RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527549.5

TSTA3-206, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 575 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-206ENST00000527549 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TSTA3-206ENST00000527549 C5P01031 1676 aa22.34■■□□□ 1.17
TSTA3-206ENST00000527549 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.34■■□□□ 1.17
TSTA3-206ENST00000527549 PCNTO95613 3336 aa22.33■■□□□ 1.17
TSTA3-206ENST00000527549 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
TSTA3-206ENST00000527549 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
TSTA3-206ENST00000527549 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-206ENST00000527549 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-206ENST00000527549 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-206ENST00000527549 MSL1Q68DK7 614 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-206ENST00000527549 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.29■■□□□ 1.16
TSTA3-206ENST00000527549 TOMM70O94826 608 aa22.27■■□□□ 1.16
TSTA3-206ENST00000527549 NME9Q86XW9 330 aa22.27■■□□□ 1.16
TSTA3-206ENST00000527549 IP6K1Q92551 441 aa22.27■■□□□ 1.16
TSTA3-206ENST00000527549 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
TSTA3-206ENST00000527549 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.27■■□□□ 1.16
TSTA3-206ENST00000527549 WDR90Q96KV7 1748 aa22.26■■□□□ 1.15
TSTA3-206ENST00000527549 MSH5O43196 834 aa22.26■■□□□ 1.15
TSTA3-206ENST00000527549 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TSTA3-206ENST00000527549 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.26■■□□□ 1.15
TSTA3-206ENST00000527549 USP47Q96K76 1375 aa22.25■■□□□ 1.15
TSTA3-206ENST00000527549 JMYQ8N9B5 988 aa22.25■■□□□ 1.15
TSTA3-206ENST00000527549 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.24■■□□□ 1.15
TSTA3-206ENST00000527549 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
TSTA3-206ENST00000527549 MEGF6O75095 1541 aa22.22■■□□□ 1.15
TSTA3-206ENST00000527549 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TSTA3-206ENST00000527549 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TSTA3-206ENST00000527549 C4BP0C0L5 1744 aa22.22■■□□□ 1.15
TSTA3-206ENST00000527549 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.22■■□□□ 1.15
TSTA3-206ENST00000527549 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.22■■□□□ 1.15
TSTA3-206ENST00000527549 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TSTA3-206ENST00000527549 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.2■■□□□ 1.14
TSTA3-206ENST00000527549 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.18■■□□□ 1.14
TSTA3-206ENST00000527549 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.17■■□□□ 1.14
TSTA3-206ENST00000527549 PRELPP51888 382 aa22.17■■□□□ 1.14
TSTA3-206ENST00000527549 KLRG1Q96E93 195 aa22.17■■□□□ 1.14
TSTA3-206ENST00000527549 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TSTA3-206ENST00000527549 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TSTA3-206ENST00000527549 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.14■■□□□ 1.14
TSTA3-206ENST00000527549 PALLDQ8WX93 1383 aa22.14■■□□□ 1.14
TSTA3-206ENST00000527549 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.13■■□□□ 1.13
TSTA3-206ENST00000527549 ITGB4P16144 1822 aa22.13■■□□□ 1.13
TSTA3-206ENST00000527549 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.12■■□□□ 1.13
TSTA3-206ENST00000527549 HOXC9P31274 260 aa22.12■■□□□ 1.13
TSTA3-206ENST00000527549 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TSTA3-206ENST00000527549 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-206ENST00000527549 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-206ENST00000527549 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-206ENST00000527549 SSFA2P28290 1259 aa22.1■■□□□ 1.13
TSTA3-206ENST00000527549 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TSTA3-206ENST00000527549 A0A1W2PP64 1363 aa22.1■■□□□ 1.13
TSTA3-206ENST00000527549 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TSTA3-206ENST00000527549 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-206ENST00000527549 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-206ENST00000527549 FSTL1Q12841 308 aa22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-206ENST00000527549 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-206ENST00000527549 TNS4Q8IZW8 715 aa22.08■■□□□ 1.13
TSTA3-206ENST00000527549 AK7Q96M32 723 aa22.08■■□□□ 1.13
TSTA3-206ENST00000527549 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.08■■□□□ 1.13
TSTA3-206ENST00000527549 RTL1A6NKG5 1358 aa22.08■■□□□ 1.12
TSTA3-206ENST00000527549 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-206ENST00000527549 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-206ENST00000527549 TGFB2P61812 414 aa22.06■■□□□ 1.12
TSTA3-206ENST00000527549 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.06■■□□□ 1.12
TSTA3-206ENST00000527549 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TSTA3-206ENST00000527549 NBPF4Q96M43 638 aa22.06■■□□□ 1.12
TSTA3-206ENST00000527549 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.06■■□□□ 1.12
TSTA3-206ENST00000527549 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.05■■□□□ 1.12
TSTA3-206ENST00000527549 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.05■■□□□ 1.12
TSTA3-206ENST00000527549 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.05■■□□□ 1.12
TSTA3-206ENST00000527549 HTRA3P83110 453 aa22.04■■□□□ 1.12
TSTA3-206ENST00000527549 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.03■■□□□ 1.12
TSTA3-206ENST00000527549 CAPN15O75808 1086 aa22.03■■□□□ 1.12
TSTA3-206ENST00000527549 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.03■■□□□ 1.12
TSTA3-206ENST00000527549 SMIM5Q71RC9 77 aa22.02■■□□□ 1.12
TSTA3-206ENST00000527549 CYP27B1O15528 508 aa22.01■■□□□ 1.11
TSTA3-206ENST00000527549 PHF14O94880 888 aa22.01■■□□□ 1.11
TSTA3-206ENST00000527549 AMPHP49418 695 aa22.01■■□□□ 1.11
TSTA3-206ENST00000527549 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.01■■□□□ 1.11
TSTA3-206ENST00000527549 TMC1Q8TDI8 760 aa22.01■■□□□ 1.11
TSTA3-206ENST00000527549 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.01■■□□□ 1.11
TSTA3-206ENST00000527549 LINC00116Q8NCU8 138 aa22■■□□□ 1.11
TSTA3-206ENST00000527549 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-206ENST00000527549 MMP10P09238 476 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-206ENST00000527549 FBLN1P23142 703 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-206ENST00000527549 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-206ENST00000527549 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-206ENST00000527549 PIGBQ92521 554 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-206ENST00000527549 COG3Q96JB2 828 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-206ENST00000527549 BCS1LQ9Y276 419 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-206ENST00000527549 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-206ENST00000527549 SIK1P57059 783 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-206ENST00000527549 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-206ENST00000527549 SBF1O95248 1867 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-206ENST00000527549 A0A0G2JLW4 131 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-206ENST00000527549 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-206ENST00000527549 NCAPD2Q15021 1401 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-206ENST00000527549 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-206ENST00000527549 C4AP0C0L4 1744 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-206ENST00000527549 C9orf131Q5VYM1 1079 aa21.95■■□□□ 1.1
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