RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-215ENST00000589825 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
EFTUD2-215ENST00000589825 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.01■■□□□ 1.11
EFTUD2-215ENST00000589825 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.01■■□□□ 1.11
EFTUD2-215ENST00000589825 KCNQ2O43526 872 aa22■■□□□ 1.11
EFTUD2-215ENST00000589825 NUP188Q5SRE5 1749 aa22■■□□□ 1.11
EFTUD2-215ENST00000589825 NHSQ6T4R5 1651 aa21.99■■□□□ 1.11
EFTUD2-215ENST00000589825 MEGF6O75095 1541 aa21.98■■□□□ 1.11
EFTUD2-215ENST00000589825 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
EFTUD2-215ENST00000589825 TXNRD1Q16881 649 aa21.95■■□□□ 1.1
EFTUD2-215ENST00000589825 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.94■■□□□ 1.1
EFTUD2-215ENST00000589825 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.94■■□□□ 1.1
EFTUD2-215ENST00000589825 BTAF1O14981 1849 aa21.92■■□□□ 1.1
EFTUD2-215ENST00000589825 EYA1Q99502 592 aa21.92■■□□□ 1.1
EFTUD2-215ENST00000589825 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
EFTUD2-215ENST00000589825 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
EFTUD2-215ENST00000589825 PROM2Q8N271 834 aa21.91■■□□□ 1.1
EFTUD2-215ENST00000589825 SPG7Q9UQ90 795 aa21.91■■□□□ 1.1
EFTUD2-215ENST00000589825 SHANK3Q9BYB0 1731 aa21.9■■□□□ 1.1
EFTUD2-215ENST00000589825 STK32BQ9NY57 414 aa21.9■■□□□ 1.1
EFTUD2-215ENST00000589825 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
EFTUD2-215ENST00000589825 DOT1LQ8TEK3 1739 aa21.89■■□□□ 1.09
EFTUD2-215ENST00000589825 LRP5O75197 1615 aa21.88■■□□□ 1.09
EFTUD2-215ENST00000589825 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
EFTUD2-215ENST00000589825 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
EFTUD2-215ENST00000589825 NCAPD2Q15021 1401 aa21.86■■□□□ 1.09
EFTUD2-215ENST00000589825 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.84■■□□□ 1.09
EFTUD2-215ENST00000589825 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
EFTUD2-215ENST00000589825 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC15A2Q16348 729 aa21.84■■□□□ 1.09
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.84■■□□□ 1.09
EFTUD2-215ENST00000589825 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.098e-16■□□□□ 9.3
EFTUD2-215ENST00000589825 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.83■■□□□ 1.09
EFTUD2-215ENST00000589825 CYP27B1O15528 508 aa21.83■■□□□ 1.09
EFTUD2-215ENST00000589825 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.82■■□□□ 1.08
EFTUD2-215ENST00000589825 SPON1Q9HCB6 807 aa21.82■■□□□ 1.08
EFTUD2-215ENST00000589825 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.81■■□□□ 1.08
EFTUD2-215ENST00000589825 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.81■■□□□ 1.08
EFTUD2-215ENST00000589825 MTHFSP49914 203 aa21.8■■□□□ 1.08
EFTUD2-215ENST00000589825 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.79■■□□□ 1.08
EFTUD2-215ENST00000589825 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
EFTUD2-215ENST00000589825 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
EFTUD2-215ENST00000589825 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
EFTUD2-215ENST00000589825 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.78■■□□□ 1.08
EFTUD2-215ENST00000589825 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.77■■□□□ 1.08
EFTUD2-215ENST00000589825 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
EFTUD2-215ENST00000589825 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.77■■□□□ 1.08
EFTUD2-215ENST00000589825 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
EFTUD2-215ENST00000589825 PHKG2P15735 406 aa21.76■■□□□ 1.07
EFTUD2-215ENST00000589825 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.76■■□□□ 1.07
EFTUD2-215ENST00000589825 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
EFTUD2-215ENST00000589825 IL13P35225 146 aa21.75■■□□□ 1.07
EFTUD2-215ENST00000589825 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
EFTUD2-215ENST00000589825 LY75O60449 1722 aa21.75■■□□□ 1.07
EFTUD2-215ENST00000589825 ITGB4P16144 1822 aa21.74■■□□□ 1.07
EFTUD2-215ENST00000589825 ZBTB7AO95365 584 aa21.74■■□□□ 1.07
EFTUD2-215ENST00000589825 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.74■■□□□ 1.07
EFTUD2-215ENST00000589825 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
EFTUD2-215ENST00000589825 KCNQ4P56696 695 aa21.73■■□□□ 1.07
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
EFTUD2-215ENST00000589825 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.73■■□□□ 1.07
EFTUD2-215ENST00000589825 CASZ1Q86V15 1759 aa21.73■■□□□ 1.07
EFTUD2-215ENST00000589825 PAPPAQ13219 1627 aa21.73■■□□□ 1.07
EFTUD2-215ENST00000589825 PALLDQ8WX93 1383 aa21.73■■□□□ 1.07
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF827Q17R98 1081 aa21.72■■□□□ 1.07
EFTUD2-215ENST00000589825 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.72■■□□□ 1.07
EFTUD2-215ENST00000589825 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.72■■□□□ 1.07
EFTUD2-215ENST00000589825 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
EFTUD2-215ENST00000589825 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa21.72■■□□□ 1.07
EFTUD2-215ENST00000589825 PIGBQ92521 554 aa21.71■■□□□ 1.07
EFTUD2-215ENST00000589825 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
EFTUD2-215ENST00000589825 AKT1S1Q96B36 256 aa21.7■■□□□ 1.06
EFTUD2-215ENST00000589825 DCAF5Q96JK2 942 aa21.7■■□□□ 1.06
EFTUD2-215ENST00000589825 MTFR1LQ9H019 292 aa21.7■■□□□ 1.06
EFTUD2-215ENST00000589825 CFAP53Q96M91 514 aa21.68■■□□□ 1.06
EFTUD2-215ENST00000589825 KDRP35968 1356 aa21.68■■□□□ 1.06
EFTUD2-215ENST00000589825 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.67■■□□□ 1.06
EFTUD2-215ENST00000589825 HMOX1P09601 288 aa21.67■■□□□ 1.06
EFTUD2-215ENST00000589825 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
EFTUD2-215ENST00000589825 CABP4P57796 275 aa21.66■■□□□ 1.06
EFTUD2-215ENST00000589825 MSH5O43196 834 aa21.65■■□□□ 1.06
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.65■■□□□ 1.06
EFTUD2-215ENST00000589825 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.64■■□□□ 1.06
EFTUD2-215ENST00000589825 C5P01031 1676 aa21.64■■□□□ 1.05
EFTUD2-215ENST00000589825 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.63■■□□□ 1.05
EFTUD2-215ENST00000589825 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.63■■□□□ 1.05
EFTUD2-215ENST00000589825 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.63■■□□□ 1.05
EFTUD2-215ENST00000589825 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.62■■□□□ 1.05
EFTUD2-215ENST00000589825 SIK1P57059 783 aa21.62■■□□□ 1.05
EFTUD2-215ENST00000589825 AK7Q96M32 723 aa21.62■■□□□ 1.05
EFTUD2-215ENST00000589825 ATP6V1AP38606 617 aa21.61■■□□□ 1.05
EFTUD2-215ENST00000589825 PTGER2P43116 358 aa21.61■■□□□ 1.05
EFTUD2-215ENST00000589825 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.61■■□□□ 1.05
EFTUD2-215ENST00000589825 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.61■■□□□ 1.05
EFTUD2-215ENST00000589825 NUDCQ9Y266 331 aa21.61■■□□□ 1.05
EFTUD2-215ENST00000589825 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.6■■□□□ 1.05
EFTUD2-215ENST00000589825 POLD1P28340 1107 aa21.6■■□□□ 1.05
EFTUD2-215ENST00000589825 ATG3Q9NT62 314 aa21.6■■□□□ 1.05
EFTUD2-215ENST00000589825 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.59■■□□□ 1.05
EFTUD2-215ENST00000589825 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
EFTUD2-215ENST00000589825 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms