RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589485.5

ILF3-215, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 2

Gene ILF3, Length 620 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-215	ENST00000589485	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		28.23	■■■□□ 2.11
ILF3-215	ENST00000589485	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	28.22	■■■□□ 2.11
ILF3-215	ENST00000589485	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		28.22	■■■□□ 2.11
ILF3-215	ENST00000589485	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		28.21	■■■□□ 2.11
ILF3-215	ENST00000589485	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	28.19	■■■□□ 2.1
ILF3-215	ENST00000589485	KCNQ2	O43526	872 aa		28.19	■■■□□ 2.1
ILF3-215	ENST00000589485	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
ILF3-215	ENST00000589485	PLSCR1	O15162	318 aa		28.18	■■■□□ 2.1
ILF3-215	ENST00000589485	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
ILF3-215	ENST00000589485	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
ILF3-215	ENST00000589485	EYA1	Q99502	592 aa		28.17	■■■□□ 2.1
ILF3-215	ENST00000589485	BTAF1	O14981	1849 aa		28.16	■■■□□ 2.1
ILF3-215	ENST00000589485	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	28.16	■■■□□ 2.1
ILF3-215	ENST00000589485	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		28.15	■■■□□ 2.1
ILF3-215	ENST00000589485	NCAPD2	Q15021	1401 aa		28.15	■■■□□ 2.1
ILF3-215	ENST00000589485	NBPF14	Q5TI25	921 aa		28.14	■■■□□ 2.1
ILF3-215	ENST00000589485	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	28.13	■■■□□ 2.09
ILF3-215	ENST00000589485	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		28.13	■■■□□ 2.09
ILF3-215	ENST00000589485	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		28.13	■■■□□ 2.09
ILF3-215	ENST00000589485	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		28.12	■■■□□ 2.09
ILF3-215	ENST00000589485	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	28.11	■■■□□ 2.09
ILF3-215	ENST00000589485	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		28.1	■■■□□ 2.09
ILF3-215	ENST00000589485	SPG7	Q9UQ90	795 aa		28.09	■■■□□ 2.09
ILF3-215	ENST00000589485	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
ILF3-215	ENST00000589485	TXNRD1	Q16881	649 aa		28.07	■■■□□ 2.08
ILF3-215	ENST00000589485	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		28.07	■■■□□ 2.08
ILF3-215	ENST00000589485	MTHFS	P49914	203 aa		28.06	■■■□□ 2.08
ILF3-215	ENST00000589485	PROM2	Q8N271	834 aa		28.04	■■■□□ 2.08
ILF3-215	ENST00000589485	CYP27B1	O15528	508 aa		28.03	■■■□□ 2.08
ILF3-215	ENST00000589485	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	28.02	■■■□□ 2.08	9e-9	■■□□□ 11.4
ILF3-215	ENST00000589485	IL13	P35225	146 aa		28	■■■□□ 2.07
ILF3-215	ENST00000589485	ITGB4	P16144	1822 aa		27.98	■■■□□ 2.07
ILF3-215	ENST00000589485	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		27.98	■■■□□ 2.07
ILF3-215	ENST00000589485	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
ILF3-215	ENST00000589485	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		27.98	■■■□□ 2.07
ILF3-215	ENST00000589485	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		27.98	■■■□□ 2.07
ILF3-215	ENST00000589485	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		27.97	■■■□□ 2.07
ILF3-215	ENST00000589485	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		27.97	■■■□□ 2.07
ILF3-215	ENST00000589485	STK32B	Q9NY57	414 aa		27.97	■■■□□ 2.07
ILF3-215	ENST00000589485	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
ILF3-215	ENST00000589485	LRP5	O75197	1615 aa		27.96	■■■□□ 2.07
ILF3-215	ENST00000589485	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
ILF3-215	ENST00000589485	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		27.95	■■■□□ 2.06
ILF3-215	ENST00000589485	PHKG2	P15735	406 aa		27.94	■■■□□ 2.06
ILF3-215	ENST00000589485	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
ILF3-215	ENST00000589485	LY75	O60449	1722 aa		27.94	■■■□□ 2.06
ILF3-215	ENST00000589485	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ILF3-215	ENST00000589485	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ILF3-215	ENST00000589485	KDR	P35968	1356 aa		27.91	■■■□□ 2.06
ILF3-215	ENST00000589485	SLC15A2	Q16348	729 aa		27.91	■■■□□ 2.06
ILF3-215	ENST00000589485	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
ILF3-215	ENST00000589485	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		27.91	■■■□□ 2.06
ILF3-215	ENST00000589485	PAPPA	Q13219	1627 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ILF3-215	ENST00000589485	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ILF3-215	ENST00000589485	HMOX1	P09601	288 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ILF3-215	ENST00000589485	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
ILF3-215	ENST00000589485	CFAP53	Q96M91	514 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ILF3-215	ENST00000589485	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
ILF3-215	ENST00000589485	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
ILF3-215	ENST00000589485	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ILF3-215	ENST00000589485	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ILF3-215	ENST00000589485	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
ILF3-215	ENST00000589485	KCNQ4	P56696	695 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ILF3-215	ENST00000589485	CASZ1	Q86V15	1759 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ILF3-215	ENST00000589485	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
ILF3-215	ENST00000589485	PIGB	Q92521	554 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ILF3-215	ENST00000589485	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
ILF3-215	ENST00000589485	PALLD	Q8WX93	1383 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ILF3-215	ENST00000589485	PPP2R1A	P30153	589 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ILF3-215	ENST00000589485	DCAF5	Q96JK2	942 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ILF3-215	ENST00000589485	ZNF827	Q17R98	1081 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ILF3-215	ENST00000589485	SPON1	Q9HCB6	807 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ILF3-215	ENST00000589485	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
ILF3-215	ENST00000589485	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
ILF3-215	ENST00000589485	C5	P01031	1676 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ILF3-215	ENST00000589485	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		27.79	■■■□□ 2.04
ILF3-215	ENST00000589485	AKT1S1	Q96B36	256 aa		27.79	■■■□□ 2.04
ILF3-215	ENST00000589485	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
ILF3-215	ENST00000589485	NUDC	Q9Y266	331 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ILF3-215	ENST00000589485	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ILF3-215	ENST00000589485	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ILF3-215	ENST00000589485	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		27.77	■■■□□ 2.04
ILF3-215	ENST00000589485	ZBTB7A	O95365	584 aa		27.77	■■■□□ 2.04
ILF3-215	ENST00000589485	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		27.77	■■■□□ 2.04
ILF3-215	ENST00000589485	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		27.76	■■■□□ 2.03
ILF3-215	ENST00000589485	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
ILF3-215	ENST00000589485	CABP4	P57796	275 aa		27.76	■■■□□ 2.03
ILF3-215	ENST00000589485	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		27.76	■■■□□ 2.03
ILF3-215	ENST00000589485	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		27.75	■■■□□ 2.03
ILF3-215	ENST00000589485	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
ILF3-215	ENST00000589485	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
ILF3-215	ENST00000589485	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
ILF3-215	ENST00000589485	ATG3	Q9NT62	314 aa		27.72	■■■□□ 2.03
ILF3-215	ENST00000589485	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
ILF3-215	ENST00000589485	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		27.71	■■■□□ 2.03
ILF3-215	ENST00000589485	SIK1	P57059	783 aa		27.71	■■■□□ 2.03
ILF3-215	ENST00000589485	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
ILF3-215	ENST00000589485	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	27.7	■■■□□ 2.02
ILF3-215	ENST00000589485	MTFR1L	Q9H019	292 aa		27.7	■■■□□ 2.02
ILF3-215	ENST00000589485	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		27.69	■■■□□ 2.02

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