RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556782.5

PRPF39-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF39, Length 645 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-211ENST00000556782 LMTK3Q96Q04 1460 aa8.57□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 AGLP35573 1532 aa8.56□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.56□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.55□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 NCOA2Q15596 1464 aa8.55□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 ATP7AQ04656 1500 aa8.54□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.54□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 MS4A1P11836 297 aa8.54□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa8.53□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 MBD5Q9P267 1494 aa8.53□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 PLXNC1O60486 1568 aa8.52□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 C6orf229H3BNL8 230 aa8.52□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 VSIG8P0DPA2 414 aa8.52□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 NNTQ13423 1086 aa8.52□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 MPNDQ8N594 471 aa8.52□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 CCDC102AQ96A19 550 aa8.52□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.52□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.52□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 MAP3K1Q13233 1512 aa8.52□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa8.51□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 KCNMA1Q12791 1236 aa8.51□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 LINC01559Q495D7 138 aa8.51□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 BAP1Q92560 729 aa8.51□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.51□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 A2MP01023 1474 aa8.51□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 PREX1Q8TCU6 1659 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 FDX1P10109 184 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 PTPRNQ16849 979 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 CCDC141Q6ZP82 1450 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 C3P01024 1663 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 ADGBQ8N7X0 1667 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 CNTLNQ9NXG0 1405 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 SOBPA7XYQ1 873 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 ADH1CP00326 375 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 TIMP2P16035 220 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 CLCN1P35523 988 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 ARHGEF5Q12774 1597 aa8.48□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 HSPA2P54652 639 aa8.48□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 KCNH2Q12809 1159 aa8.48□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 ZNF511Q8NB15 262 aa8.48□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.48□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 MROH2AA6NES4 1674 aa8.48□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa8.47□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 MAN1A2O60476 641 aa8.47□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 ZMYND10O75800 440 aa8.47□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 BARGINQ6ZT62 677 aa8.47□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.47□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 MYOM3Q5VTT5 1437 aa8.46□□□□□ -1.05
PRPF39-211ENST00000556782 MIA2Q96PC5 1412 aa8.46□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.45□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 NPATQ14207 1427 aa8.45□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 MAST1Q9Y2H9 1570 aa8.44□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 ZMYM3Q14202 1370 aa8.44□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 PPFIA3O75145 1194 aa8.43□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 GSK3AP49840 483 aa8.43□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 GGT6Q6P531 493 aa8.43□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.43□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 FAM135AQ9P2D6 1515 aa8.43□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 TSPY4P0CV99 314 aa8.42□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 TSPY10P0CW01 314 aa8.42□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 AMHR2Q16671 573 aa8.42□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.42□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 PRR7Q8TB68 274 aa8.42□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 PTPRKQ15262 1439 aa8.42□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 KDM5DQ9BY66 1539 aa8.42□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 MYO3AQ8NEV4 1616 aa8.42□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 STRCQ7RTU9 1775 aa8.41□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.41□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 GDF11O95390 407 aa8.41□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 ARID5BQ14865 1188 aa8.41□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 DESI1Q6ICB0 168 aa8.41□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 PTPN23Q9H3S7 1636 aa8.4□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 SHANK2Q9UPX8 1470 aa8.4□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 KIF3BO15066 747 aa8.4□□□□□ -1.06
PRPF39-211ENST00000556782 UPP2O95045 317 aa8.4□□□□□ -1.06
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