RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609445.5

SGMS1-209, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 594 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-209ENST00000609445 INSRP06213 1382 aa22.25■■□□□ 1.15
SGMS1-209ENST00000609445 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-209ENST00000609445 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-209ENST00000609445 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-209ENST00000609445 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-209ENST00000609445 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-209ENST00000609445 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-209ENST00000609445 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-209ENST00000609445 FLT4P35916 1363 aa22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-209ENST00000609445 ZNF827Q17R98 1081 aa22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-209ENST00000609445 PTGER2P43116 358 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-209ENST00000609445 NSD2O96028 1365 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-209ENST00000609445 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.2■■□□□ 1.14
SGMS1-209ENST00000609445 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SGMS1-209ENST00000609445 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-209ENST00000609445 KCNQ4P56696 695 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-209ENST00000609445 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-209ENST00000609445 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-209ENST00000609445 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-209ENST00000609445 LY75O60449 1722 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-209ENST00000609445 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-209ENST00000609445 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-209ENST00000609445 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-209ENST00000609445 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-209ENST00000609445 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-209ENST00000609445 MTFR1LQ9H019 292 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-209ENST00000609445 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.145e-9■■■□□ 17.2
SGMS1-209ENST00000609445 AKT1S1Q96B36 256 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-209ENST00000609445 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-209ENST00000609445 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-209ENST00000609445 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-209ENST00000609445 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-209ENST00000609445 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-209ENST00000609445 POLKQ9UBT6 870 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-209ENST00000609445 NCAPD2Q15021 1401 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-209ENST00000609445 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-209ENST00000609445 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-209ENST00000609445 CYP27B1O15528 508 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-209ENST00000609445 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-209ENST00000609445 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-209ENST00000609445 ITGB4P16144 1822 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-209ENST00000609445 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-209ENST00000609445 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-209ENST00000609445 EYA1Q99502 592 aa22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-209ENST00000609445 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-209ENST00000609445 SYT17Q9BSW7 474 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-209ENST00000609445 PANK3Q9H999 370 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-209ENST00000609445 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-209ENST00000609445 YY1P25490 414 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-209ENST00000609445 ARXQ96QS3 562 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-209ENST00000609445 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.05■■□□□ 1.12
SGMS1-209ENST00000609445 C5P01031 1676 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-209ENST00000609445 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-209ENST00000609445 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-209ENST00000609445 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-209ENST00000609445 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-209ENST00000609445 PALLDQ8WX93 1383 aa22.02■■□□□ 1.12
SGMS1-209ENST00000609445 SPG7Q9UQ90 795 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-209ENST00000609445 PIGBQ92521 554 aa22■■□□□ 1.11
SGMS1-209ENST00000609445 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-209ENST00000609445 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-209ENST00000609445 MSH5O43196 834 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-209ENST00000609445 KLHL34Q8N239 644 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-209ENST00000609445 MAP3K5Q99683 1374 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-209ENST00000609445 POLD1P28340 1107 aa21.97■■□□□ 1.11
SGMS1-209ENST00000609445 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.113e-7■■■■□ 23.1
SGMS1-209ENST00000609445 PHKG2P15735 406 aa21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-209ENST00000609445 MORC1Q86VD1 984 aa21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-209ENST00000609445 C4BP0C0L5 1744 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-209ENST00000609445 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-209ENST00000609445 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-209ENST00000609445 MSL1Q68DK7 614 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-209ENST00000609445 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-209ENST00000609445 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.93■■□□□ 1.1
SGMS1-209ENST00000609445 UTRNP46939 3433 aa21.92■■□□□ 1.1
SGMS1-209ENST00000609445 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.92■■□□□ 1.1
SGMS1-209ENST00000609445 CHD4Q14839 1912 aa21.92■■□□□ 1.1
SGMS1-209ENST00000609445 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.92■■□□□ 1.1
SGMS1-209ENST00000609445 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.91■■□□□ 1.1
SGMS1-209ENST00000609445 SMIM5Q71RC9 77 aa21.91■■□□□ 1.1
SGMS1-209ENST00000609445 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.91■■□□□ 1.1
SGMS1-209ENST00000609445 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.91■■□□□ 1.1
SGMS1-209ENST00000609445 NLGN2Q8NFZ4 835 aa21.9■■□□□ 1.1
SGMS1-209ENST00000609445 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.89■■□□□ 1.09
SGMS1-209ENST00000609445 SIK1P57059 783 aa21.89■■□□□ 1.09
SGMS1-209ENST00000609445 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.89■■□□□ 1.09
SGMS1-209ENST00000609445 AK7Q96M32 723 aa21.89■■□□□ 1.09
SGMS1-209ENST00000609445 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.88■■□□□ 1.09
SGMS1-209ENST00000609445 PHF14O94880 888 aa21.87■■□□□ 1.09
SGMS1-209ENST00000609445 ITPK1Q13572 414 aa21.87■■□□□ 1.09
SGMS1-209ENST00000609445 GPR162Q16538 588 aa21.87■■□□□ 1.09
SGMS1-209ENST00000609445 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SGMS1-209ENST00000609445 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.87■■□□□ 1.09
SGMS1-209ENST00000609445 ATG3Q9NT62 314 aa21.87■■□□□ 1.09
SGMS1-209ENST00000609445 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.87■■□□□ 1.09
SGMS1-209ENST00000609445 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SGMS1-209ENST00000609445 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SGMS1-209ENST00000609445 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SGMS1-209ENST00000609445 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SGMS1-209ENST00000609445 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
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