RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.5■■□□□ 1.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.49■■□□□ 1.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.49■■□□□ 1.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.49■■□□□ 1.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.48■■□□□ 1.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP35Q9P2H5 1018 aa22.48■■□□□ 1.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.47■■□□□ 1.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP21Q9UK80 565 aa22.45■■□□□ 1.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.45■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 IL2RBP14784 551 aa22.45■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.45■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.45■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 MEGF6O75095 1541 aa22.44■■□□□ 1.18
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USP3-AS1-201ENST00000558831 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 DCTN1Q14203 1278 aa22.43■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPG7Q9UQ90 795 aa22.43■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 AFF2P51816 1311 aa22.42■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 IL16Q14005 1332 aa22.42■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.42■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 VPS72Q15906 364 aa22.42■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.42■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.42■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.42■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.41■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 MCM10Q7L590 875 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 NEFLP07196 543 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAP3K5Q99683 1374 aa22.39■■□□□ 1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 GNAI1P63096 354 aa22.37■■□□□ 1.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.36■■□□□ 1.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 DISP2A7MBM2 1401 aa22.36■■□□□ 1.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 BARGINQ6ZT62 677 aa22.35■■□□□ 1.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 IFT57Q9NWB7 429 aa22.35■■□□□ 1.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.35■■□□□ 1.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.35■■□□□ 1.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.35■■□□□ 1.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.35■■□□□ 1.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 CFAP44Q96MT7 982 aa22.34■■□□□ 1.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 PHKG2P15735 406 aa22.32■■□□□ 1.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATRNO75882 1429 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 EXOC5O00471 708 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 FKBP8Q14318 412 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYP27B1O15528 508 aa22.3■■□□□ 1.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF853P0CG23 659 aa22.3■■□□□ 1.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 IL17REQ8NFR9 667 aa22.3■■□□□ 1.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 MBIPQ9NS73 344 aa22.3■■□□□ 1.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.3■■□□□ 1.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 DDB1Q16531 1140 aa22.28■■□□□ 1.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.28■■□□□ 1.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 TNS2Q63HR2 1409 aa22.28■■□□□ 1.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 DCAF5Q96JK2 942 aa22.27■■□□□ 1.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 LGR6Q9HBX8 967 aa22.27■■□□□ 1.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.27■■□□□ 1.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHL1O00533 1208 aa22.26■■□□□ 1.15
USP3-AS1-201ENST00000558831 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
USP3-AS1-201ENST00000558831 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.26■■□□□ 1.15
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRRC37A3O60309 1634 aa22.26■■□□□ 1.15
USP3-AS1-201ENST00000558831 GLI3P10071 1580 aa22.25■■□□□ 1.15
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A0G2JS52 829 aa22.25■■□□□ 1.15
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYT1Q01538 1121 aa22.25■■□□□ 1.15
USP3-AS1-201ENST00000558831 TEFQ10587 303 aa22.25■■□□□ 1.15
USP3-AS1-201ENST00000558831 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.25■■□□□ 1.15
USP3-AS1-201ENST00000558831 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.25■■□□□ 1.15
USP3-AS1-201ENST00000558831 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
USP3-AS1-201ENST00000558831 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
USP3-AS1-201ENST00000558831 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
USP3-AS1-201ENST00000558831 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.24■■□□□ 1.15
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