RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521825.1

TSNARE1-207, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSNARE1, Length 346 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-207ENST00000521825 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.34■■□□□ 1.49
TSNARE1-207ENST00000521825 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
TSNARE1-207ENST00000521825 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.33■■□□□ 1.49
TSNARE1-207ENST00000521825 NCAPD2Q15021 1401 aa24.33■■□□□ 1.49
TSNARE1-207ENST00000521825 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TSNARE1-207ENST00000521825 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.32■■□□□ 1.48
TSNARE1-207ENST00000521825 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
TSNARE1-207ENST00000521825 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1-207ENST00000521825 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1-207ENST00000521825 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1-207ENST00000521825 MORC1Q86VD1 984 aa24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1-207ENST00000521825 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1-207ENST00000521825 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
TSNARE1-207ENST00000521825 PROM2Q8N271 834 aa24.29■■□□□ 1.48
TSNARE1-207ENST00000521825 EYA1Q99502 592 aa24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1-207ENST00000521825 LRP5O75197 1615 aa24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1-207ENST00000521825 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
TSNARE1-207ENST00000521825 NBPF14Q5TI25 921 aa24.25■■□□□ 1.47
TSNARE1-207ENST00000521825 TXNRD1Q16881 649 aa24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-207ENST00000521825 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.21■■□□□ 1.47
TSNARE1-207ENST00000521825 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.21■■□□□ 1.47
TSNARE1-207ENST00000521825 ITGB4P16144 1822 aa24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1-207ENST00000521825 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1-207ENST00000521825 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1-207ENST00000521825 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.2■■□□□ 1.46
TSNARE1-207ENST00000521825 LY75O60449 1722 aa24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1-207ENST00000521825 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1-207ENST00000521825 CYP27B1O15528 508 aa24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1-207ENST00000521825 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
TSNARE1-207ENST00000521825 PAPPAQ13219 1627 aa24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-207ENST00000521825 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.17■■□□□ 1.46
TSNARE1-207ENST00000521825 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TSNARE1-207ENST00000521825 CASZ1Q86V15 1759 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-207ENST00000521825 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-207ENST00000521825 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.46
TSNARE1-207ENST00000521825 SPG7Q9UQ90 795 aa24.14■■□□□ 1.45
TSNARE1-207ENST00000521825 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.13■■□□□ 1.45
TSNARE1-207ENST00000521825 IL13P35225 146 aa24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-207ENST00000521825 MTHFSP49914 203 aa24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-207ENST00000521825 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-207ENST00000521825 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-207ENST00000521825 SLC15A2Q16348 729 aa24.1■■□□□ 1.45
TSNARE1-207ENST00000521825 STK32BQ9NY57 414 aa24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1-207ENST00000521825 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.08■■□□□ 1.45
TSNARE1-207ENST00000521825 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.08■■□□□ 1.45
TSNARE1-207ENST00000521825 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.07■■□□□ 1.44
TSNARE1-207ENST00000521825 KDRP35968 1356 aa24.07■■□□□ 1.44
TSNARE1-207ENST00000521825 PHKG2P15735 406 aa24.07■■□□□ 1.44
TSNARE1-207ENST00000521825 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
TSNARE1-207ENST00000521825 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.07■■□□□ 1.44
TSNARE1-207ENST00000521825 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
TSNARE1-207ENST00000521825 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.07■■□□□ 1.44
TSNARE1-207ENST00000521825 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.05■■□□□ 1.44
TSNARE1-207ENST00000521825 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.05■■□□□ 1.44
TSNARE1-207ENST00000521825 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.05■■□□□ 1.44
TSNARE1-207ENST00000521825 KCNQ4P56696 695 aa24.04■■□□□ 1.44
TSNARE1-207ENST00000521825 ZNF827Q17R98 1081 aa24.04■■□□□ 1.44
TSNARE1-207ENST00000521825 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
TSNARE1-207ENST00000521825 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
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TSNARE1-207ENST00000521825 AKT1S1Q96B36 256 aa24.02■■□□□ 1.44
TSNARE1-207ENST00000521825 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1-207ENST00000521825 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1-207ENST00000521825 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
TSNARE1-207ENST00000521825 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
TSNARE1-207ENST00000521825 SPON1Q9HCB6 807 aa24■■□□□ 1.43
TSNARE1-207ENST00000521825 PALLDQ8WX93 1383 aa23.99■■□□□ 1.43
TSNARE1-207ENST00000521825 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-207ENST00000521825 SCN11AQ9UI33 1791 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-207ENST00000521825 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
TSNARE1-207ENST00000521825 ZBTB7AO95365 584 aa23.96■■□□□ 1.43
TSNARE1-207ENST00000521825 HMOX1P09601 288 aa23.96■■□□□ 1.43
TSNARE1-207ENST00000521825 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
TSNARE1-207ENST00000521825 DCAF5Q96JK2 942 aa23.96■■□□□ 1.43
TSNARE1-207ENST00000521825 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.96■■□□□ 1.43
TSNARE1-207ENST00000521825 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
TSNARE1-207ENST00000521825 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.94■■□□□ 1.42
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TSNARE1-207ENST00000521825 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.93■■□□□ 1.42
TSNARE1-207ENST00000521825 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.93■■□□□ 1.42
TSNARE1-207ENST00000521825 C4BP0C0L5 1744 aa23.93■■□□□ 1.42
TSNARE1-207ENST00000521825 PPP2R1AP30153 589 aa23.92■■□□□ 1.42
TSNARE1-207ENST00000521825 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.92■■□□□ 1.42
TSNARE1-207ENST00000521825 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
TSNARE1-207ENST00000521825 PTGER2P43116 358 aa23.91■■□□□ 1.42
TSNARE1-207ENST00000521825 MTFR1LQ9H019 292 aa23.91■■□□□ 1.42
TSNARE1-207ENST00000521825 ATG3Q9NT62 314 aa23.91■■□□□ 1.42
TSNARE1-207ENST00000521825 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.91■■□□□ 1.42
TSNARE1-207ENST00000521825 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.9■■□□□ 1.42
TSNARE1-207ENST00000521825 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23.89■■□□□ 1.42
TSNARE1-207ENST00000521825 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.89■■□□□ 1.41
TSNARE1-207ENST00000521825 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.89■■□□□ 1.41
TSNARE1-207ENST00000521825 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.89■■□□□ 1.41
TSNARE1-207ENST00000521825 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.88■■□□□ 1.41
TSNARE1-207ENST00000521825 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
TSNARE1-207ENST00000521825 SIK1P57059 783 aa23.88■■□□□ 1.41
TSNARE1-207ENST00000521825 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
TSNARE1-207ENST00000521825 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
TSNARE1-207ENST00000521825 CFAP53Q96M91 514 aa23.87■■□□□ 1.41
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