RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523270.1

CNOT8-223, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 8, human

TSL 4

Gene CNOT8, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT8-223	ENST00000523270	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	28.07	■■■□□ 2.08
CNOT8-223	ENST00000523270	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	28.06	■■■□□ 2.08
CNOT8-223	ENST00000523270	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	28.06	■■■□□ 2.08
CNOT8-223	ENST00000523270	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		28.06	■■■□□ 2.08
CNOT8-223	ENST00000523270	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		28.05	■■■□□ 2.08
CNOT8-223	ENST00000523270	EYA1	Q99502	592 aa		28.05	■■■□□ 2.08
CNOT8-223	ENST00000523270	BTAF1	O14981	1849 aa		28.04	■■■□□ 2.08
CNOT8-223	ENST00000523270	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		28.04	■■■□□ 2.08
CNOT8-223	ENST00000523270	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
CNOT8-223	ENST00000523270	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		28.03	■■■□□ 2.08
CNOT8-223	ENST00000523270	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
CNOT8-223	ENST00000523270	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		28.02	■■■□□ 2.08
CNOT8-223	ENST00000523270	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
CNOT8-223	ENST00000523270	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
CNOT8-223	ENST00000523270	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
CNOT8-223	ENST00000523270	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		27.98	■■■□□ 2.07
CNOT8-223	ENST00000523270	PLSCR1	O15162	318 aa		27.97	■■■□□ 2.07
CNOT8-223	ENST00000523270	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		27.95	■■■□□ 2.07
CNOT8-223	ENST00000523270	PROM2	Q8N271	834 aa		27.95	■■■□□ 2.06
CNOT8-223	ENST00000523270	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		27.95	■■■□□ 2.06
CNOT8-223	ENST00000523270	CYP27B1	O15528	508 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CNOT8-223	ENST00000523270	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
CNOT8-223	ENST00000523270	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CNOT8-223	ENST00000523270	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CNOT8-223	ENST00000523270	MTHFS	P49914	203 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CNOT8-223	ENST00000523270	IL13	P35225	146 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CNOT8-223	ENST00000523270	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
CNOT8-223	ENST00000523270	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CNOT8-223	ENST00000523270	ITGB4	P16144	1822 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CNOT8-223	ENST00000523270	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
CNOT8-223	ENST00000523270	TXNRD1	Q16881	649 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CNOT8-223	ENST00000523270	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
CNOT8-223	ENST00000523270	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
CNOT8-223	ENST00000523270	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CNOT8-223	ENST00000523270	PAPPA	Q13219	1627 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CNOT8-223	ENST00000523270	LY75	O60449	1722 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CNOT8-223	ENST00000523270	SPG7	Q9UQ90	795 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CNOT8-223	ENST00000523270	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	27.82	■■■□□ 2.04
CNOT8-223	ENST00000523270	NBPF14	Q5TI25	921 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CNOT8-223	ENST00000523270	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CNOT8-223	ENST00000523270	KDR	P35968	1356 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CNOT8-223	ENST00000523270	LRP5	O75197	1615 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CNOT8-223	ENST00000523270	PHKG2	P15735	406 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CNOT8-223	ENST00000523270	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
CNOT8-223	ENST00000523270	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CNOT8-223	ENST00000523270	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CNOT8-223	ENST00000523270	CASZ1	Q86V15	1759 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CNOT8-223	ENST00000523270	KCNQ4	P56696	695 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CNOT8-223	ENST00000523270	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
CNOT8-223	ENST00000523270	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CNOT8-223	ENST00000523270	HMOX1	P09601	288 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CNOT8-223	ENST00000523270	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CNOT8-223	ENST00000523270	PPP2R1A	P30153	589 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CNOT8-223	ENST00000523270	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
CNOT8-223	ENST00000523270	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
CNOT8-223	ENST00000523270	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CNOT8-223	ENST00000523270	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
CNOT8-223	ENST00000523270	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
CNOT8-223	ENST00000523270	ZNF827	Q17R98	1081 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CNOT8-223	ENST00000523270	PIGB	Q92521	554 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CNOT8-223	ENST00000523270	SLC15A2	Q16348	729 aa		27.7	■■■□□ 2.02
CNOT8-223	ENST00000523270	STK32B	Q9NY57	414 aa		27.7	■■■□□ 2.02
CNOT8-223	ENST00000523270	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
CNOT8-223	ENST00000523270	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		27.68	■■■□□ 2.02
CNOT8-223	ENST00000523270	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
CNOT8-223	ENST00000523270	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		27.68	■■■□□ 2.02
CNOT8-223	ENST00000523270	PALLD	Q8WX93	1383 aa		27.68	■■■□□ 2.02
CNOT8-223	ENST00000523270	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CNOT8-223	ENST00000523270	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		27.66	■■■□□ 2.02
CNOT8-223	ENST00000523270	C5	P01031	1676 aa		27.66	■■■□□ 2.02
CNOT8-223	ENST00000523270	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
CNOT8-223	ENST00000523270	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
CNOT8-223	ENST00000523270	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		27.64	■■■□□ 2.02
CNOT8-223	ENST00000523270	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
CNOT8-223	ENST00000523270	AKT1S1	Q96B36	256 aa		27.64	■■■□□ 2.02
CNOT8-223	ENST00000523270	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		27.64	■■■□□ 2.02
CNOT8-223	ENST00000523270	DCAF5	Q96JK2	942 aa		27.62	■■■□□ 2.01
CNOT8-223	ENST00000523270	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		27.61	■■■□□ 2.01
CNOT8-223	ENST00000523270	CFAP53	Q96M91	514 aa		27.61	■■■□□ 2.01
CNOT8-223	ENST00000523270	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		27.61	■■■□□ 2.01
CNOT8-223	ENST00000523270	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
CNOT8-223	ENST00000523270	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
CNOT8-223	ENST00000523270	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CNOT8-223	ENST00000523270	ZBTB7A	O95365	584 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CNOT8-223	ENST00000523270	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
CNOT8-223	ENST00000523270	ATG3	Q9NT62	314 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CNOT8-223	ENST00000523270	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CNOT8-223	ENST00000523270	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		27.57	■■■□□ 2
CNOT8-223	ENST00000523270	C4B	P0C0L5	1744 aa		27.56	■■■□□ 2
CNOT8-223	ENST00000523270	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		27.55	■■■□□ 2
CNOT8-223	ENST00000523270	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		27.55	■■■□□ 2
CNOT8-223	ENST00000523270	CABP4	P57796	275 aa		27.54	■■■□□ 2
CNOT8-223	ENST00000523270	LGR6	Q9HBX8	967 aa		27.54	■■■□□ 2
CNOT8-223	ENST00000523270	SPON1	Q9HCB6	807 aa		27.54	■■■□□ 2
CNOT8-223	ENST00000523270	MRC1	P22897	1456 aa		27.53	■■■□□ 2
CNOT8-223	ENST00000523270	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		27.53	■■■□□ 2
CNOT8-223	ENST00000523270	SIK1	P57059	783 aa		27.53	■■■□□ 2
CNOT8-223	ENST00000523270	PRKAR2B	P31323	418 aa		27.52	■■■□□ 2
CNOT8-223	ENST00000523270	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		27.52	■■■□□ 2
CNOT8-223	ENST00000523270	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		27.52	■■■□□ 2

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