RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560243.5

RABGGTA-216, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGGTA-216ENST00000560243 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa15.95■□□□□ 0.14
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RABGGTA-216ENST00000560243 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa15.88■□□□□ 0.13
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RABGGTA-216ENST00000560243 ERVV-2B6SEH9 535 aa15.7■□□□□ 0.1
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RABGGTA-216ENST00000560243 SCN11AQ9UI33 1791 aa15.69■□□□□ 0.1
RABGGTA-216ENST00000560243 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa15.68■□□□□ 0.1
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RABGGTA-216ENST00000560243 ITPK1Q13572 414 aa15.67■□□□□ 0.1
RABGGTA-216ENST00000560243 SMIM5Q71RC9 77 aa15.67■□□□□ 0.1
RABGGTA-216ENST00000560243 AMIGO3Q86WK7 504 aa15.67■□□□□ 0.1
RABGGTA-216ENST00000560243 CFAP53Q96M91 514 aa15.67■□□□□ 0.1
RABGGTA-216ENST00000560243 SGIP1Q9BQI5 828 aa15.67■□□□□ 0.1
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RABGGTA-216ENST00000560243 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
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