RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576069.5

SPNS3-206, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS3, Length 834 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-206ENST00000576069 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.14■■□□□ 1.78
SPNS3-206ENST00000576069 BAG6P46379 1132 aa26.13■■□□□ 1.77
SPNS3-206ENST00000576069 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.13■■□□□ 1.77
SPNS3-206ENST00000576069 CFAP53Q96M91 514 aa26.12■■□□□ 1.77
SPNS3-206ENST00000576069 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
SPNS3-206ENST00000576069 RALBP1Q15311 655 aa26.11■■□□□ 1.77
SPNS3-206ENST00000576069 SPG7Q9UQ90 795 aa26.11■■□□□ 1.77
SPNS3-206ENST00000576069 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.11■■□□□ 1.77
SPNS3-206ENST00000576069 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.1■■□□□ 1.77
SPNS3-206ENST00000576069 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.1■■□□□ 1.77
SPNS3-206ENST00000576069 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.1■■□□□ 1.77
SPNS3-206ENST00000576069 APBA3O96018 575 aa26.09■■□□□ 1.77
SPNS3-206ENST00000576069 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.09■■□□□ 1.77
SPNS3-206ENST00000576069 KDRP35968 1356 aa26.08■■□□□ 1.77
SPNS3-206ENST00000576069 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
SPNS3-206ENST00000576069 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.06■■□□□ 1.76
SPNS3-206ENST00000576069 CYP27B1O15528 508 aa26.05■■□□□ 1.76
SPNS3-206ENST00000576069 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
SPNS3-206ENST00000576069 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.05■■□□□ 1.76
SPNS3-206ENST00000576069 KCNQ2O43526 872 aa26.04■■□□□ 1.76
SPNS3-206ENST00000576069 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
SPNS3-206ENST00000576069 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.04■■□□□ 1.76
SPNS3-206ENST00000576069 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
SPNS3-206ENST00000576069 SBF2Q86WG5 1849 aa26.04■■□□□ 1.76
SPNS3-206ENST00000576069 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.03■■□□□ 1.76
SPNS3-206ENST00000576069 PLSCR1O15162 318 aa26.03■■□□□ 1.76
SPNS3-206ENST00000576069 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.03■■□□□ 1.76
SPNS3-206ENST00000576069 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.03■■□□□ 1.76
SPNS3-206ENST00000576069 NUDCQ9Y266 331 aa26.03■■□□□ 1.76
SPNS3-206ENST00000576069 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
SPNS3-206ENST00000576069 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.02■■□□□ 1.76
SPNS3-206ENST00000576069 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.02■■□□□ 1.76
SPNS3-206ENST00000576069 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
SPNS3-206ENST00000576069 HMOX1P09601 288 aa26■■□□□ 1.75
SPNS3-206ENST00000576069 PHKG2P15735 406 aa25.99■■□□□ 1.75
SPNS3-206ENST00000576069 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SPNS3-206ENST00000576069 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SPNS3-206ENST00000576069 NHSQ6T4R5 1651 aa25.97■■□□□ 1.75
SPNS3-206ENST00000576069 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SPNS3-206ENST00000576069 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
SPNS3-206ENST00000576069 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
SPNS3-206ENST00000576069 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SPNS3-206ENST00000576069 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SPNS3-206ENST00000576069 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
SPNS3-206ENST00000576069 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.74
SPNS3-206ENST00000576069 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.92■■□□□ 1.74
SPNS3-206ENST00000576069 FCHSD2O94868 740 aa25.91■■□□□ 1.74
SPNS3-206ENST00000576069 DCAF5Q96JK2 942 aa25.91■■□□□ 1.74
SPNS3-206ENST00000576069 PROM2Q8N271 834 aa25.9■■□□□ 1.74
SPNS3-206ENST00000576069 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.9■■□□□ 1.74
SPNS3-206ENST00000576069 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.89■■□□□ 1.74
SPNS3-206ENST00000576069 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.88■■□□□ 1.73
SPNS3-206ENST00000576069 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
SPNS3-206ENST00000576069 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.88■■□□□ 1.73
SPNS3-206ENST00000576069 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.88■■□□□ 1.73
SPNS3-206ENST00000576069 TXNRD1Q16881 649 aa25.88■■□□□ 1.73
SPNS3-206ENST00000576069 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
SPNS3-206ENST00000576069 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.88■■□□□ 1.73
SPNS3-206ENST00000576069 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.86■■□□□ 1.73
SPNS3-206ENST00000576069 PRKAR2BP31323 418 aa25.86■■□□□ 1.73
SPNS3-206ENST00000576069 BTAF1O14981 1849 aa25.86■■□□□ 1.73
SPNS3-206ENST00000576069 PIGBQ92521 554 aa25.85■■□□□ 1.73
SPNS3-206ENST00000576069 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.84■■□□□ 1.73
SPNS3-206ENST00000576069 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.84■■□□□ 1.73
SPNS3-206ENST00000576069 NBPF14Q5TI25 921 aa25.83■■□□□ 1.73
SPNS3-206ENST00000576069 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.83■■□□□ 1.73
SPNS3-206ENST00000576069 RREB1Q92766 1687 aa25.83■■□□□ 1.73
SPNS3-206ENST00000576069 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SPNS3-206ENST00000576069 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.82■■□□□ 1.72
SPNS3-206ENST00000576069 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
SPNS3-206ENST00000576069 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.81■■□□□ 1.72
SPNS3-206ENST00000576069 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
SPNS3-206ENST00000576069 ANP32CO43423 234 aa25.8■■□□□ 1.72
SPNS3-206ENST00000576069 CABP4P57796 275 aa25.8■■□□□ 1.72
SPNS3-206ENST00000576069 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.77■■□□□ 1.72
SPNS3-206ENST00000576069 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
SPNS3-206ENST00000576069 NEFMP07197 916 aa25.77■■□□□ 1.72
SPNS3-206ENST00000576069 LGR6Q9HBX8 967 aa25.77■■□□□ 1.72
SPNS3-206ENST00000576069 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.77■■□□□ 1.72
SPNS3-206ENST00000576069 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.77■■□□□ 1.72
SPNS3-206ENST00000576069 ITGB4P16144 1822 aa25.77■■□□□ 1.72
SPNS3-206ENST00000576069 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
SPNS3-206ENST00000576069 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.76■■□□□ 1.71
SPNS3-206ENST00000576069 PALLDQ8WX93 1383 aa25.76■■□□□ 1.71
SPNS3-206ENST00000576069 MAP3K5Q99683 1374 aa25.75■■□□□ 1.71
SPNS3-206ENST00000576069 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.75■■□□□ 1.71
SPNS3-206ENST00000576069 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
SPNS3-206ENST00000576069 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.74■■□□□ 1.71
SPNS3-206ENST00000576069 ATG3Q9NT62 314 aa25.74■■□□□ 1.71
SPNS3-206ENST00000576069 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
SPNS3-206ENST00000576069 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.74■■□□□ 1.71
SPNS3-206ENST00000576069 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.72■■□□□ 1.71
SPNS3-206ENST00000576069 LY75O60449 1722 aa25.71■■□□□ 1.71
SPNS3-206ENST00000576069 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
SPNS3-206ENST00000576069 IL17REQ8NFR9 667 aa25.71■■□□□ 1.71
SPNS3-206ENST00000576069 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
SPNS3-206ENST00000576069 STK32BQ9NY57 414 aa25.71■■□□□ 1.71
SPNS3-206ENST00000576069 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
SPNS3-206ENST00000576069 SLC15A2Q16348 729 aa25.7■■□□□ 1.7
SPNS3-206ENST00000576069 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.69■■□□□ 1.7
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