RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559573.3

FAM227B-208, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, human

TSL 3

Gene FAM227B, Length 2,204 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM227B-208	ENST00000559573	RTL1	A6NKG5	1358 aa		13.66	□□□□□ -0.22
FAM227B-208	ENST00000559573	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		13.66	□□□□□ -0.22
FAM227B-208	ENST00000559573	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		13.66	□□□□□ -0.22
FAM227B-208	ENST00000559573	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
FAM227B-208	ENST00000559573	BCL11A	Q9H165	835 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FAM227B-208	ENST00000559573	CYP27B1	O15528	508 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FAM227B-208	ENST00000559573	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
FAM227B-208	ENST00000559573	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
FAM227B-208	ENST00000559573	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
FAM227B-208	ENST00000559573	APBA3	O96018	575 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM227B-208	ENST00000559573	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
FAM227B-208	ENST00000559573	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAM227B-208	ENST00000559573	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM227B-208	ENST00000559573	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAM227B-208	ENST00000559573	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM227B-208	ENST00000559573	ABCC6	O95255	1503 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM227B-208	ENST00000559573	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM227B-208	ENST00000559573	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM227B-208	ENST00000559573	TNS2	Q63HR2	1409 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM227B-208	ENST00000559573	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
FAM227B-208	ENST00000559573	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
FAM227B-208	ENST00000559573	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
FAM227B-208	ENST00000559573	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM227B-208	ENST00000559573	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
FAM227B-208	ENST00000559573	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM227B-208	ENST00000559573	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM227B-208	ENST00000559573	SBF2	Q86WG5	1849 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM227B-208	ENST00000559573	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	SMIM5	Q71RC9	77 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	PROM2	Q8N271	834 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	PRKAR2B	P31323	418 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	LGR6	Q9HBX8	967 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	PHKG2	P15735	406 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	DCTN1	Q14203	1278 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	NCAPD2	Q15021	1401 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	CFAP53	Q96M91	514 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	NEUROD2	Q15784	382 aa		13.52	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		13.52	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		13.52	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	SPG7	Q9UQ90	795 aa		13.52	□□□□□ -0.24
FAM227B-208	ENST00000559573	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	BAG6	P46379	1132 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	PIGB	Q92521	554 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	BTAF1	O14981	1849 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	KDR	P35968	1356 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	RALBP1	Q15311	655 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC39A6	Q13433	755 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	MCM10	Q7L590	875 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	ITGB4	P16144	1822 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	TXNRD1	Q16881	649 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	ANP32C	O43423	234 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	NUDC	Q9Y266	331 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	NHS	Q6T4R5	1651 aa		13.46	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC125	Q86Z20	511 aa		13.46	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		13.46	□□□□□ -0.25
FAM227B-208	ENST00000559573	KCNQ3	O43525	872 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM227B-208	ENST00000559573	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM227B-208	ENST00000559573	MRS2	Q9HD23	443 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM227B-208	ENST00000559573	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
FAM227B-208	ENST00000559573	CABP4	P57796	275 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM227B-208	ENST00000559573	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM227B-208	ENST00000559573	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
FAM227B-208	ENST00000559573	ATG3	Q9NT62	314 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM227B-208	ENST00000559573	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF827	Q17R98	1081 aa		13.44	□□□□□ -0.26

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