RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559997.5

MFGE8-212, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 5

Gene MFGE8, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-212ENST00000559997 IP6K1Q92551 441 aa24.46■■□□□ 1.51
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MFGE8-212ENST00000559997 USP54Q70EL1 1684 aa24.44■■□□□ 1.5
MFGE8-212ENST00000559997 PAPPAQ13219 1627 aa24.44■■□□□ 1.5
MFGE8-212ENST00000559997 AMPHP49418 695 aa24.44■■□□□ 1.5
MFGE8-212ENST00000559997 CHD4Q14839 1912 aa24.43■■□□□ 1.5
MFGE8-212ENST00000559997 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
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MFGE8-212ENST00000559997 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
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MFGE8-212ENST00000559997 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.38■■□□□ 1.49
MFGE8-212ENST00000559997 MSH5O43196 834 aa24.37■■□□□ 1.49
MFGE8-212ENST00000559997 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.37■■□□□ 1.49
MFGE8-212ENST00000559997 HOXC9P31274 260 aa24.36■■□□□ 1.49
MFGE8-212ENST00000559997 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.35■■□□□ 1.49
MFGE8-212ENST00000559997 BTAF1O14981 1849 aa24.35■■□□□ 1.49
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MFGE8-212ENST00000559997 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
MFGE8-212ENST00000559997 RTL1A6NKG5 1358 aa24.32■■□□□ 1.48
MFGE8-212ENST00000559997 FBLN1P23142 703 aa24.31■■□□□ 1.48
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MFGE8-212ENST00000559997 MSL1Q68DK7 614 aa24.3■■□□□ 1.48
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MFGE8-212ENST00000559997 ATP10DQ9P241 1426 aa24.27■■□□□ 1.48
MFGE8-212ENST00000559997 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.27■■□□□ 1.48
MFGE8-212ENST00000559997 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
MFGE8-212ENST00000559997 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
MFGE8-212ENST00000559997 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.27■■□□□ 1.48
MFGE8-212ENST00000559997 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.26■■□□□ 1.47
MFGE8-212ENST00000559997 NSD2O96028 1365 aa24.26■■□□□ 1.47
MFGE8-212ENST00000559997 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
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MFGE8-212ENST00000559997 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
MFGE8-212ENST00000559997 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.23■■□□□ 1.47
MFGE8-212ENST00000559997 FLT4P35916 1363 aa24.23■■□□□ 1.47
MFGE8-212ENST00000559997 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
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MFGE8-212ENST00000559997 INSRP06213 1382 aa24.22■■□□□ 1.47
MFGE8-212ENST00000559997 HSPA6P17066 643 aa24.21■■□□□ 1.47
MFGE8-212ENST00000559997 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.21■■□□□ 1.47
MFGE8-212ENST00000559997 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.21■■□□□ 1.47
MFGE8-212ENST00000559997 NBPF4Q96M43 638 aa24.21■■□□□ 1.47
MFGE8-212ENST00000559997 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
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MFGE8-212ENST00000559997 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.19■■□□□ 1.46
MFGE8-212ENST00000559997 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
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MFGE8-212ENST00000559997 ADCY9O60503 1353 aa24.12■■□□□ 1.45
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MFGE8-212ENST00000559997 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.1■■□□□ 1.45
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MFGE8-212ENST00000559997 SMIM5Q71RC9 77 aa24.09■■□□□ 1.45
MFGE8-212ENST00000559997 AK7Q96M32 723 aa24.09■■□□□ 1.45
MFGE8-212ENST00000559997 POLKQ9UBT6 870 aa24.09■■□□□ 1.45
MFGE8-212ENST00000559997 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.09■■□□□ 1.45
MFGE8-212ENST00000559997 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.09■■□□□ 1.45
MFGE8-212ENST00000559997 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.08■■□□□ 1.45
MFGE8-212ENST00000559997 PHF14O94880 888 aa24.08■■□□□ 1.45
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MFGE8-212ENST00000559997 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.08■■□□□ 1.45
MFGE8-212ENST00000559997 SPG7Q9UQ90 795 aa24.07■■□□□ 1.44
MFGE8-212ENST00000559997 KIF3CO14782 793 aa24.06■■□□□ 1.44
MFGE8-212ENST00000559997 MORC1Q86VD1 984 aa24.06■■□□□ 1.44
MFGE8-212ENST00000559997 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
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MFGE8-212ENST00000559997 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.43
MFGE8-212ENST00000559997 APLP1P51693 650 aa23.99■■□□□ 1.43
MFGE8-212ENST00000559997 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
MFGE8-212ENST00000559997 SSFA2P28290 1259 aa23.98■■□□□ 1.43
MFGE8-212ENST00000559997 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.97■■□□□ 1.43
MFGE8-212ENST00000559997 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.96■■□□□ 1.43
MFGE8-212ENST00000559997 NCAPD2Q15021 1401 aa23.95■■□□□ 1.42
MFGE8-212ENST00000559997 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.95■■□□□ 1.42
MFGE8-212ENST00000559997 SIK1P57059 783 aa23.95■■□□□ 1.42
MFGE8-212ENST00000559997 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.95■■□□□ 1.42
MFGE8-212ENST00000559997 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.95■■□□□ 1.42
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