RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532743.5

RAD51-208, Transcript of RAD51 recombinase, human

TSL 2 BASIC

Gene RAD51, Length 1,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD51-208	ENST00000532743	IL13	P35225	146 aa		33.11	■■■□□ 2.89
RAD51-208	ENST00000532743	RALBP1	Q15311	655 aa		33.1	■■■□□ 2.89
RAD51-208	ENST00000532743	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
RAD51-208	ENST00000532743	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		33.09	■■■□□ 2.89
RAD51-208	ENST00000532743	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
RAD51-208	ENST00000532743	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
RAD51-208	ENST00000532743	CCDC125	Q86Z20	511 aa		33.07	■■■□□ 2.88
RAD51-208	ENST00000532743	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
RAD51-208	ENST00000532743	NHS	Q6T4R5	1651 aa		33.06	■■■□□ 2.88
RAD51-208	ENST00000532743	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		33.04	■■■□□ 2.88
RAD51-208	ENST00000532743	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		33.03	■■■□□ 2.88
RAD51-208	ENST00000532743	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		33.03	■■■□□ 2.88
RAD51-208	ENST00000532743	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
RAD51-208	ENST00000532743	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
RAD51-208	ENST00000532743	TRIM37	O94972	964 aa		33.02	■■■□□ 2.88
RAD51-208	ENST00000532743	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		33.02	■■■□□ 2.88
RAD51-208	ENST00000532743	BCL9	O00512	1426 aa		33	■■■□□ 2.87
RAD51-208	ENST00000532743	KDR	P35968	1356 aa		33	■■■□□ 2.87
RAD51-208	ENST00000532743	SPG7	Q9UQ90	795 aa		33	■■■□□ 2.87
RAD51-208	ENST00000532743	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
RAD51-208	ENST00000532743	BTAF1	O14981	1849 aa		32.99	■■■□□ 2.87
RAD51-208	ENST00000532743	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		32.99	■■■□□ 2.87
RAD51-208	ENST00000532743	HMOX1	P09601	288 aa		32.98	■■■□□ 2.87
RAD51-208	ENST00000532743	NUDC	Q9Y266	331 aa		32.98	■■■□□ 2.87
RAD51-208	ENST00000532743	ITGB4	P16144	1822 aa		32.98	■■■□□ 2.87
RAD51-208	ENST00000532743	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	32.96	■■■□□ 2.87
RAD51-208	ENST00000532743	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		32.94	■■■□□ 2.86
RAD51-208	ENST00000532743	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	32.94	■■■□□ 2.86
RAD51-208	ENST00000532743	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
RAD51-208	ENST00000532743	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		32.93	■■■□□ 2.86
RAD51-208	ENST00000532743	BAG6	P46379	1132 aa		32.93	■■■□□ 2.86
RAD51-208	ENST00000532743	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		32.92	■■■□□ 2.86
RAD51-208	ENST00000532743	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
RAD51-208	ENST00000532743	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		32.9	■■■□□ 2.86
RAD51-208	ENST00000532743	CYP27B1	O15528	508 aa		32.89	■■■□□ 2.86
RAD51-208	ENST00000532743	APBA3	O96018	575 aa		32.89	■■■□□ 2.86
RAD51-208	ENST00000532743	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	32.89	■■■□□ 2.86
RAD51-208	ENST00000532743	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	32.89	■■■□□ 2.86
RAD51-208	ENST00000532743	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		32.89	■■■□□ 2.86
RAD51-208	ENST00000532743	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
RAD51-208	ENST00000532743	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
RAD51-208	ENST00000532743	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		32.87	■■■□□ 2.85
RAD51-208	ENST00000532743	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		32.87	■■■□□ 2.85
RAD51-208	ENST00000532743	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
RAD51-208	ENST00000532743	RREB1	Q92766	1687 aa		32.85	■■■□□ 2.85
RAD51-208	ENST00000532743	ANP32C	O43423	234 aa		32.85	■■■□□ 2.85
RAD51-208	ENST00000532743	KCNQ2	O43526	872 aa		32.84	■■■□□ 2.85
RAD51-208	ENST00000532743	PHKG2	P15735	406 aa		32.83	■■■□□ 2.85
RAD51-208	ENST00000532743	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
RAD51-208	ENST00000532743	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		32.83	■■■□□ 2.85
RAD51-208	ENST00000532743	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		32.82	■■■□□ 2.85
RAD51-208	ENST00000532743	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		32.8	■■■□□ 2.84
RAD51-208	ENST00000532743	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		32.79	■■■□□ 2.84
RAD51-208	ENST00000532743	PRKAR2B	P31323	418 aa		32.79	■■■□□ 2.84
RAD51-208	ENST00000532743	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
RAD51-208	ENST00000532743	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
RAD51-208	ENST00000532743	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		32.78	■■■□□ 2.84
RAD51-208	ENST00000532743	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
RAD51-208	ENST00000532743	LY75	O60449	1722 aa		32.77	■■■□□ 2.84
RAD51-208	ENST00000532743	FCHSD2	O94868	740 aa		32.75	■■■□□ 2.83
RAD51-208	ENST00000532743	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
RAD51-208	ENST00000532743	NEFM	P07197	916 aa		32.74	■■■□□ 2.83
RAD51-208	ENST00000532743	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
RAD51-208	ENST00000532743	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		32.73	■■■□□ 2.83
RAD51-208	ENST00000532743	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		32.72	■■■□□ 2.83
RAD51-208	ENST00000532743	DCAF5	Q96JK2	942 aa		32.72	■■■□□ 2.83
RAD51-208	ENST00000532743	PLSCR1	O15162	318 aa		32.72	■■■□□ 2.83
RAD51-208	ENST00000532743	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	32.72	■■■□□ 2.83
RAD51-208	ENST00000532743	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		32.72	■■■□□ 2.83
RAD51-208	ENST00000532743	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		32.72	■■■□□ 2.83
RAD51-208	ENST00000532743	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
RAD51-208	ENST00000532743	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
RAD51-208	ENST00000532743	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		32.69	■■■□□ 2.82
RAD51-208	ENST00000532743	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		32.69	■■■□□ 2.82
RAD51-208	ENST00000532743	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		32.67	■■■□□ 2.82
RAD51-208	ENST00000532743	MAP3K5	Q99683	1374 aa		32.66	■■■□□ 2.82
RAD51-208	ENST00000532743	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		32.66	■■■□□ 2.82
RAD51-208	ENST00000532743	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RAD51-208	ENST00000532743	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
RAD51-208	ENST00000532743	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		32.63	■■■□□ 2.81
RAD51-208	ENST00000532743	CABP4	P57796	275 aa		32.62	■■■□□ 2.81
RAD51-208	ENST00000532743	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		32.61	■■■□□ 2.81
RAD51-208	ENST00000532743	TXNRD1	Q16881	649 aa		32.61	■■■□□ 2.81
RAD51-208	ENST00000532743	PIGB	Q92521	554 aa		32.61	■■■□□ 2.81
RAD51-208	ENST00000532743	C5	P01031	1676 aa		32.6	■■■□□ 2.81
RAD51-208	ENST00000532743	MRC1	P22897	1456 aa		32.59	■■■□□ 2.81
RAD51-208	ENST00000532743	PALLD	Q8WX93	1383 aa		32.58	■■■□□ 2.81
RAD51-208	ENST00000532743	MRS2	Q9HD23	443 aa		32.58	■■■□□ 2.81
RAD51-208	ENST00000532743	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
RAD51-208	ENST00000532743	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		32.57	■■■□□ 2.8
RAD51-208	ENST00000532743	PAPPA	Q13219	1627 aa		32.57	■■■□□ 2.8
RAD51-208	ENST00000532743	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
RAD51-208	ENST00000532743	LGR6	Q9HBX8	967 aa		32.56	■■■□□ 2.8
RAD51-208	ENST00000532743	CCDC184	Q52MB2	194 aa		32.55	■■■□□ 2.8
RAD51-208	ENST00000532743	PROM2	Q8N271	834 aa		32.55	■■■□□ 2.8
RAD51-208	ENST00000532743	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
RAD51-208	ENST00000532743	NBPF14	Q5TI25	921 aa		32.54	■■■□□ 2.8
RAD51-208	ENST00000532743	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		32.54	■■■□□ 2.8
RAD51-208	ENST00000532743	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		32.54	■■■□□ 2.8
RAD51-208	ENST00000532743	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		32.53	■■■□□ 2.8

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