RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526908.1

RPS2-204, Transcript of ribosomal protein S2, human

TSL 2

Gene RPS2, Length 638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS2-204	ENST00000526908	ZBTB7A	O95365	584 aa		28.32	■■■□□ 2.12
RPS2-204	ENST00000526908	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		28.32	■■■□□ 2.12
RPS2-204	ENST00000526908	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
RPS2-204	ENST00000526908	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	28.32	■■■□□ 2.12
RPS2-204	ENST00000526908	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		28.31	■■■□□ 2.12
RPS2-204	ENST00000526908	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		28.31	■■■□□ 2.12
RPS2-204	ENST00000526908	NSD2	O96028	1365 aa		28.31	■■■□□ 2.12
RPS2-204	ENST00000526908	PTGER2	P43116	358 aa		28.3	■■■□□ 2.12
RPS2-204	ENST00000526908	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		28.28	■■■□□ 2.12
RPS2-204	ENST00000526908	LY75	O60449	1722 aa		28.28	■■■□□ 2.12
RPS2-204	ENST00000526908	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	28.27	■■■□□ 2.12
RPS2-204	ENST00000526908	ZNF827	Q17R98	1081 aa		28.27	■■■□□ 2.12
RPS2-204	ENST00000526908	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		28.27	■■■□□ 2.12
RPS2-204	ENST00000526908	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	28.25	■■■□□ 2.11
RPS2-204	ENST00000526908	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		28.25	■■■□□ 2.11
RPS2-204	ENST00000526908	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		28.24	■■■□□ 2.11
RPS2-204	ENST00000526908	NCAPD2	Q15021	1401 aa		28.24	■■■□□ 2.11
RPS2-204	ENST00000526908	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		28.23	■■■□□ 2.11
RPS2-204	ENST00000526908	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	28.23	■■■□□ 2.11
RPS2-204	ENST00000526908	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		28.23	■■■□□ 2.11
RPS2-204	ENST00000526908	MTFR1L	Q9H019	292 aa		28.23	■■■□□ 2.11
RPS2-204	ENST00000526908	AKT1S1	Q96B36	256 aa		28.22	■■■□□ 2.11
RPS2-204	ENST00000526908	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	28.22	■■■□□ 2.11
RPS2-204	ENST00000526908	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		28.21	■■■□□ 2.11
RPS2-204	ENST00000526908	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		28.21	■■■□□ 2.11
RPS2-204	ENST00000526908	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	28.21	■■■□□ 2.11
RPS2-204	ENST00000526908	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	28.19	■■■□□ 2.1
RPS2-204	ENST00000526908	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	28.19	■■■□□ 2.1
RPS2-204	ENST00000526908	KCNQ4	P56696	695 aa		28.18	■■■□□ 2.1
RPS2-204	ENST00000526908	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		28.18	■■■□□ 2.1
RPS2-204	ENST00000526908	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		28.18	■■■□□ 2.1
RPS2-204	ENST00000526908	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		28.18	■■■□□ 2.1
RPS2-204	ENST00000526908	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
RPS2-204	ENST00000526908	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		28.17	■■■□□ 2.1
RPS2-204	ENST00000526908	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		28.17	■■■□□ 2.1
RPS2-204	ENST00000526908	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		28.15	■■■□□ 2.1
RPS2-204	ENST00000526908	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	28.15	■■■□□ 2.1
RPS2-204	ENST00000526908	CYP27B1	O15528	508 aa		28.14	■■■□□ 2.1
RPS2-204	ENST00000526908	POLK	Q9UBT6	870 aa		28.14	■■■□□ 2.1
RPS2-204	ENST00000526908	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		28.13	■■■□□ 2.09
RPS2-204	ENST00000526908	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	28.12	■■■□□ 2.09
RPS2-204	ENST00000526908	ITGB4	P16144	1822 aa		28.11	■■■□□ 2.09
RPS2-204	ENST00000526908	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	28.1	■■■□□ 2.09
RPS2-204	ENST00000526908	EYA1	Q99502	592 aa		28.09	■■■□□ 2.09
RPS2-204	ENST00000526908	SYT17	Q9BSW7	474 aa		28.09	■■■□□ 2.09
RPS2-204	ENST00000526908	C5	P01031	1676 aa		28.09	■■■□□ 2.09
RPS2-204	ENST00000526908	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		28.08	■■■□□ 2.09
RPS2-204	ENST00000526908	ARX	Q96QS3	562 aa		28.08	■■■□□ 2.09
RPS2-204	ENST00000526908	PANK3	Q9H999	370 aa		28.08	■■■□□ 2.09
RPS2-204	ENST00000526908	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		28.07	■■■□□ 2.08
RPS2-204	ENST00000526908	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
RPS2-204	ENST00000526908	MAP3K5	Q99683	1374 aa		28.06	■■■□□ 2.08
RPS2-204	ENST00000526908	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		28.06	■■■□□ 2.08
RPS2-204	ENST00000526908	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		28.05	■■■□□ 2.08
RPS2-204	ENST00000526908	YY1	P25490	414 aa		28.05	■■■□□ 2.08
RPS2-204	ENST00000526908	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	28.05	■■■□□ 2.08
RPS2-204	ENST00000526908	PALLD	Q8WX93	1383 aa		28.04	■■■□□ 2.08
RPS2-204	ENST00000526908	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
RPS2-204	ENST00000526908	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		28.03	■■■□□ 2.08
RPS2-204	ENST00000526908	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	28.02	■■■□□ 2.08
RPS2-204	ENST00000526908	SPG7	Q9UQ90	795 aa		28.02	■■■□□ 2.08
RPS2-204	ENST00000526908	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		27.98	■■■□□ 2.07
RPS2-204	ENST00000526908	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
RPS2-204	ENST00000526908	PIGB	Q92521	554 aa		27.98	■■■□□ 2.07
RPS2-204	ENST00000526908	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		27.98	■■■□□ 2.07
RPS2-204	ENST00000526908	C4B	P0C0L5	1744 aa		27.97	■■■□□ 2.07
RPS2-204	ENST00000526908	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
RPS2-204	ENST00000526908	PHKG2	P15735	406 aa		27.95	■■■□□ 2.06
RPS2-204	ENST00000526908	POLD1	P28340	1107 aa		27.95	■■■□□ 2.06
RPS2-204	ENST00000526908	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		27.93	■■■□□ 2.06
RPS2-204	ENST00000526908	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RPS2-204	ENST00000526908	MORC1	Q86VD1	984 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RPS2-204	ENST00000526908	UTRN	P46939	3433 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RPS2-204	ENST00000526908	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RPS2-204	ENST00000526908	MSH5	O43196	834 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RPS2-204	ENST00000526908	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
RPS2-204	ENST00000526908	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RPS2-204	ENST00000526908	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RPS2-204	ENST00000526908	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RPS2-204	ENST00000526908	CHD4	Q14839	1912 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RPS2-204	ENST00000526908	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
RPS2-204	ENST00000526908	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RPS2-204	ENST00000526908	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RPS2-204	ENST00000526908	SIK1	P57059	783 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RPS2-204	ENST00000526908	MSL1	Q68DK7	614 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RPS2-204	ENST00000526908	KLHL34	Q8N239	644 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RPS2-204	ENST00000526908	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RPS2-204	ENST00000526908	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RPS2-204	ENST00000526908	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RPS2-204	ENST00000526908	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RPS2-204	ENST00000526908	ATG3	Q9NT62	314 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RPS2-204	ENST00000526908	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
RPS2-204	ENST00000526908	ITPK1	Q13572	414 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RPS2-204	ENST00000526908	AK7	Q96M32	723 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RPS2-204	ENST00000526908	KDR	P35968	1356 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RPS2-204	ENST00000526908	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RPS2-204	ENST00000526908	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
RPS2-204	ENST00000526908	SMIM5	Q71RC9	77 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RPS2-204	ENST00000526908	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RPS2-204	ENST00000526908	IL13	P35225	146 aa		27.8	■■■□□ 2.04

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms