RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa10.77□□□□□ -0.68
CS-215ENST00000549143 DCCP43146 1447 aa10.77□□□□□ -0.68
CS-215ENST00000549143 CHL1O00533 1208 aa10.77□□□□□ -0.68
CS-215ENST00000549143 IL17REQ8NFR9 667 aa10.77□□□□□ -0.68
CS-215ENST00000549143 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 RTL1A6NKG5 1358 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 STRCQ7RTU9 1775 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 LGR6Q9HBX8 967 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 PRDM11Q9NQV5 511 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 NFAT5O94916 1531 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 ERBB3P21860 1342 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 KIF16BQ96L93 1317 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 KIAA0232Q92628 1395 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 IGHDP01880 384 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 MVPQ14764 893 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 TMEM57Q8N5G2 664 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 RGS3P49796 1198 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 ALDH1L2Q3SY69 923 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 C1orf141Q5JVX7 400 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 TNS3Q68CZ2 1445 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 USP35Q9P2H5 1018 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 MAP3K5Q99683 1374 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 STRN4Q9NRL3 753 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 SLC4A2P04920 1241 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 TEFQ10587 303 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 CRB1P82279 1406 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 MS4A1P11836 297 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 ZNF428Q96B54 188 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 BCL11AQ9H165 835 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa10.71□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 PIP4K2BP78356 416 aa10.71□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 AMOTQ4VCS5 1084 aa10.71□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 DDX19BQ9UMR2 479 aa10.71□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 KDM2BQ8NHM5 1336 aa10.71□□□□□ -0.69
CS-215ENST00000549143 KCNQ3O43525 872 aa10.71□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 C1orf115Q9H7X2 142 aa10.71□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 RGPD1P0DJD0 1748 aa10.7□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 LTN1O94822 1766 aa10.7□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 DLG5Q8TDM6 1919 aa10.7□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 PXDNQ92626 1479 aa10.7□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 AKAP4Q5JQC9 854 aa10.7□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 SLC4A10Q6U841 1118 aa10.7□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 BTBD11A6QL63 1104 aa10.7□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 EVA1CP58658 441 aa10.7□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 KIF1AQ12756 1690 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 SLIT3O75094 1523 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 TATP17735 454 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 F6X3S4 739 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 G2E3Q7L622 706 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 STK31Q9BXU1 1019 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 RNMTO43148 476 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 SLC39A6Q13433 755 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 ANXA1P04083 346 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 ARHGAP45Q92619 1136 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 SPG7Q9UQ90 795 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 ADAMTS2O95450 1211 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 CCDC30Q5VVM6 783 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 BTG4Q9NY30 223 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-215ENST00000549143 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa10.65□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 ALS2Q96Q42 1657 aa10.65□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 RGPD2P0DJD1 1756 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 USP54Q70EL1 1684 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 CYP27B1O15528 508 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 PDE4AP27815 886 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 IFNL2Q8IZJ0 200 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 CPDO75976 1380 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 PHKG2P15735 406 aa10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 147.8 ms