.12■■□□□ 1.13
IRF1-211ENST00000613424 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.12■■□□□ 1.13
IRF1-211ENST00000613424 PLSCR1O15162 318 aa22.11■■□□□ 1.13
IRF1-211ENST00000613424 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
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IRF1-211ENST00000613424 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.1■■□□□ 1.13
IRF1-211ENST00000613424 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.1■■□□□ 1.13
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IRF1-211ENST00000613424 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.09■■□□□ 1.13
IRF1-211ENST00000613424 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.08■■□□□ 1.13
IRF1-211ENST00000613424 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.08■■□□□ 1.13
IRF1-211ENST00000613424 BTAF1O14981 1849 aa22.08■■□□□ 1.12
IRF1-211ENST00000613424 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
IRF1-211ENST00000613424 PIGBQ92521 554 aa22.07■■□□□ 1.12
IRF1-211ENST00000613424 LGR6Q9HBX8 967 aa22.07■■□□□ 1.12
IRF1-211ENST00000613424 NEFMP07197 916 aa22.06■■□□□ 1.12
IRF1-211ENST00000613424 ITGB4P16144 1822 aa22.06■■□□□ 1.12
IRF1-211ENST00000613424 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.05■■□□□ 1.12
IRF1-211ENST00000613424 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
IRF1-211ENST00000613424 PROM2Q8N271 834 aa22.05■■□□□ 1.12
IRF1-211ENST00000613424 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.05■■□□□ 1.12
IRF1-211ENST00000613424 CABP4P57796 275 aa22.04■■□□□ 1.12
IRF1-211ENST00000613424 MRS2Q9HD23 443 aa22.04■■□□□ 1.12
IRF1-211ENST00000613424 MAP3K5Q99683 1374 aa22.03■■□□□ 1.12
IRF1-211ENST00000613424 TXNRD1Q16881 649 aa22.02■■□□□ 1.12
IRF1-211ENST00000613424 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.02■■□□□ 1.12
IRF1-211ENST00000613424 IL17REQ8NFR9 667 aa22.02■■□□□ 1.12
IRF1-211ENST00000613424 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.02■■□□□ 1.12
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IRF1-211ENST00000613424 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.01■■□□□ 1.11
IRF1-211ENST00000613424 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
IRF1-211ENST00000613424 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.01■■□□□ 1.11
IRF1-211ENST00000613424 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
IRF1-211ENST00000613424 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22■■□□□ 1.11
IRF1-211ENST00000613424 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22■■□□□ 1.11
IRF1-211ENST00000613424 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22■■□□□ 1.11
IRF1-211ENST00000613424 NFE2L2Q16236 605 aa21.99■■□□□ 1.11
IRF1-211ENST00000613424 RUNDC1Q96C34 613 aa21.99■■□□□ 1.11
IRF1-211ENST00000613424 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
IRF1-211ENST00000613424 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
IRF1-211ENST00000613424 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
IRF1-211ENST00000613424 ATG3Q9NT62 314 aa21.98■■□□□ 1.11
IRF1-211ENST00000613424 RREB1Q92766 1687 aa21.98■■□□□ 1.11
IRF1-211ENST00000613424 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.98■■□□□ 1.11
IRF1-211ENST00000613424 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.97■■□□□ 1.11
IRF1-211ENST00000613424 PALLDQ8WX93 1383 aa21.97■■□□□ 1.11
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