RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552253.1

PTPRB-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 2,373 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-211ENST00000552253 CRB1P82279 1406 aa7.4□□□□□ -1.22
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PTPRB-211ENST00000552253 DIP2AQ14689 1571 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 AK9Q5TCS8 1911 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 SOX12O15370 315 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 PDE1AP54750 535 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 PKP1Q13835 747 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 IL17REQ8NFR9 667 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 ARXQ96QS3 562 aa7.31□□□□□ -1.24
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