RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.99■■□□□ 1.91
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATP10DQ9P241 1426 aa26.99■■□□□ 1.91
CD27-AS1-208ENST00000538616 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
CD27-AS1-208ENST00000538616 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.98■■□□□ 1.91
CD27-AS1-208ENST00000538616 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.97■■□□□ 1.91
CD27-AS1-208ENST00000538616 MSH5O43196 834 aa26.96■■□□□ 1.91
CD27-AS1-208ENST00000538616 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.96■■□□□ 1.91
CD27-AS1-208ENST00000538616 KCNQ4P56696 695 aa26.95■■□□□ 1.9
CD27-AS1-208ENST00000538616 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.94■■□□□ 1.9
CD27-AS1-208ENST00000538616 NME9Q86XW9 330 aa26.93■■□□□ 1.9
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CD27-AS1-208ENST00000538616 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
CD27-AS1-208ENST00000538616 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP54Q70EL1 1684 aa26.91■■□□□ 1.9
CD27-AS1-208ENST00000538616 LTN1O94822 1766 aa26.9■■□□□ 1.9
CD27-AS1-208ENST00000538616 IP6K1Q92551 441 aa26.9■■□□□ 1.9
CD27-AS1-208ENST00000538616 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.89■■□□□ 1.9
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMF1P82094 1093 aa26.89■■□□□ 1.9
CD27-AS1-208ENST00000538616 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
CD27-AS1-208ENST00000538616 A0A1W2PP64 1363 aa26.88■■□□□ 1.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 ADCY9O60503 1353 aa26.87■■□□□ 1.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC24A1O60721 1099 aa26.87■■□□□ 1.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 FLAD1Q8NFF5 587 aa26.87■■□□□ 1.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 LY75O60449 1722 aa26.86■■□□□ 1.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.86■■□□□ 1.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 NSD2O96028 1365 aa26.85■■□□□ 1.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 MSL1Q68DK7 614 aa26.84■■□□□ 1.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.79■■□□□ 1.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.77■■□□□ 1.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 APLP1P51693 650 aa26.75■■□□□ 1.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 CDCA8Q53HL2 280 aa26.75■■□□□ 1.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 HOXC9P31274 260 aa26.74■■□□□ 1.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 AMPHP49418 695 aa26.74■■□□□ 1.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIF3CO14782 793 aa26.73■■□□□ 1.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.72■■□□□ 1.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.71■■□□□ 1.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 COG3Q96JB2 828 aa26.71■■□□□ 1.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.7■■□□□ 1.86
CD27-AS1-208ENST00000538616 MEGF6O75095 1541 aa26.7■■□□□ 1.86
CD27-AS1-208ENST00000538616 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.69■■□□□ 1.86
CD27-AS1-208ENST00000538616 AK7Q96M32 723 aa26.68■■□□□ 1.86
CD27-AS1-208ENST00000538616 C5P01031 1676 aa26.68■■□□□ 1.86
CD27-AS1-208ENST00000538616 PALLDQ8WX93 1383 aa26.68■■□□□ 1.86
CD27-AS1-208ENST00000538616 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.67■■□□□ 1.86
CD27-AS1-208ENST00000538616 TOMM70O94826 608 aa26.66■■□□□ 1.86
CD27-AS1-208ENST00000538616 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
CD27-AS1-208ENST00000538616 RTL1A6NKG5 1358 aa26.64■■□□□ 1.86
CD27-AS1-208ENST00000538616 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
CD27-AS1-208ENST00000538616 FBLN1P23142 703 aa26.64■■□□□ 1.86
CD27-AS1-208ENST00000538616 NBPF6Q5VWK0 638 aa26.64■■□□□ 1.86
CD27-AS1-208ENST00000538616 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa26.64■■□□□ 1.86
CD27-AS1-208ENST00000538616 NBPF4Q96M43 638 aa26.64■■□□□ 1.86
CD27-AS1-208ENST00000538616 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.64■■□□□ 1.86
CD27-AS1-208ENST00000538616 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.64■■□□□ 1.85
CD27-AS1-208ENST00000538616 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.64■■□□□ 1.85
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIF20BQ96Q89 1820 aa26.63■■□□□ 1.85
CD27-AS1-208ENST00000538616 FYB1O15117 783 aa26.63■■□□□ 1.85
CD27-AS1-208ENST00000538616 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.63■■□□□ 1.85
CD27-AS1-208ENST00000538616 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.63■■□□□ 1.85
CD27-AS1-208ENST00000538616 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.62■■□□□ 1.85
CD27-AS1-208ENST00000538616 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CD27-AS1-208ENST00000538616 SSFA2P28290 1259 aa26.61■■□□□ 1.85
CD27-AS1-208ENST00000538616 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CD27-AS1-208ENST00000538616 TAF1LQ8IZX4 1826 aa26.6■■□□□ 1.85
CD27-AS1-208ENST00000538616 PHF14O94880 888 aa26.59■■□□□ 1.85
CD27-AS1-208ENST00000538616 C4BP0C0L5 1744 aa26.58■■□□□ 1.85
CD27-AS1-208ENST00000538616 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.57■■□□□ 1.84
CD27-AS1-208ENST00000538616 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.57■■□□□ 1.84
CD27-AS1-208ENST00000538616 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
CD27-AS1-208ENST00000538616 AMIGO3Q86WK7 504 aa26.55■■□□□ 1.84
CD27-AS1-208ENST00000538616 TGFB2P61812 414 aa26.53■■□□□ 1.84
CD27-AS1-208ENST00000538616 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CD27-AS1-208ENST00000538616 CYP27B1O15528 508 aa26.52■■□□□ 1.84
CD27-AS1-208ENST00000538616 PIGBQ92521 554 aa26.51■■□□□ 1.83
CD27-AS1-208ENST00000538616 UBR3Q6ZT12 1888 aa26.51■■□□□ 1.83
CD27-AS1-208ENST00000538616 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.5■■□□□ 1.83
CD27-AS1-208ENST00000538616 SIK1P57059 783 aa26.5■■□□□ 1.83
CD27-AS1-208ENST00000538616 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
CD27-AS1-208ENST00000538616 INSRP06213 1382 aa26.49■■□□□ 1.83
CD27-AS1-208ENST00000538616 SMIM5Q71RC9 77 aa26.49■■□□□ 1.83
CD27-AS1-208ENST00000538616 BCS1LQ9Y276 419 aa26.49■■□□□ 1.83
CD27-AS1-208ENST00000538616 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.48■■□□□ 1.83
CD27-AS1-208ENST00000538616 MMP10P09238 476 aa26.48■■□□□ 1.83
CD27-AS1-208ENST00000538616 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CD27-AS1-208ENST00000538616 PANK3Q9H999 370 aa26.48■■□□□ 1.83
CD27-AS1-208ENST00000538616 GNPATO15228 680 aa26.47■■□□□ 1.83
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.47■■□□□ 1.83
CD27-AS1-208ENST00000538616 JMYQ8N9B5 988 aa26.47■■□□□ 1.83
CD27-AS1-208ENST00000538616 KLRG1Q96E93 195 aa26.47■■□□□ 1.83
CD27-AS1-208ENST00000538616 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.47■■□□□ 1.83
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.46■■□□□ 1.83
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