RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 NBPF14Q5TI25 921 aa23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-211ENST00000567434 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 MORC1Q86VD1 984 aa23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNQ2O43526 872 aa23.36■■□□□ 1.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.34■■□□□ 1.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.34■■□□□ 1.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.34■■□□□ 1.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 BTAF1O14981 1849 aa23.33■■□□□ 1.32
CCNDBP1-211ENST00000567434 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CCNDBP1-211ENST00000567434 EYA1Q99502 592 aa23.32■■□□□ 1.32
CCNDBP1-211ENST00000567434 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.31■■□□□ 1.32
CCNDBP1-211ENST00000567434 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CCNDBP1-211ENST00000567434 TXNRD1Q16881 649 aa23.31■■□□□ 1.32
CCNDBP1-211ENST00000567434 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.3■■□□□ 1.32
CCNDBP1-211ENST00000567434 PROM2Q8N271 834 aa23.3■■□□□ 1.32
CCNDBP1-211ENST00000567434 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.32
CCNDBP1-211ENST00000567434 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.3■■□□□ 1.32
CCNDBP1-211ENST00000567434 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.29■■□□□ 1.32
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPG7Q9UQ90 795 aa23.28■■□□□ 1.32
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.28■■□□□ 1.32
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPON1Q9HCB6 807 aa23.25■■□□□ 1.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYP27B1O15528 508 aa23.24■■□□□ 1.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.23■■□□□ 1.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 STK32BQ9NY57 414 aa23.23■■□□□ 1.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 PAPPAQ13219 1627 aa23.21■■□□□ 1.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC15A2Q16348 729 aa23.19■■□□□ 1.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 MTHFSP49914 203 aa23.18■■□□□ 1.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.18■■□□□ 1.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 LY75O60449 1722 aa23.18■■□□□ 1.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 KDRP35968 1356 aa23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 YY1P25490 414 aa23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 IL13P35225 146 aa23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 CASZ1Q86V15 1759 aa23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.16■■□□□ 1.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.16■■□□□ 1.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.16■■□□□ 1.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 PHKG2P15735 406 aa23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 ITGB4P16144 1822 aa23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.12■■□□□ 1.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.12■■□□□ 1.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 AKT1S1Q96B36 256 aa23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 PALLDQ8WX93 1383 aa23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 DCAF5Q96JK2 942 aa23.09■■□□□ 1.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.09■■□□□ 1.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF827Q17R98 1081 aa23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 PIGBQ92521 554 aa23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZBTB7AO95365 584 aa23.06■■□□□ 1.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 MTFR1LQ9H019 292 aa23.06■■□□□ 1.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 C5P01031 1676 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 CFAP53Q96M91 514 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTGER2P43116 358 aa23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNQ4P56696 695 aa23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.01■■□□□ 1.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 HMOX1P09601 288 aa23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 AKAP4Q5JQC9 854 aa23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.99■■□□□ 1.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.99■■□□□ 1.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 SIK1P57059 783 aa22.99■■□□□ 1.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPP2R1AP30153 589 aa22.98■■□□□ 1.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 CABP4P57796 275 aa22.98■■□□□ 1.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.98■■□□□ 1.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATG3Q9NT62 314 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.97■■□□□ 1.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 C4BP0C0L5 1744 aa22.96■■□□□ 1.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms