RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556049.1

PITX2-208, Transcript of paired like homeodomain 2, humanhuman

TSL 2

Gene PITX2, Length 941 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2-208ENST00000556049 AKAP12Q02952 1782 aa13.61□□□□□ -0.23
PITX2-208ENST00000556049 KAT6BQ8WYB5 2073 aa13.61□□□□□ -0.23
PITX2-208ENST00000556049 AMPHP49418 695 aa13.61□□□□□ -0.23
PITX2-208ENST00000556049 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
PITX2-208ENST00000556049 PEAK1Q9H792 1746 aa13.61□□□□□ -0.23
PITX2-208ENST00000556049 RGPD5Q99666 1765 aa13.6□□□□□ -0.23
PITX2-208ENST00000556049 NFAT5O94916 1531 aa13.6□□□□□ -0.23
PITX2-208ENST00000556049 TNS2Q63HR2 1409 aa13.6□□□□□ -0.23
PITX2-208ENST00000556049 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
PITX2-208ENST00000556049 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
PITX2-208ENST00000556049 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
PITX2-208ENST00000556049 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
PITX2-208ENST00000556049 IP6K1Q92551 441 aa13.59□□□□□ -0.23
PITX2-208ENST00000556049 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
PITX2-208ENST00000556049 MTFR1LQ9H019 292 aa13.59□□□□□ -0.23
PITX2-208ENST00000556049 SBF2Q86WG5 1849 aa13.59□□□□□ -0.23
PITX2-208ENST00000556049 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa13.58□□□□□ -0.24
PITX2-208ENST00000556049 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PITX2-208ENST00000556049 ABCC6O95255 1503 aa13.58□□□□□ -0.24
PITX2-208ENST00000556049 A0A1W2PP64 1363 aa13.58□□□□□ -0.24
PITX2-208ENST00000556049 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
PITX2-208ENST00000556049 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa13.56□□□□□ -0.24
PITX2-208ENST00000556049 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
PITX2-208ENST00000556049 MON2Q7Z3U7 1717 aa13.56□□□□□ -0.24
PITX2-208ENST00000556049 CD163L1Q9NR16 1453 aa13.55□□□□□ -0.24
PITX2-208ENST00000556049 WNK3Q9BYP7 1800 aa13.55□□□□□ -0.24
PITX2-208ENST00000556049 PTGER2P43116 358 aa13.55□□□□□ -0.24
PITX2-208ENST00000556049 TMF1P82094 1093 aa13.54□□□□□ -0.24
PITX2-208ENST00000556049 SYT17Q9BSW7 474 aa13.54□□□□□ -0.24
PITX2-208ENST00000556049 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa13.54□□□□□ -0.24
PITX2-208ENST00000556049 POLD1P28340 1107 aa13.53□□□□□ -0.24
PITX2-208ENST00000556049 HOXC9P31274 260 aa13.53□□□□□ -0.24
PITX2-208ENST00000556049 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
PITX2-208ENST00000556049 SLC27A3Q5K4L6 730 aa13.53□□□□□ -0.24
PITX2-208ENST00000556049 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
PITX2-208ENST00000556049 CFAP44Q96MT7 982 aa13.53□□□□□ -0.24
PITX2-208ENST00000556049 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa13.53□□□□□ -0.24
PITX2-208ENST00000556049 MAP3K19Q56UN5 1328 aa13.53□□□□□ -0.24
PITX2-208ENST00000556049 FBLN1P23142 703 aa13.52□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 CDCA8Q53HL2 280 aa13.52□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa13.52□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 TESK2Q96S53 571 aa13.52□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 LTN1O94822 1766 aa13.52□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 GGNBP2Q9H3C7 697 aa13.51□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 GPR162Q16538 588 aa13.5□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 ZNF827Q17R98 1081 aa13.5□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 LRRC4BQ9NT99 713 aa13.5□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 NHSQ6T4R5 1651 aa13.5□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 TATP17735 454 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 KCNQ4P56696 695 aa13.49□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 POLA2Q14181 598 aa13.49□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 SLC16A10Q8TF71 515 aa13.49□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 CASZ1Q86V15 1759 aa13.49□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa13.48□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 USHBP1Q8N6Y0 703 aa13.48□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 FYB1O15117 783 aa13.47□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 NBPF6Q5VWK0 638 aa13.47□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 AKT1S1Q96B36 256 aa13.47□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 NBPF4Q96M43 638 aa13.47□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 MYOM1P52179 1685 aa13.47□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 USP54Q70EL1 1684 aa13.47□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 USP47Q96K76 1375 aa13.46□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 BTAF1O14981 1849 aa13.46□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 CGNL1Q0VF96 1302 aa13.46□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 SGIP1Q9BQI5 828 aa13.46□□□□□ -0.25
PITX2-208ENST00000556049 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
PITX2-208ENST00000556049 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
PITX2-208ENST00000556049 POLR3GLQ9BT43 218 aa13.45□□□□□ -0.26
PITX2-208ENST00000556049 RTL1A6NKG5 1358 aa13.45□□□□□ -0.26
PITX2-208ENST00000556049 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa13.44□□□□□ -0.26
PITX2-208ENST00000556049 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa13.43□□□□□ -0.26
PITX2-208ENST00000556049 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP13.43□□□□□ -0.26
PITX2-208ENST00000556049 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa13.43□□□□□ -0.26
PITX2-208ENST00000556049 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PITX2-208ENST00000556049 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa13.42□□□□□ -0.26
PITX2-208ENST00000556049 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa13.42□□□□□ -0.26
PITX2-208ENST00000556049 MEGF6O75095 1541 aa13.41□□□□□ -0.26
PITX2-208ENST00000556049 FLT4P35916 1363 aa13.41□□□□□ -0.26
PITX2-208ENST00000556049 MSL1Q68DK7 614 aa13.4□□□□□ -0.26
PITX2-208ENST00000556049 FLAD1Q8NFF5 587 aa13.4□□□□□ -0.26
PITX2-208ENST00000556049 INSRP06213 1382 aa13.4□□□□□ -0.26
PITX2-208ENST00000556049 MAP3K5Q99683 1374 aa13.4□□□□□ -0.26
PITX2-208ENST00000556049 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
PITX2-208ENST00000556049 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
PITX2-208ENST00000556049 SPG7Q9UQ90 795 aa13.39□□□□□ -0.27
PITX2-208ENST00000556049 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa13.39□□□□□ -0.27
PITX2-208ENST00000556049 PAPPAQ13219 1627 aa13.39□□□□□ -0.27
PITX2-208ENST00000556049 GRIN3BO60391 1043 aa13.38□□□□□ -0.27
PITX2-208ENST00000556049 AK7Q96M32 723 aa13.38□□□□□ -0.27
PITX2-208ENST00000556049 NSD2O96028 1365 aa13.37□□□□□ -0.27
PITX2-208ENST00000556049 KIF24Q5T7B8 1368 aa13.37□□□□□ -0.27
PITX2-208ENST00000556049 PALLDQ8WX93 1383 aa13.37□□□□□ -0.27
PITX2-208ENST00000556049 NLGN2Q8NFZ4 835 aa13.37□□□□□ -0.27
PITX2-208ENST00000556049 CARD14Q9BXL6 1004 aa13.37□□□□□ -0.27
PITX2-208ENST00000556049 NSD3Q9BZ95 1437 aa13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms