RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
TSNARE1-208ENST00000524325 TMPOP42166 694 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
TSNARE1-208ENST00000524325 ATRNO75882 1429 aa30.01■■■□□ 2.4
TSNARE1-208ENST00000524325 RIPK4P57078 832 aa30■■■□□ 2.39
TSNARE1-208ENST00000524325 NFE2L2Q16236 605 aa30■■■□□ 2.39
TSNARE1-208ENST00000524325 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
TSNARE1-208ENST00000524325 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A0G2JS52 829 aa29.99■■■□□ 2.39
TSNARE1-208ENST00000524325 MYT1Q01538 1121 aa29.99■■■□□ 2.39
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
TSNARE1-208ENST00000524325 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
TSNARE1-208ENST00000524325 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa29.97■■■□□ 2.39
TSNARE1-208ENST00000524325 DISP2A7MBM2 1401 aa29.97■■■□□ 2.39
TSNARE1-208ENST00000524325 BARGINQ6ZT62 677 aa29.97■■■□□ 2.39
TSNARE1-208ENST00000524325 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
TSNARE1-208ENST00000524325 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
TSNARE1-208ENST00000524325 DCTN1Q14203 1278 aa29.96■■■□□ 2.39
TSNARE1-208ENST00000524325 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
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TSNARE1-208ENST00000524325 GAS2L2Q8NHY3 880 aa29.95■■■□□ 2.38
TSNARE1-208ENST00000524325 CYP27B1O15528 508 aa29.94■■■□□ 2.38
TSNARE1-208ENST00000524325 POTEAQ6S8J7 498 aa29.94■■■□□ 2.38
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIM35Q9UPQ4 493 aa29.94■■■□□ 2.38
TSNARE1-208ENST00000524325 SPG7Q9UQ90 795 aa29.94■■■□□ 2.38
TSNARE1-208ENST00000524325 GLI3P10071 1580 aa29.93■■■□□ 2.38
TSNARE1-208ENST00000524325 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
TSNARE1-208ENST00000524325 MCM10Q7L590 875 aa29.92■■■□□ 2.38
TSNARE1-208ENST00000524325 EXOC5O00471 708 aa29.91■■■□□ 2.38
TSNARE1-208ENST00000524325 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa29.9■■■□□ 2.38
TSNARE1-208ENST00000524325 DDB1Q16531 1140 aa29.9■■■□□ 2.38
TSNARE1-208ENST00000524325 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP29.9■■■□□ 2.38
TSNARE1-208ENST00000524325 PHKG2P15735 406 aa29.89■■■□□ 2.38
TSNARE1-208ENST00000524325 C1orf141Q5JVX7 400 aa29.89■■■□□ 2.38
TSNARE1-208ENST00000524325 WWC1Q8IX03 1113 aa29.88■■■□□ 2.37
TSNARE1-208ENST00000524325 GNAT3A8MTJ3 354 aa29.88■■■□□ 2.37
TSNARE1-208ENST00000524325 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
TSNARE1-208ENST00000524325 LGR6Q9HBX8 967 aa29.88■■■□□ 2.37
TSNARE1-208ENST00000524325 SEPT12Q8IYM1 358 aa29.87■■■□□ 2.37
TSNARE1-208ENST00000524325 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
TSNARE1-208ENST00000524325 AKAP4Q5JQC9 854 aa29.86■■■□□ 2.37
TSNARE1-208ENST00000524325 MAP3K5Q99683 1374 aa29.86■■■□□ 2.37
TSNARE1-208ENST00000524325 IFNL2Q8IZJ0 200 aa29.86■■■□□ 2.37
TSNARE1-208ENST00000524325 IL17REQ8NFR9 667 aa29.86■■■□□ 2.37
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa29.86■■■□□ 2.37
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa29.86■■■□□ 2.37
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM182BQ5T319 152 aa29.84■■■□□ 2.37
TSNARE1-208ENST00000524325 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
TSNARE1-208ENST00000524325 RXRBP28702 533 aa29.84■■■□□ 2.37
TSNARE1-208ENST00000524325 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
TSNARE1-208ENST00000524325 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
TSNARE1-208ENST00000524325 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
TSNARE1-208ENST00000524325 CDCA7LQ96GN5 454 aa29.82■■■□□ 2.36
TSNARE1-208ENST00000524325 ZBED9Q6R2W3 1325 aa29.82■■■□□ 2.36
TSNARE1-208ENST00000524325 TNS2Q63HR2 1409 aa29.82■■■□□ 2.36
TSNARE1-208ENST00000524325 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF521Q96K83 1311 aa29.81■■■□□ 2.36
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC27Q2M243 656 aa29.81■■■□□ 2.36
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TSNARE1-208ENST00000524325 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
TSNARE1-208ENST00000524325 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
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TSNARE1-208ENST00000524325 DCAF5Q96JK2 942 aa29.75■■■□□ 2.35
TSNARE1-208ENST00000524325 SHANK3Q9BYB0 1731 aa29.75■■■□□ 2.35
TSNARE1-208ENST00000524325 DLG5Q8TDM6 1919 aa29.74■■■□□ 2.35
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TSNARE1-208ENST00000524325 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
TSNARE1-208ENST00000524325 ACSBG1Q96GR2 724 aa29.72■■■□□ 2.35
TSNARE1-208ENST00000524325 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
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TSNARE1-208ENST00000524325 WDR63Q8IWG1 891 aa29.71■■■□□ 2.35
TSNARE1-208ENST00000524325 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa29.7■■■□□ 2.35
TSNARE1-208ENST00000524325 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
TSNARE1-208ENST00000524325 RGS12O14924 1447 aa29.7■■■□□ 2.34
TSNARE1-208ENST00000524325 TEFQ10587 303 aa29.69■■■□□ 2.34
TSNARE1-208ENST00000524325 KRT27Q7Z3Y8 459 aa29.68■■■□□ 2.34
TSNARE1-208ENST00000524325 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
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TSNARE1-208ENST00000524325 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
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TSNARE1-208ENST00000524325 SLFN5Q08AF3 891 aa29.66■■■□□ 2.34
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNQ2O43526 872 aa29.65■■■□□ 2.34
TSNARE1-208ENST00000524325 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
TSNARE1-208ENST00000524325 PTF1AQ7RTS3 328 aa29.64■■■□□ 2.34
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNQ3O43525 872 aa29.63■■■□□ 2.33
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC39A6Q13433 755 aa29.63■■■□□ 2.33
TSNARE1-208ENST00000524325 EP400Q96L91 3159 aa29.63■■■□□ 2.33
TSNARE1-208ENST00000524325 MBIPQ9NS73 344 aa29.63■■■□□ 2.33
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF853P0CG23 659 aa29.63■■■□□ 2.33
TSNARE1-208ENST00000524325 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
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