RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 MCM10Q7L590 875 aa23.03■■□□□ 1.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 CFAP44Q96MT7 982 aa23.03■■□□□ 1.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.02■■□□□ 1.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.01■■□□□ 1.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 PHLPP1O60346 1717 aa23■■□□□ 1.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 GNAT3A8MTJ3 354 aa23■■□□□ 1.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 CANXP27824 592 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 MBIPQ9NS73 344 aa23■■□□□ 1.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.99■■□□□ 1.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.99■■□□□ 1.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAP3K5Q99683 1374 aa22.99■■□□□ 1.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 CRB1P82279 1406 aa22.99■■□□□ 1.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.98■■□□□ 1.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.98■■□□□ 1.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 PIP4K2BP78356 416 aa22.98■■□□□ 1.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.97■■□□□ 1.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.96■■□□□ 1.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHL1O00533 1208 aa22.96■■□□□ 1.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRRC37A3O60309 1634 aa22.96■■□□□ 1.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.94■■□□□ 1.26
USP3-AS1-208ENST00000560962 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.94■■□□□ 1.26
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.94■■□□□ 1.26
USP3-AS1-208ENST00000560962 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.93■■□□□ 1.26
USP3-AS1-208ENST00000560962 IL17REQ8NFR9 667 aa22.93■■□□□ 1.26
USP3-AS1-208ENST00000560962 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
USP3-AS1-208ENST00000560962 TSPYL6Q8N831 410 aa22.92■■□□□ 1.26
USP3-AS1-208ENST00000560962 PANK1Q8TE04 598 aa22.92■■□□□ 1.26
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDE3AQ14432 1141 aa22.92■■□□□ 1.26
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
USP3-AS1-208ENST00000560962 CERKQ8TCT0 537 aa22.92■■□□□ 1.26
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF428Q96B54 188 aa22.92■■□□□ 1.26
USP3-AS1-208ENST00000560962 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.91■■□□□ 1.26
USP3-AS1-208ENST00000560962 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
USP3-AS1-208ENST00000560962 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
USP3-AS1-208ENST00000560962 TNNQ9UQP3 1299 aa22.91■■□□□ 1.26
USP3-AS1-208ENST00000560962 MEGF6O75095 1541 aa22.9■■□□□ 1.26
USP3-AS1-208ENST00000560962 VAMP4O75379 141 aa22.9■■□□□ 1.26
USP3-AS1-208ENST00000560962 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.9■■□□□ 1.26
USP3-AS1-208ENST00000560962 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
USP3-AS1-208ENST00000560962 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.89■■□□□ 1.25
USP3-AS1-208ENST00000560962 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.89■■□□□ 1.25
USP3-AS1-208ENST00000560962 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
USP3-AS1-208ENST00000560962 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.88■■□□□ 1.25
USP3-AS1-208ENST00000560962 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.88■■□□□ 1.25
USP3-AS1-208ENST00000560962 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.88■■□□□ 1.25
USP3-AS1-208ENST00000560962 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.87■■□□□ 1.25
USP3-AS1-208ENST00000560962 COG6Q9Y2V7 657 aa22.87■■□□□ 1.25
USP3-AS1-208ENST00000560962 EVA1CP58658 441 aa22.87■■□□□ 1.25
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.87■■□□□ 1.25
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.87■■□□□ 1.25
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPG7Q9UQ90 795 aa22.87■■□□□ 1.25
USP3-AS1-208ENST00000560962 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.87■■□□□ 1.25
USP3-AS1-208ENST00000560962 RLBP1P12271 317 aa22.85■■□□□ 1.25
USP3-AS1-208ENST00000560962 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
USP3-AS1-208ENST00000560962 STRN4Q9NRL3 753 aa22.85■■□□□ 1.25
USP3-AS1-208ENST00000560962 BTG4Q9NY30 223 aa22.85■■□□□ 1.25
USP3-AS1-208ENST00000560962 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.85■■□□□ 1.25
USP3-AS1-208ENST00000560962 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
USP3-AS1-208ENST00000560962 KRT24Q2M2I5 525 aa22.85■■□□□ 1.25
USP3-AS1-208ENST00000560962 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
USP3-AS1-208ENST00000560962 LGR6Q9HBX8 967 aa22.85■■□□□ 1.25
USP3-AS1-208ENST00000560962 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.84■■□□□ 1.25
USP3-AS1-208ENST00000560962 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.84■■□□□ 1.25
USP3-AS1-208ENST00000560962 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
USP3-AS1-208ENST00000560962 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
USP3-AS1-208ENST00000560962 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.82■■□□□ 1.24
USP3-AS1-208ENST00000560962 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
USP3-AS1-208ENST00000560962 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRIM27P14373 513 aa22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-208ENST00000560962 PHKG2P15735 406 aa22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-208ENST00000560962 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIF16BQ96L93 1317 aa22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-208ENST00000560962 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-208ENST00000560962 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
USP3-AS1-208ENST00000560962 IL2RBP14784 551 aa22.79■■□□□ 1.24
USP3-AS1-208ENST00000560962 JCADQ9P266 1359 aa22.78■■□□□ 1.24
USP3-AS1-208ENST00000560962 MS4A1P11836 297 aa22.78■■□□□ 1.24
USP3-AS1-208ENST00000560962 TEFQ10587 303 aa22.78■■□□□ 1.24
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADAMTS2O95450 1211 aa22.78■■□□□ 1.24
USP3-AS1-208ENST00000560962 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
USP3-AS1-208ENST00000560962 CYP27B1O15528 508 aa22.77■■□□□ 1.24
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.77■■□□□ 1.24
USP3-AS1-208ENST00000560962 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
USP3-AS1-208ENST00000560962 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
USP3-AS1-208ENST00000560962 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
USP3-AS1-208ENST00000560962 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
USP3-AS1-208ENST00000560962 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
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