RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa27■■□□□ 1.91
SGMS1-208ENST00000608287 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27■■□□□ 1.91
SGMS1-208ENST00000608287 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
SGMS1-208ENST00000608287 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
SGMS1-208ENST00000608287 MSH5O43196 834 aa26.98■■□□□ 1.91
SGMS1-208ENST00000608287 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.98■■□□□ 1.91
SGMS1-208ENST00000608287 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
SGMS1-208ENST00000608287 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.97■■□□□ 1.91
SGMS1-208ENST00000608287 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.96■■□□□ 1.91
SGMS1-208ENST00000608287 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
SGMS1-208ENST00000608287 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
SGMS1-208ENST00000608287 FLAD1Q8NFF5 587 aa26.94■■□□□ 1.9
SGMS1-208ENST00000608287 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.93■■□□□ 1.9
SGMS1-208ENST00000608287 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
SGMS1-208ENST00000608287 USP47Q96K76 1375 aa26.93■■□□□ 1.9
SGMS1-208ENST00000608287 ADCY9O60503 1353 aa26.92■■□□□ 1.9
SGMS1-208ENST00000608287 NME9Q86XW9 330 aa26.91■■□□□ 1.9
SGMS1-208ENST00000608287 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
SGMS1-208ENST00000608287 IP6K1Q92551 441 aa26.9■■□□□ 1.9
SGMS1-208ENST00000608287 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
SGMS1-208ENST00000608287 KCNQ4P56696 695 aa26.87■■□□□ 1.89
SGMS1-208ENST00000608287 TESK2Q96S53 571 aa26.87■■□□□ 1.89
SGMS1-208ENST00000608287 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.87■■□□□ 1.89
SGMS1-208ENST00000608287 NSD2O96028 1365 aa26.86■■□□□ 1.89
SGMS1-208ENST00000608287 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
SGMS1-208ENST00000608287 TMC1Q8TDI8 760 aa26.85■■□□□ 1.89
SGMS1-208ENST00000608287 SLC24A1O60721 1099 aa26.84■■□□□ 1.89
SGMS1-208ENST00000608287 C5P01031 1676 aa26.84■■□□□ 1.89
SGMS1-208ENST00000608287 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.84■■□□□ 1.89
SGMS1-208ENST00000608287 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.83■■□□□ 1.89
SGMS1-208ENST00000608287 MSL1Q68DK7 614 aa26.83■■□□□ 1.89
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
SGMS1-208ENST00000608287 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
SGMS1-208ENST00000608287 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.82■■□□□ 1.88
SGMS1-208ENST00000608287 APLP1P51693 650 aa26.81■■□□□ 1.88
SGMS1-208ENST00000608287 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
SGMS1-208ENST00000608287 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.79■■□□□ 1.88
SGMS1-208ENST00000608287 TMF1P82094 1093 aa26.78■■□□□ 1.88
SGMS1-208ENST00000608287 AMPHP49418 695 aa26.77■■□□□ 1.88
SGMS1-208ENST00000608287 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.75■■□□□ 1.87
SGMS1-208ENST00000608287 TAF1LQ8IZX4 1826 aa26.75■■□□□ 1.87
SGMS1-208ENST00000608287 COG3Q96JB2 828 aa26.75■■□□□ 1.87
SGMS1-208ENST00000608287 MEGF6O75095 1541 aa26.75■■□□□ 1.87
SGMS1-208ENST00000608287 A0A1W2PP64 1363 aa26.74■■□□□ 1.87
SGMS1-208ENST00000608287 RTL1A6NKG5 1358 aa26.74■■□□□ 1.87
SGMS1-208ENST00000608287 HOXC9P31274 260 aa26.74■■□□□ 1.87
SGMS1-208ENST00000608287 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.74■■□□□ 1.87
SGMS1-208ENST00000608287 AK7Q96M32 723 aa26.74■■□□□ 1.87
SGMS1-208ENST00000608287 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SGMS1-208ENST00000608287 PALLDQ8WX93 1383 aa26.72■■□□□ 1.87
SGMS1-208ENST00000608287 KIF3CO14782 793 aa26.72■■□□□ 1.87
SGMS1-208ENST00000608287 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
SGMS1-208ENST00000608287 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.71■■□□□ 1.87
SGMS1-208ENST00000608287 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.71■■□□□ 1.87
SGMS1-208ENST00000608287 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.71■■□□□ 1.87
SGMS1-208ENST00000608287 C4BP0C0L5 1744 aa26.7■■□□□ 1.86
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SGMS1-208ENST00000608287 TOMM70O94826 608 aa26.69■■□□□ 1.86
SGMS1-208ENST00000608287 CDCA8Q53HL2 280 aa26.68■■□□□ 1.86
SGMS1-208ENST00000608287 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
SGMS1-208ENST00000608287 SSFA2P28290 1259 aa26.65■■□□□ 1.86
SGMS1-208ENST00000608287 UBR3Q6ZT12 1888 aa26.65■■□□□ 1.86
SGMS1-208ENST00000608287 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.64■■□□□ 1.86
SGMS1-208ENST00000608287 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.63■■□□□ 1.85
SGMS1-208ENST00000608287 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
SGMS1-208ENST00000608287 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SGMS1-208ENST00000608287 NBPF6Q5VWK0 638 aa26.61■■□□□ 1.85
SGMS1-208ENST00000608287 NBPF4Q96M43 638 aa26.61■■□□□ 1.85
SGMS1-208ENST00000608287 PHF14O94880 888 aa26.6■■□□□ 1.85
SGMS1-208ENST00000608287 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.59■■□□□ 1.85
SGMS1-208ENST00000608287 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa26.58■■□□□ 1.85
SGMS1-208ENST00000608287 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.58■■□□□ 1.85
SGMS1-208ENST00000608287 ITGB4P16144 1822 aa26.58■■□□□ 1.84
SGMS1-208ENST00000608287 WDR90Q96KV7 1748 aa26.56■■□□□ 1.84
SGMS1-208ENST00000608287 TGFB2P61812 414 aa26.56■■□□□ 1.84
SGMS1-208ENST00000608287 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
SGMS1-208ENST00000608287 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.56■■□□□ 1.84
SGMS1-208ENST00000608287 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
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SGMS1-208ENST00000608287 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26.54■■□□□ 1.84
SGMS1-208ENST00000608287 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.54■■□□□ 1.84
SGMS1-208ENST00000608287 INSRP06213 1382 aa26.53■■□□□ 1.84
SGMS1-208ENST00000608287 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.53■■□□□ 1.84
SGMS1-208ENST00000608287 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.51■■□□□ 1.83
SGMS1-208ENST00000608287 FLT4P35916 1363 aa26.51■■□□□ 1.83
SGMS1-208ENST00000608287 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.51■■□□□ 1.83
SGMS1-208ENST00000608287 SIK1P57059 783 aa26.51■■□□□ 1.83
SGMS1-208ENST00000608287 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
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SGMS1-208ENST00000608287 KLRG1Q96E93 195 aa26.5■■□□□ 1.83
SGMS1-208ENST00000608287 BCS1LQ9Y276 419 aa26.5■■□□□ 1.83
SGMS1-208ENST00000608287 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.5■■□□□ 1.83
SGMS1-208ENST00000608287 GNPATO15228 680 aa26.49■■□□□ 1.83
SGMS1-208ENST00000608287 CYP27B1O15528 508 aa26.49■■□□□ 1.83
SGMS1-208ENST00000608287 MMP10P09238 476 aa26.49■■□□□ 1.83
SGMS1-208ENST00000608287 AMIGO3Q86WK7 504 aa26.48■■□□□ 1.83
SGMS1-208ENST00000608287 JMYQ8N9B5 988 aa26.48■■□□□ 1.83
SGMS1-208ENST00000608287 PIGBQ92521 554 aa26.48■■□□□ 1.83
SGMS1-208ENST00000608287 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
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