RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CS-219ENST00000550655 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CS-219ENST00000550655 PLSCR1O15162 318 aa24.29■■□□□ 1.48
CS-219ENST00000550655 KCNQ2O43526 872 aa24.29■■□□□ 1.48
CS-219ENST00000550655 MORC1Q86VD1 984 aa24.29■■□□□ 1.48
CS-219ENST00000550655 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.28■■□□□ 1.48
CS-219ENST00000550655 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CS-219ENST00000550655 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CS-219ENST00000550655 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.28■■□□□ 1.48
CS-219ENST00000550655 LRP5O75197 1615 aa24.28■■□□□ 1.48
CS-219ENST00000550655 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.27■■□□□ 1.48
CS-219ENST00000550655 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.27■■□□□ 1.48
CS-219ENST00000550655 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CS-219ENST00000550655 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
CS-219ENST00000550655 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
CS-219ENST00000550655 EYA1Q99502 592 aa24.25■■□□□ 1.47
CS-219ENST00000550655 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.23■■□□□ 1.47
CS-219ENST00000550655 PAPPAQ13219 1627 aa24.23■■□□□ 1.47
CS-219ENST00000550655 LY75O60449 1722 aa24.22■■□□□ 1.47
CS-219ENST00000550655 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CS-219ENST00000550655 PROM2Q8N271 834 aa24.22■■□□□ 1.47
CS-219ENST00000550655 ITGB4P16144 1822 aa24.21■■□□□ 1.47
CS-219ENST00000550655 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.21■■□□□ 1.47
CS-219ENST00000550655 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.21■■□□□ 1.47
CS-219ENST00000550655 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.2■■□□□ 1.46
CS-219ENST00000550655 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.2■■□□□ 1.46
CS-219ENST00000550655 CASZ1Q86V15 1759 aa24.19■■□□□ 1.46
CS-219ENST00000550655 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.17■■□□□ 1.46
CS-219ENST00000550655 CYP27B1O15528 508 aa24.17■■□□□ 1.46
CS-219ENST00000550655 TXNRD1Q16881 649 aa24.17■■□□□ 1.46
CS-219ENST00000550655 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CS-219ENST00000550655 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CS-219ENST00000550655 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CS-219ENST00000550655 NBPF14Q5TI25 921 aa24.15■■□□□ 1.46
CS-219ENST00000550655 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CS-219ENST00000550655 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CS-219ENST00000550655 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.452e-6■■□□□ 11.9
CS-219ENST00000550655 IL13P35225 146 aa24.11■■□□□ 1.45
CS-219ENST00000550655 MTHFSP49914 203 aa24.11■■□□□ 1.45
CS-219ENST00000550655 SPG7Q9UQ90 795 aa24.11■■□□□ 1.45
CS-219ENST00000550655 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.1■■□□□ 1.45
CS-219ENST00000550655 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.1■■□□□ 1.45
CS-219ENST00000550655 KDRP35968 1356 aa24.1■■□□□ 1.45
CS-219ENST00000550655 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
CS-219ENST00000550655 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.09■■□□□ 1.45
CS-219ENST00000550655 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.07■■□□□ 1.44
CS-219ENST00000550655 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.07■■□□□ 1.44
CS-219ENST00000550655 C5P01031 1676 aa24.06■■□□□ 1.44
CS-219ENST00000550655 PHKG2P15735 406 aa24.06■■□□□ 1.44
CS-219ENST00000550655 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CS-219ENST00000550655 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CS-219ENST00000550655 SLC15A2Q16348 729 aa24.03■■□□□ 1.44
CS-219ENST00000550655 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.03■■□□□ 1.44
CS-219ENST00000550655 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.03■■□□□ 1.44
CS-219ENST00000550655 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.03■■□□□ 1.44
CS-219ENST00000550655 STK32BQ9NY57 414 aa24.03■■□□□ 1.44
CS-219ENST00000550655 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.02■■□□□ 1.44
CS-219ENST00000550655 ZNF827Q17R98 1081 aa24.01■■□□□ 1.43
CS-219ENST00000550655 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CS-219ENST00000550655 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CS-219ENST00000550655 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24■■□□□ 1.43
CS-219ENST00000550655 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CS-219ENST00000550655 KCNQ4P56696 695 aa23.99■■□□□ 1.43
CS-219ENST00000550655 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
CS-219ENST00000550655 PALLDQ8WX93 1383 aa23.99■■□□□ 1.43
CS-219ENST00000550655 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.98■■□□□ 1.43
CS-219ENST00000550655 PIGBQ92521 554 aa23.98■■□□□ 1.43
CS-219ENST00000550655 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
CS-219ENST00000550655 AKT1S1Q96B36 256 aa23.97■■□□□ 1.43
CS-219ENST00000550655 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.96■■□□□ 1.43
CS-219ENST00000550655 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
CS-219ENST00000550655 HMOX1P09601 288 aa23.95■■□□□ 1.42
CS-219ENST00000550655 C4BP0C0L5 1744 aa23.95■■□□□ 1.42
CS-219ENST00000550655 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.95■■□□□ 1.42
CS-219ENST00000550655 PPP2R1AP30153 589 aa23.94■■□□□ 1.42
CS-219ENST00000550655 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.94■■□□□ 1.42
CS-219ENST00000550655 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23.94■■□□□ 1.42
CS-219ENST00000550655 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
CS-219ENST00000550655 DCAF5Q96JK2 942 aa23.93■■□□□ 1.42
CS-219ENST00000550655 SPON1Q9HCB6 807 aa23.93■■□□□ 1.42
CS-219ENST00000550655 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
CS-219ENST00000550655 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.91■■□□□ 1.42
CS-219ENST00000550655 MRC1P22897 1456 aa23.9■■□□□ 1.42
CS-219ENST00000550655 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.9■■□□□ 1.42
CS-219ENST00000550655 ZBTB7AO95365 584 aa23.9■■□□□ 1.42
CS-219ENST00000550655 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.9■■□□□ 1.42
CS-219ENST00000550655 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
CS-219ENST00000550655 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.89■■□□□ 1.42
CS-219ENST00000550655 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.89■■□□□ 1.41
CS-219ENST00000550655 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CS-219ENST00000550655 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
CS-219ENST00000550655 CFAP53Q96M91 514 aa23.87■■□□□ 1.41
CS-219ENST00000550655 ATG3Q9NT62 314 aa23.87■■□□□ 1.41
CS-219ENST00000550655 PTGER2P43116 358 aa23.86■■□□□ 1.41
CS-219ENST00000550655 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.86■■□□□ 1.41
CS-219ENST00000550655 MTFR1LQ9H019 292 aa23.86■■□□□ 1.41
CS-219ENST00000550655 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.85■■□□□ 1.41
CS-219ENST00000550655 SIK1P57059 783 aa23.85■■□□□ 1.41
CS-219ENST00000550655 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
CS-219ENST00000550655 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.85■■□□□ 1.41
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