RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553961.1

ACTN1-AS1-202, ACTN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene ACTN1-AS1, Length 599 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SBF2Q86WG5 1849 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
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ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SLC27A3Q5K4L6 730 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
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ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa18.8■□□□□ 0.6
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ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SLC16A10Q8TF71 515 aa18.7■□□□□ 0.58
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ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SIK1P57059 783 aa18.56■□□□□ 0.56
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GPR162Q16538 588 aa18.56■□□□□ 0.56
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
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ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SULT6B1Q6IMI4 303 aa18.56■□□□□ 0.56
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ATP6V1AP38606 617 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MTHFSP49914 203 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CABP4P57796 275 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MAP3K5Q99683 1374 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LY75O60449 1722 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PHF14O94880 888 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ASAP1Q9ULH1 1129 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PKD1L3Q7Z443 1732 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MSL1Q68DK7 614 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 AEBP1Q8IUX7 1158 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 IL13P35225 146 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ATG3Q9NT62 314 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GNPATO15228 680 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SSFA2P28290 1259 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
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