RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557484.5

GABRA5-211, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha5 subunit, humanhuman

TSL 5

Gene GABRA5, Length 506 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5-211ENST00000557484 KAT6BQ8WYB5 2073 aa41.81■■■■■ 4.28
GABRA5-211ENST00000557484 KCNQ2O43526 872 aa41.8■■■■■ 4.28
GABRA5-211ENST00000557484 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
GABRA5-211ENST00000557484 USHBP1Q8N6Y0 703 aa41.8■■■■■ 4.28
GABRA5-211ENST00000557484 NCAPD2Q15021 1401 aa41.79■■■■■ 4.28
GABRA5-211ENST00000557484 NUP188Q5SRE5 1749 aa41.78■■■■■ 4.28
GABRA5-211ENST00000557484 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
GABRA5-211ENST00000557484 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
GABRA5-211ENST00000557484 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
GABRA5-211ENST00000557484 ACSBG1Q96GR2 724 aa41.76■■■■■ 4.28
GABRA5-211ENST00000557484 EYA1Q99502 592 aa41.74■■■■■ 4.27
GABRA5-211ENST00000557484 PROM2Q8N271 834 aa41.72■■■■■ 4.27
GABRA5-211ENST00000557484 SHANK3Q9BYB0 1731 aa41.71■■■■■ 4.27
GABRA5-211ENST00000557484 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
GABRA5-211ENST00000557484 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa41.69■■■■■ 4.27
GABRA5-211ENST00000557484 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa41.69■■■■■ 4.27
GABRA5-211ENST00000557484 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa41.69■■■■■ 4.26
GABRA5-211ENST00000557484 TXNRD1Q16881 649 aa41.69■■■■■ 4.26
GABRA5-211ENST00000557484 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP41.69■■■■■ 4.26
GABRA5-211ENST00000557484 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa41.67■■■■■ 4.26
GABRA5-211ENST00000557484 BTAF1O14981 1849 aa41.65■■■■■ 4.26
GABRA5-211ENST00000557484 SPG7Q9UQ90 795 aa41.64■■■■■ 4.26
GABRA5-211ENST00000557484 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa41.63■■■■■ 4.26
GABRA5-211ENST00000557484 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
GABRA5-211ENST00000557484 LRP5O75197 1615 aa41.61■■■■■ 4.25
GABRA5-211ENST00000557484 IGSF1Q8N6C5 1336 aa41.6■■■■■ 4.25
GABRA5-211ENST00000557484 PKD1L3Q7Z443 1732 aa41.59■■■■■ 4.25
GABRA5-211ENST00000557484 CYP27B1O15528 508 aa41.57■■■■■ 4.25
GABRA5-211ENST00000557484 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
GABRA5-211ENST00000557484 DOT1LQ8TEK3 1739 aa41.55■■■■■ 4.24
GABRA5-211ENST00000557484 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
GABRA5-211ENST00000557484 SLC27A3Q5K4L6 730 aa41.55■■■■■ 4.24
GABRA5-211ENST00000557484 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
GABRA5-211ENST00000557484 STK32BQ9NY57 414 aa41.52■■■■■ 4.24
GABRA5-211ENST00000557484 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.24
GABRA5-211ENST00000557484 MTHFSP49914 203 aa41.5■■■■■ 4.23
GABRA5-211ENST00000557484 SLC15A2Q16348 729 aa41.49■■■■■ 4.23
GABRA5-211ENST00000557484 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP41.48■■■■■ 4.23
GABRA5-211ENST00000557484 IFNL2Q8IZJ0 200 aa41.48■■■■■ 4.23
GABRA5-211ENST00000557484 IL13P35225 146 aa41.47■■■■■ 4.23
GABRA5-211ENST00000557484 AMOTQ4VCS5 1084 aa41.44■■■■■ 4.22
GABRA5-211ENST00000557484 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP41.43■■■■■ 4.22
GABRA5-211ENST00000557484 PHKG2P15735 406 aa41.42■■■■■ 4.22
GABRA5-211ENST00000557484 LRRC4BQ9NT99 713 aa41.42■■■■■ 4.22
GABRA5-211ENST00000557484 KDRP35968 1356 aa41.4■■■■■ 4.22
GABRA5-211ENST00000557484 SPON1Q9HCB6 807 aa41.4■■■■■ 4.22
GABRA5-211ENST00000557484 LY75O60449 1722 aa41.4■■■■■ 4.22
GABRA5-211ENST00000557484 PAPPAQ13219 1627 aa41.38■■■■■ 4.21
GABRA5-211ENST00000557484 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
GABRA5-211ENST00000557484 SULT6B1Q6IMI4 303 aa41.37■■■■■ 4.21
GABRA5-211ENST00000557484 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa41.37■■■■■ 4.21
GABRA5-211ENST00000557484 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
GABRA5-211ENST00000557484 ITGB4P16144 1822 aa41.35■■■■■ 4.21
GABRA5-211ENST00000557484 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
GABRA5-211ENST00000557484 CASZ1Q86V15 1759 aa41.33■■■■■ 4.21
GABRA5-211ENST00000557484 AEBP1Q8IUX7 1158 aa41.32■■■■■ 4.21
GABRA5-211ENST00000557484 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
GABRA5-211ENST00000557484 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa41.32■■■■■ 4.2
GABRA5-211ENST00000557484 AKT1S1Q96B36 256 aa41.31■■■■■ 4.2
GABRA5-211ENST00000557484 PIGBQ92521 554 aa41.3■■■■■ 4.2
GABRA5-211ENST00000557484 DCAF5Q96JK2 942 aa41.3■■■■■ 4.2
GABRA5-211ENST00000557484 ERVV-2B6SEH9 535 aa41.28■■■■■ 4.2
GABRA5-211ENST00000557484 TMOD3Q9NYL9 352 aa41.28■■■■■ 4.2
GABRA5-211ENST00000557484 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
GABRA5-211ENST00000557484 PALLDQ8WX93 1383 aa41.26■■■■■ 4.2
GABRA5-211ENST00000557484 ZNF827Q17R98 1081 aa41.25■■■■■ 4.19
GABRA5-211ENST00000557484 C1orf141Q5JVX7 400 aa41.24■■■■■ 4.19
GABRA5-211ENST00000557484 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
GABRA5-211ENST00000557484 QSER1Q2KHR3 1735 aa41.22■■■■■ 4.19
GABRA5-211ENST00000557484 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
GABRA5-211ENST00000557484 MTFR1LQ9H019 292 aa41.22■■■■■ 4.19
GABRA5-211ENST00000557484 SLC16A10Q8TF71 515 aa41.21■■■■■ 4.19
GABRA5-211ENST00000557484 KCNQ4P56696 695 aa41.2■■■■■ 4.19
GABRA5-211ENST00000557484 CFAP53Q96M91 514 aa41.2■■■■■ 4.19
GABRA5-211ENST00000557484 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa41.19■■■■■ 4.18
GABRA5-211ENST00000557484 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
GABRA5-211ENST00000557484 ZBTB7AO95365 584 aa41.17■■■■■ 4.18
GABRA5-211ENST00000557484 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP41.16■■■■■ 4.18
GABRA5-211ENST00000557484 HMOX1P09601 288 aa41.15■■■■■ 4.18
GABRA5-211ENST00000557484 AKAP4Q5JQC9 854 aa41.14■■■■■ 4.18
GABRA5-211ENST00000557484 PPP2R1AP30153 589 aa41.13■■■■■ 4.17
GABRA5-211ENST00000557484 ASAP1Q9ULH1 1129 aa41.12■■■■■ 4.17
GABRA5-211ENST00000557484 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa41.11■■■■■ 4.17
GABRA5-211ENST00000557484 PTGER2P43116 358 aa41.11■■■■■ 4.17
GABRA5-211ENST00000557484 SIK1P57059 783 aa41.11■■■■■ 4.17
GABRA5-211ENST00000557484 CABP4P57796 275 aa41.11■■■■■ 4.17
GABRA5-211ENST00000557484 ATG3Q9NT62 314 aa41.11■■■■■ 4.17
GABRA5-211ENST00000557484 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa41.11■■■■■ 4.17
GABRA5-211ENST00000557484 TAF1LQ8IZX4 1826 aa41.11■■■■■ 4.17
GABRA5-211ENST00000557484 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
GABRA5-211ENST00000557484 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
GABRA5-211ENST00000557484 C5P01031 1676 aa41.1■■■■■ 4.17
GABRA5-211ENST00000557484 FLAD1Q8NFF5 587 aa41.09■■■■■ 4.17
GABRA5-211ENST00000557484 NUDCQ9Y266 331 aa41.09■■■■■ 4.17
GABRA5-211ENST00000557484 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
GABRA5-211ENST00000557484 SGIP1Q9BQI5 828 aa41.06■■■■■ 4.16
GABRA5-211ENST00000557484 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP41.04■■■■■ 4.16
GABRA5-211ENST00000557484 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa41.03■■■■■ 4.16
GABRA5-211ENST00000557484 SCN11AQ9UI33 1791 aa41.02■■■■■ 4.16
GABRA5-211ENST00000557484 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms