RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 PROM2Q8N271 834 aa23.23■■□□□ 1.31
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CASP9-211ENST00000546969 PANK3Q9H999 370 aa23.21■■□□□ 1.31
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CASP9-211ENST00000546969 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.18■■□□□ 1.3
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CASP9-211ENST00000546969 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CASP9-211ENST00000546969 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.9■■□□□ 1.26
CASP9-211ENST00000546969 SYT17Q9BSW7 474 aa22.9■■□□□ 1.26
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CASP9-211ENST00000546969 MTHFSP49914 203 aa22.88■■□□□ 1.25
CASP9-211ENST00000546969 KLHL34Q8N239 644 aa22.88■■□□□ 1.25
CASP9-211ENST00000546969 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.87■■□□□ 1.25
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CASP9-211ENST00000546969 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
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CASP9-211ENST00000546969 CABP4P57796 275 aa22.86■■□□□ 1.25
CASP9-211ENST00000546969 YY1P25490 414 aa22.85■■□□□ 1.25
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CASP9-211ENST00000546969 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.85■■□□□ 1.25
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CASP9-211ENST00000546969 MAP3K5Q99683 1374 aa22.83■■□□□ 1.25
CASP9-211ENST00000546969 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.83■■□□□ 1.25
CASP9-211ENST00000546969 ATG3Q9NT62 314 aa22.82■■□□□ 1.24
CASP9-211ENST00000546969 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CASP9-211ENST00000546969 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.8■■□□□ 1.24
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