RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524238.3

HMBOX1-211, Transcript of homeobox containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HMBOX1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1-211ENST00000524238 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 KIF20BQ96Q89 1820 aa9.12□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 A0A1W2PP64 1363 aa9.12□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 LRRC7Q96NW7 1537 aa9.12□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 VGFO15240 615 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 HMMRO75330 724 aa9.12□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 SYCP1Q15431 976 aa9.12□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 NFE2L2Q16236 605 aa9.12□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 CCDC183Q5T5S1 534 aa9.12□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 SIRT2Q8IXJ6 389 aa9.12□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 ANKRD44Q8N8A2 993 aa9.12□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 DNAJC5BQ9UF47 199 aa9.12□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM87AQ8NBN3 555 aa9.11□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 OSBPL3Q9H4L5 887 aa9.11□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa9.11□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 SDSP20132 328 aa9.11□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 AFAP1Q8N556 730 aa9.11□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 RNF214Q8ND24 703 aa9.11□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 IL17RAQ96F46 866 aa9.11□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 TMX3Q96JJ7 454 aa9.11□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 USP25Q9UHP3 1055 aa9.11□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 PKP1Q13835 747 aa9.1□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa9.1□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.1□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF853P0CG23 659 aa9.09□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 CHGAP10645 457 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 MX1P20591 662 aa9.09□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 NEK4P51957 841 aa9.09□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM193AP78312 1265 aa9.09□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 CHD1O14646 1710 aa9.09□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 PTPRCP08575 1304 aa9.09□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 PIK3C2BO00750 1634 aa9.09□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 RGS12O14924 1447 aa9.09□□□□□ -0.95
HMBOX1-211ENST00000524238 FYB1O15117 783 aa9.08□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 ADCY5O95622 1261 aa9.08□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 PRKAR2BP31323 418 aa9.08□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.08□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 OGFRQ9NZT2 677 aa9.08□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 HECW2Q9P2P5 1572 aa9.08□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 RTL1A6NKG5 1358 aa9.08□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 KNDC1Q76NI1 1749 aa9.08□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 KDM4AO75164 1064 aa9.08□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 UBE2HP62256 183 aa9.08□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 CBX1P83916 185 aa9.08□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.08□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 ANKRD7Q92527 254 aa9.08□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 BCL2L12Q9HB09 334 aa9.08□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 PRDM10Q9NQV6 1147 aa9.08□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 ATP10DQ9P241 1426 aa9.07□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa9.07□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 CTIFO43310 598 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 CREBRFQ8IUR6 639 aa9.07□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa9.07□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 CABP2Q9NPB3 220 aa9.07□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM132EQ6IEE7 984 aa9.06□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 CEP85Q6P2H3 762 aa9.06□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 KIAA1524Q8TCG1 905 aa9.06□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 MBIPQ9NS73 344 aa9.06□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa9.06□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa9.06□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 CCDC66A2RUB6 948 aa9.05□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 FGD1P98174 961 aa9.05□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 USP48Q86UV5 1035 aa9.05□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 ARID3AQ99856 593 aa9.05□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 NPATQ14207 1427 aa9.05□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 RIMS2Q9UQ26 1411 aa9.05□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 ABCC3O15438 1527 aa9.05□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 PLEKHG5O94827 1062 aa9.05□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 ATP7BP35670 1465 aa9.05□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 AOX1Q06278 1338 aa9.05□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 KIAA0232Q92628 1395 aa9.05□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.05□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa9.05□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa9.04□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 SMTNL1A8MU46 457 aa9.04□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 PDE1AP54750 535 aa9.04□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 CD163L1Q9NR16 1453 aa9.03□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 CCDC192P0DO97 292 aa9.03□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 AEBP1Q8IUX7 1158 aa9.03□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 TSPYL6Q8N831 410 aa9.03□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 DLG5Q8TDM6 1919 aa9.03□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 AATKQ6ZMQ8 1374 aa9.03□□□□□ -0.96
HMBOX1-211ENST00000524238 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms