RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589536.5

GRN-215, Transcript of granulin precursor, human

TSL 3

Gene GRN, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRN-215	ENST00000589536	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		33.93	■■■■□ 3.02
GRN-215	ENST00000589536	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		33.92	■■■■□ 3.02
GRN-215	ENST00000589536	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		33.91	■■■■□ 3.02
GRN-215	ENST00000589536	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		33.91	■■■■□ 3.02
GRN-215	ENST00000589536	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		33.91	■■■■□ 3.02
GRN-215	ENST00000589536	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	33.9	■■■■□ 3.02
GRN-215	ENST00000589536	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		33.9	■■■■□ 3.02
GRN-215	ENST00000589536	NSD2	O96028	1365 aa		33.88	■■■■□ 3.01
GRN-215	ENST00000589536	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	33.88	■■■■□ 3.01
GRN-215	ENST00000589536	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	33.88	■■■■□ 3.01
GRN-215	ENST00000589536	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		33.87	■■■■□ 3.01
GRN-215	ENST00000589536	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		33.87	■■■■□ 3.01
GRN-215	ENST00000589536	ZBTB7A	O95365	584 aa		33.86	■■■■□ 3.01
GRN-215	ENST00000589536	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	33.86	■■■■□ 3.01
GRN-215	ENST00000589536	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		33.85	■■■■□ 3.01
GRN-215	ENST00000589536	NCAPD2	Q15021	1401 aa		33.83	■■■■□ 3.01
GRN-215	ENST00000589536	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	33.83	■■■■□ 3.01
GRN-215	ENST00000589536	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	33.82	■■■■□ 3
GRN-215	ENST00000589536	PTGER2	P43116	358 aa		33.82	■■■■□ 3
GRN-215	ENST00000589536	ZNF827	Q17R98	1081 aa		33.82	■■■■□ 3
GRN-215	ENST00000589536	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		33.81	■■■■□ 3
GRN-215	ENST00000589536	LY75	O60449	1722 aa		33.79	■■■■□ 3
GRN-215	ENST00000589536	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		33.79	■■■■□ 3
GRN-215	ENST00000589536	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	33.78	■■■■□ 3
GRN-215	ENST00000589536	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	33.78	■■■■□ 3
GRN-215	ENST00000589536	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	33.78	■■■■□ 3
GRN-215	ENST00000589536	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		33.78	■■■■□ 3
GRN-215	ENST00000589536	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		33.78	■■■■□ 3
GRN-215	ENST00000589536	MTFR1L	Q9H019	292 aa		33.77	■■■■□ 3
GRN-215	ENST00000589536	AKT1S1	Q96B36	256 aa		33.76	■■■□□ 2.99
GRN-215	ENST00000589536	POLK	Q9UBT6	870 aa		33.76	■■■□□ 2.99
GRN-215	ENST00000589536	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		33.76	■■■□□ 2.99
GRN-215	ENST00000589536	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		33.74	■■■□□ 2.99
GRN-215	ENST00000589536	PANK3	Q9H999	370 aa		33.73	■■■□□ 2.99
GRN-215	ENST00000589536	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		33.73	■■■□□ 2.99
GRN-215	ENST00000589536	CYP27B1	O15528	508 aa		33.71	■■■□□ 2.99
GRN-215	ENST00000589536	KCNQ4	P56696	695 aa		33.71	■■■□□ 2.99
GRN-215	ENST00000589536	EYA1	Q99502	592 aa		33.69	■■■□□ 2.98
GRN-215	ENST00000589536	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		33.69	■■■□□ 2.98
GRN-215	ENST00000589536	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	33.67	■■■□□ 2.98
GRN-215	ENST00000589536	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		33.67	■■■□□ 2.98
GRN-215	ENST00000589536	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	33.66	■■■□□ 2.98
GRN-215	ENST00000589536	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		33.65	■■■□□ 2.98
GRN-215	ENST00000589536	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	33.63	■■■□□ 2.97
GRN-215	ENST00000589536	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	33.61	■■■□□ 2.97
GRN-215	ENST00000589536	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	33.61	■■■□□ 2.97
GRN-215	ENST00000589536	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		33.61	■■■□□ 2.97
GRN-215	ENST00000589536	SPG7	Q9UQ90	795 aa		33.61	■■■□□ 2.97
GRN-215	ENST00000589536	ITGB4	P16144	1822 aa		33.6	■■■□□ 2.97
GRN-215	ENST00000589536	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		33.6	■■■□□ 2.97
GRN-215	ENST00000589536	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	33.6	■■■□□ 2.97
GRN-215	ENST00000589536	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		33.59	■■■□□ 2.97
GRN-215	ENST00000589536	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		33.59	■■■□□ 2.97
GRN-215	ENST00000589536	PALLD	Q8WX93	1383 aa		33.59	■■■□□ 2.97
GRN-215	ENST00000589536	ARX	Q96QS3	562 aa		33.58	■■■□□ 2.97
GRN-215	ENST00000589536	SYT17	Q9BSW7	474 aa		33.58	■■■□□ 2.97
GRN-215	ENST00000589536	C5	P01031	1676 aa		33.57	■■■□□ 2.96
GRN-215	ENST00000589536	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		33.57	■■■□□ 2.96
GRN-215	ENST00000589536	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		33.55	■■■□□ 2.96
GRN-215	ENST00000589536	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		33.55	■■■□□ 2.96
GRN-215	ENST00000589536	MAP3K5	Q99683	1374 aa		33.55	■■■□□ 2.96
GRN-215	ENST00000589536	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		33.53	■■■□□ 2.96
GRN-215	ENST00000589536	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		33.52	■■■□□ 2.96
GRN-215	ENST00000589536	MORC1	Q86VD1	984 aa		33.52	■■■□□ 2.96
GRN-215	ENST00000589536	PIGB	Q92521	554 aa		33.52	■■■□□ 2.96
GRN-215	ENST00000589536	PHKG2	P15735	406 aa		33.51	■■■□□ 2.95
GRN-215	ENST00000589536	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		33.51	■■■□□ 2.95
GRN-215	ENST00000589536	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		33.5	■■■□□ 2.95
GRN-215	ENST00000589536	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
GRN-215	ENST00000589536	YY1	P25490	414 aa		33.48	■■■□□ 2.95
GRN-215	ENST00000589536	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	33.47	■■■□□ 2.95
GRN-215	ENST00000589536	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	33.47	■■■□□ 2.95
GRN-215	ENST00000589536	POLD1	P28340	1107 aa		33.46	■■■□□ 2.95
GRN-215	ENST00000589536	UTRN	P46939	3433 aa		33.46	■■■□□ 2.95
GRN-215	ENST00000589536	C4B	P0C0L5	1744 aa		33.45	■■■□□ 2.95
GRN-215	ENST00000589536	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	33.45	■■■□□ 2.95
GRN-215	ENST00000589536	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		33.44	■■■□□ 2.94
GRN-215	ENST00000589536	MSH5	O43196	834 aa		33.4	■■■□□ 2.94
GRN-215	ENST00000589536	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		33.39	■■■□□ 2.94
GRN-215	ENST00000589536	SIK1	P57059	783 aa		33.39	■■■□□ 2.94
GRN-215	ENST00000589536	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		33.39	■■■□□ 2.94
GRN-215	ENST00000589536	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		33.39	■■■□□ 2.94
GRN-215	ENST00000589536	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	33.37	■■■□□ 2.93
GRN-215	ENST00000589536	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		33.37	■■■□□ 2.93
GRN-215	ENST00000589536	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		33.37	■■■□□ 2.93
GRN-215	ENST00000589536	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		33.36	■■■□□ 2.93
GRN-215	ENST00000589536	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
GRN-215	ENST00000589536	KDR	P35968	1356 aa		33.35	■■■□□ 2.93
GRN-215	ENST00000589536	IL13	P35225	146 aa		33.35	■■■□□ 2.93
GRN-215	ENST00000589536	AK7	Q96M32	723 aa		33.35	■■■□□ 2.93
GRN-215	ENST00000589536	ATG3	Q9NT62	314 aa		33.35	■■■□□ 2.93
GRN-215	ENST00000589536	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	33.35	■■■□□ 2.93
GRN-215	ENST00000589536	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
GRN-215	ENST00000589536	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		33.34	■■■□□ 2.93
GRN-215	ENST00000589536	KLHL34	Q8N239	644 aa		33.34	■■■□□ 2.93
GRN-215	ENST00000589536	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		33.34	■■■□□ 2.93
GRN-215	ENST00000589536	DCAF5	Q96JK2	942 aa		33.34	■■■□□ 2.93
GRN-215	ENST00000589536	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		33.33	■■■□□ 2.93
GRN-215	ENST00000589536	MSL1	Q68DK7	614 aa		33.33	■■■□□ 2.93
GRN-215	ENST00000589536	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	33.33	■■■□□ 2.93

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