RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599766.5

FCHO1-229, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 3

Gene FCHO1, Length 747 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-229ENST00000599766 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
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FCHO1-229ENST00000599766 NSD2O96028 1365 aa23.96■■□□□ 1.43
FCHO1-229ENST00000599766 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
FCHO1-229ENST00000599766 KCNQ4P56696 695 aa23.96■■□□□ 1.43
FCHO1-229ENST00000599766 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
FCHO1-229ENST00000599766 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.96■■□□□ 1.43
FCHO1-229ENST00000599766 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.94■■□□□ 1.42
FCHO1-229ENST00000599766 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.93■■□□□ 1.42
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FCHO1-229ENST00000599766 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
FCHO1-229ENST00000599766 MEGF6O75095 1541 aa23.91■■□□□ 1.42
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FCHO1-229ENST00000599766 CEP350Q5VT06 3117 aa23.89■■□□□ 1.42
FCHO1-229ENST00000599766 GRIN3BO60391 1043 aa23.89■■□□□ 1.41
FCHO1-229ENST00000599766 AMPHP49418 695 aa23.89■■□□□ 1.41
FCHO1-229ENST00000599766 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.87■■□□□ 1.41
FCHO1-229ENST00000599766 USP47Q96K76 1375 aa23.87■■□□□ 1.41
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FCHO1-229ENST00000599766 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
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FCHO1-229ENST00000599766 C5P01031 1676 aa23.86■■□□□ 1.41
FCHO1-229ENST00000599766 FBLN1P23142 703 aa23.85■■□□□ 1.41
FCHO1-229ENST00000599766 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.84■■□□□ 1.41
FCHO1-229ENST00000599766 TESK2Q96S53 571 aa23.83■■□□□ 1.41
FCHO1-229ENST00000599766 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.82■■□□□ 1.4
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FCHO1-229ENST00000599766 ATP10DQ9P241 1426 aa23.78■■□□□ 1.4
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FCHO1-229ENST00000599766 FYB1O15117 783 aa23.74■■□□□ 1.39
FCHO1-229ENST00000599766 ITGB4P16144 1822 aa23.74■■□□□ 1.39
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FCHO1-229ENST00000599766 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.73■■□□□ 1.39
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FCHO1-229ENST00000599766 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.7■■□□□ 1.38
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FCHO1-229ENST00000599766 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
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FCHO1-229ENST00000599766 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.64■■□□□ 1.38
FCHO1-229ENST00000599766 TMF1P82094 1093 aa23.64■■□□□ 1.37
FCHO1-229ENST00000599766 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
FCHO1-229ENST00000599766 HSPA6P17066 643 aa23.63■■□□□ 1.37
FCHO1-229ENST00000599766 PIGBQ92521 554 aa23.63■■□□□ 1.37
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FCHO1-229ENST00000599766 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
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FCHO1-229ENST00000599766 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.59■■□□□ 1.37
FCHO1-229ENST00000599766 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.58■■□□□ 1.37
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FCHO1-229ENST00000599766 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.58■■□□□ 1.37
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FCHO1-229ENST00000599766 CDCA8Q53HL2 280 aa23.56■■□□□ 1.36
FCHO1-229ENST00000599766 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.55■■□□□ 1.36
FCHO1-229ENST00000599766 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.36
FCHO1-229ENST00000599766 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.54■■□□□ 1.36
FCHO1-229ENST00000599766 GNPATO15228 680 aa23.53■■□□□ 1.36
FCHO1-229ENST00000599766 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.53■■□□□ 1.36
FCHO1-229ENST00000599766 KIF3CO14782 793 aa23.52■■□□□ 1.36
FCHO1-229ENST00000599766 ITPK1Q13572 414 aa23.52■■□□□ 1.36
FCHO1-229ENST00000599766 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.52■■□□□ 1.36
FCHO1-229ENST00000599766 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.52■■□□□ 1.36
FCHO1-229ENST00000599766 ATP6V1AP38606 617 aa23.51■■□□□ 1.35
FCHO1-229ENST00000599766 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.51■■□□□ 1.35
FCHO1-229ENST00000599766 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
FCHO1-229ENST00000599766 EYA1Q99502 592 aa23.5■■□□□ 1.35
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