RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 TMC1Q8TDI8 760 aa16.17■□□□□ 0.18
CS-221ENST00000550734 A0A1W2PP64 1363 aa16.16■□□□□ 0.18
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CS-221ENST00000550734 SHANK3Q9BYB0 1731 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-221ENST00000550734 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
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CS-221ENST00000550734 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa16.14■□□□□ 0.17
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CS-221ENST00000550734 DOT1LQ8TEK3 1739 aa16.14■□□□□ 0.17
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CS-221ENST00000550734 FBLN1P23142 703 aa16.06■□□□□ 0.16
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CS-221ENST00000550734 NBPF4Q96M43 638 aa16.05■□□□□ 0.16
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CS-221ENST00000550734 TAF1LQ8IZX4 1826 aa16.03■□□□□ 0.16
CS-221ENST00000550734 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CS-221ENST00000550734 CD2APQ9Y5K6 639 aa16.03■□□□□ 0.16
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CS-221ENST00000550734 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
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CS-221ENST00000550734 IFFO2Q5TF58 517 aa16■□□□□ 0.15
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CS-221ENST00000550734 USHBP1Q8N6Y0 703 aa15.99■□□□□ 0.15
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CS-221ENST00000550734 GGNBP2Q9H3C7 697 aa15.96■□□□□ 0.15
CS-221ENST00000550734 UBR3Q6ZT12 1888 aa15.96■□□□□ 0.15
CS-221ENST00000550734 PKD1L3Q7Z443 1732 aa15.95■□□□□ 0.14
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CS-221ENST00000550734 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CS-221ENST00000550734 FLT4P35916 1363 aa15.95■□□□□ 0.14
CS-221ENST00000550734 AMIGO3Q86WK7 504 aa15.94■□□□□ 0.14
CS-221ENST00000550734 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CS-221ENST00000550734 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CS-221ENST00000550734 KIF20BQ96Q89 1820 aa15.94■□□□□ 0.14
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CS-221ENST00000550734 AK7Q96M32 723 aa15.92■□□□□ 0.14
CS-221ENST00000550734 NSD3Q9BZ95 1437 aa15.92■□□□□ 0.14
CS-221ENST00000550734 HSPA6P17066 643 aa15.91■□□□□ 0.14
CS-221ENST00000550734 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
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CS-221ENST00000550734 IGSF1Q8N6C5 1336 aa15.9■□□□□ 0.14
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CS-221ENST00000550734 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
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CS-221ENST00000550734 PHF14O94880 888 aa15.87■□□□□ 0.13
CS-221ENST00000550734 SIK1P57059 783 aa15.87■□□□□ 0.13
CS-221ENST00000550734 SMIM5Q71RC9 77 aa15.87■□□□□ 0.13
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CS-221ENST00000550734 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.87■□□□□ 0.132e-6■■□□□ 11.9
CS-221ENST00000550734 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa15.87■□□□□ 0.13
CS-221ENST00000550734 KIF13BQ9NQT8 1826 aa15.87■□□□□ 0.13
CS-221ENST00000550734 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CS-221ENST00000550734 SPG7Q9UQ90 795 aa15.86■□□□□ 0.13
CS-221ENST00000550734 KIF3CO14782 793 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-221ENST00000550734 PANK3Q9H999 370 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-221ENST00000550734 WASHC2AQ641Q2 1341 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-221ENST00000550734 ITPK1Q13572 414 aa15.84■□□□□ 0.13
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