RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa9.97□□□□□ -0.81
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF827Q17R98 1081 aa9.96□□□□□ -0.82
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CCNDBP1-212ENST00000567690 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
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CCNDBP1-212ENST00000567690 MAP3K5Q99683 1374 aa9.81□□□□□ -0.84
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CCNDBP1-212ENST00000567690 AMIGO3Q86WK7 504 aa9.81□□□□□ -0.84
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ASAP1Q9ULH1 1129 aa9.81□□□□□ -0.84
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CCNDBP1-212ENST00000567690 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa9.79□□□□□ -0.84
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CCNDBP1-212ENST00000567690 GNPATO15228 680 aa9.78□□□□□ -0.84
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATP6V1AP38606 617 aa9.78□□□□□ -0.84
CCNDBP1-212ENST00000567690 ITPK1Q13572 414 aa9.78□□□□□ -0.84
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CCNDBP1-212ENST00000567690 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CCNDBP1-212ENST00000567690 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CCNDBP1-212ENST00000567690 WWC3Q9ULE0 1092 aa9.78□□□□□ -0.84
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