RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 CABP2Q9NPB3 220 aa16.13■□□□□ 0.17
GGA3-217ENST00000583667 PLEKHG3A1L390 1219 aa16.12■□□□□ 0.17
GGA3-217ENST00000583667 TOMM70O94826 608 aa16.12■□□□□ 0.17
GGA3-217ENST00000583667 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
GGA3-217ENST00000583667 CCDC184Q52MB2 194 aa16.12■□□□□ 0.17
GGA3-217ENST00000583667 KLRG1Q96E93 195 aa16.12■□□□□ 0.17
GGA3-217ENST00000583667 MRS2Q9HD23 443 aa16.12■□□□□ 0.17
GGA3-217ENST00000583667 CARD10Q9BWT7 1032 aa16.11■□□□□ 0.17
GGA3-217ENST00000583667 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa16.11■□□□□ 0.17
GGA3-217ENST00000583667 TMC1Q8TDI8 760 aa16.1■□□□□ 0.17
GGA3-217ENST00000583667 TERF2IPQ9NYB0 399 aa16.1■□□□□ 0.17
GGA3-217ENST00000583667 CCDC61Q9Y6R9 512 aa16.1■□□□□ 0.17
GGA3-217ENST00000583667 NHSQ6T4R5 1651 aa16.1■□□□□ 0.17
GGA3-217ENST00000583667 ITSN1Q15811 1721 aa16.1■□□□□ 0.17
GGA3-217ENST00000583667 NSD2O96028 1365 aa16.1■□□□□ 0.17
GGA3-217ENST00000583667 USP6P35125 1406 aa16.1■□□□□ 0.17
GGA3-217ENST00000583667 HTRA3P83110 453 aa16.09■□□□□ 0.17
GGA3-217ENST00000583667 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
GGA3-217ENST00000583667 WNK3Q9BYP7 1800 aa16.09■□□□□ 0.17
GGA3-217ENST00000583667 INSRP06213 1382 aa16.09■□□□□ 0.17
GGA3-217ENST00000583667 SLC27A3Q5K4L6 730 aa16.08■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 CD2APQ9Y5K6 639 aa16.08■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 PCNTO95613 3336 aa16.08■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 PCDH10Q9P2E7 1040 aa16.07■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 CD163L1Q9NR16 1453 aa16.07■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 QSER1Q2KHR3 1735 aa16.07■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 COL18A1P39060 1754 aa16.06■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 NSD3Q9BZ95 1437 aa16.06■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 CGNL1Q0VF96 1302 aa16.06■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 NLRP6P59044 892 aa16.06■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 WWC3Q9ULE0 1092 aa16.06■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 TNS2Q63HR2 1409 aa16.05■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa16.05■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 PPP2R1AP30153 589 aa16.05■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 KCNQ4P56696 695 aa16.05■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 CABP1Q9NZU7 370 aa16.05■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 A0A1W2PP64 1363 aa16.04■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 BTAF1O14981 1849 aa16.03■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 MSH5O43196 834 aa16.03■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 WDR90Q96KV7 1748 aa16.02■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 MSL1Q68DK7 614 aa16.02■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 ARHGEF25Q86VW2 580 aa16.02■□□□□ 0.16
GGA3-217ENST00000583667 SLIT3O75094 1523 aa16.01■□□□□ 0.15
GGA3-217ENST00000583667 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa16■□□□□ 0.15
GGA3-217ENST00000583667 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa16■□□□□ 0.15
GGA3-217ENST00000583667 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
GGA3-217ENST00000583667 NMRK2Q9NPI5 230 aa15.99■□□□□ 0.15
GGA3-217ENST00000583667 FYB1O15117 783 aa15.98■□□□□ 0.15
GGA3-217ENST00000583667 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
GGA3-217ENST00000583667 MORC1Q86VD1 984 aa15.98■□□□□ 0.15
GGA3-217ENST00000583667 FAM9BQ8IZU0 186 aa15.98■□□□□ 0.15
GGA3-217ENST00000583667 ABCC6O95255 1503 aa15.98■□□□□ 0.15
GGA3-217ENST00000583667 IGSF1Q8N6C5 1336 aa15.97■□□□□ 0.15
GGA3-217ENST00000583667 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
GGA3-217ENST00000583667 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
GGA3-217ENST00000583667 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
GGA3-217ENST00000583667 FSTL1Q12841 308 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-217ENST00000583667 RGPD5Q99666 1765 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-217ENST00000583667 IL2RBP14784 551 aa15.94■□□□□ 0.14
GGA3-217ENST00000583667 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
GGA3-217ENST00000583667 ZBED9Q6R2W3 1325 aa15.94■□□□□ 0.14
GGA3-217ENST00000583667 KCNH5Q8NCM2 988 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-217ENST00000583667 MON2Q7Z3U7 1717 aa15.92■□□□□ 0.14
GGA3-217ENST00000583667 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa15.92■□□□□ 0.14
GGA3-217ENST00000583667 KAT6BQ8WYB5 2073 aa15.92■□□□□ 0.14
GGA3-217ENST00000583667 SOX12O15370 315 aa15.92■□□□□ 0.14
GGA3-217ENST00000583667 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
GGA3-217ENST00000583667 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
GGA3-217ENST00000583667 NLRP2Q9NX02 1062 aa15.91■□□□□ 0.14
GGA3-217ENST00000583667 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
GGA3-217ENST00000583667 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
GGA3-217ENST00000583667 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
GGA3-217ENST00000583667 GGNBP2Q9H3C7 697 aa15.88■□□□□ 0.13
GGA3-217ENST00000583667 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa15.88■□□□□ 0.13
GGA3-217ENST00000583667 TTC21AQ8NDW8 1320 aa15.88■□□□□ 0.13
GGA3-217ENST00000583667 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
GGA3-217ENST00000583667 PIK3C2AO00443 1686 aa15.87■□□□□ 0.13
GGA3-217ENST00000583667 MTHFSP49914 203 aa15.87■□□□□ 0.13
GGA3-217ENST00000583667 KIF20BQ96Q89 1820 aa15.87■□□□□ 0.13
GGA3-217ENST00000583667 NGEFQ8N5V2 710 aa15.86■□□□□ 0.13
GGA3-217ENST00000583667 FLAD1Q8NFF5 587 aa15.86■□□□□ 0.13
GGA3-217ENST00000583667 CFAP53Q96M91 514 aa15.86■□□□□ 0.13
GGA3-217ENST00000583667 ADAMTS8Q9UP79 889 aa15.86■□□□□ 0.13
GGA3-217ENST00000583667 ERBB3P21860 1342 aa15.86■□□□□ 0.13
GGA3-217ENST00000583667 USP31Q70CQ4 1352 aa15.86■□□□□ 0.13
GGA3-217ENST00000583667 LY75O60449 1722 aa15.85■□□□□ 0.13
GGA3-217ENST00000583667 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
GGA3-217ENST00000583667 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
GGA3-217ENST00000583667 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa15.83■□□□□ 0.12
GGA3-217ENST00000583667 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP15.83■□□□□ 0.12
GGA3-217ENST00000583667 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
GGA3-217ENST00000583667 NFAT5O94916 1531 aa15.83■□□□□ 0.12
GGA3-217ENST00000583667 NME9Q86XW9 330 aa15.82■□□□□ 0.12
GGA3-217ENST00000583667 COG3Q96JB2 828 aa15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms