RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520376.1

FBXW11-208, Transcript of F-box and WD repeat domain containing 11, human

TSL 2

Gene FBXW11, Length 686 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXW11-208	ENST00000520376	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FBXW11-208	ENST00000520376	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
FBXW11-208	ENST00000520376	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
FBXW11-208	ENST00000520376	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		33.09	■■■□□ 2.89
FBXW11-208	ENST00000520376	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		33.08	■■■□□ 2.89
FBXW11-208	ENST00000520376	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
FBXW11-208	ENST00000520376	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
FBXW11-208	ENST00000520376	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
FBXW11-208	ENST00000520376	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
FBXW11-208	ENST00000520376	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		33.04	■■■□□ 2.88
FBXW11-208	ENST00000520376	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		33.03	■■■□□ 2.88
FBXW11-208	ENST00000520376	EYA1	Q99502	592 aa		33.02	■■■□□ 2.88
FBXW11-208	ENST00000520376	KCNQ2	O43526	872 aa		33.01	■■■□□ 2.87
FBXW11-208	ENST00000520376	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.87
FBXW11-208	ENST00000520376	PLSCR1	O15162	318 aa		33	■■■□□ 2.87
FBXW11-208	ENST00000520376	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		32.99	■■■□□ 2.87
FBXW11-208	ENST00000520376	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		32.98	■■■□□ 2.87
FBXW11-208	ENST00000520376	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		32.98	■■■□□ 2.87
FBXW11-208	ENST00000520376	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		32.96	■■■□□ 2.87
FBXW11-208	ENST00000520376	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.87
FBXW11-208	ENST00000520376	ITGB4	P16144	1822 aa		32.94	■■■□□ 2.86
FBXW11-208	ENST00000520376	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		32.92	■■■□□ 2.86
FBXW11-208	ENST00000520376	LRP5	O75197	1615 aa		32.91	■■■□□ 2.86
FBXW11-208	ENST00000520376	LY75	O60449	1722 aa		32.91	■■■□□ 2.86
FBXW11-208	ENST00000520376	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
FBXW11-208	ENST00000520376	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
FBXW11-208	ENST00000520376	PAPPA	Q13219	1627 aa		32.89	■■■□□ 2.86
FBXW11-208	ENST00000520376	CYP27B1	O15528	508 aa		32.87	■■■□□ 2.85
FBXW11-208	ENST00000520376	MTHFS	P49914	203 aa		32.87	■■■□□ 2.85
FBXW11-208	ENST00000520376	NBPF14	Q5TI25	921 aa		32.86	■■■□□ 2.85
FBXW11-208	ENST00000520376	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
FBXW11-208	ENST00000520376	SPG7	Q9UQ90	795 aa		32.86	■■■□□ 2.85
FBXW11-208	ENST00000520376	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
FBXW11-208	ENST00000520376	TXNRD1	Q16881	649 aa		32.85	■■■□□ 2.85
FBXW11-208	ENST00000520376	PROM2	Q8N271	834 aa		32.85	■■■□□ 2.85
FBXW11-208	ENST00000520376	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	32.85	■■■□□ 2.85
FBXW11-208	ENST00000520376	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	32.84	■■■□□ 2.85	2e-6	■■□□□ 13.5
FBXW11-208	ENST00000520376	IL13	P35225	146 aa		32.83	■■■□□ 2.85
FBXW11-208	ENST00000520376	KDR	P35968	1356 aa		32.82	■■■□□ 2.84
FBXW11-208	ENST00000520376	CASZ1	Q86V15	1759 aa		32.81	■■■□□ 2.84
FBXW11-208	ENST00000520376	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
FBXW11-208	ENST00000520376	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		32.81	■■■□□ 2.84
FBXW11-208	ENST00000520376	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		32.8	■■■□□ 2.84
FBXW11-208	ENST00000520376	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		32.76	■■■□□ 2.83
FBXW11-208	ENST00000520376	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
FBXW11-208	ENST00000520376	PHKG2	P15735	406 aa		32.75	■■■□□ 2.83
FBXW11-208	ENST00000520376	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
FBXW11-208	ENST00000520376	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		32.74	■■■□□ 2.83
FBXW11-208	ENST00000520376	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		32.74	■■■□□ 2.83
FBXW11-208	ENST00000520376	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		32.74	■■■□□ 2.83
FBXW11-208	ENST00000520376	C5	P01031	1676 aa		32.73	■■■□□ 2.83
FBXW11-208	ENST00000520376	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
FBXW11-208	ENST00000520376	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		32.72	■■■□□ 2.83
FBXW11-208	ENST00000520376	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
FBXW11-208	ENST00000520376	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		32.7	■■■□□ 2.83
FBXW11-208	ENST00000520376	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		32.7	■■■□□ 2.83
FBXW11-208	ENST00000520376	STK32B	Q9NY57	414 aa		32.7	■■■□□ 2.83
FBXW11-208	ENST00000520376	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		32.69	■■■□□ 2.82
FBXW11-208	ENST00000520376	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		32.69	■■■□□ 2.82
FBXW11-208	ENST00000520376	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		32.69	■■■□□ 2.82
FBXW11-208	ENST00000520376	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
FBXW11-208	ENST00000520376	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
FBXW11-208	ENST00000520376	HMOX1	P09601	288 aa		32.66	■■■□□ 2.82
FBXW11-208	ENST00000520376	PALLD	Q8WX93	1383 aa		32.66	■■■□□ 2.82
FBXW11-208	ENST00000520376	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
FBXW11-208	ENST00000520376	PPP2R1A	P30153	589 aa		32.65	■■■□□ 2.82
FBXW11-208	ENST00000520376	SLC15A2	Q16348	729 aa		32.65	■■■□□ 2.82
FBXW11-208	ENST00000520376	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
FBXW11-208	ENST00000520376	CFAP53	Q96M91	514 aa		32.63	■■■□□ 2.81
FBXW11-208	ENST00000520376	PIGB	Q92521	554 aa		32.62	■■■□□ 2.81
FBXW11-208	ENST00000520376	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		32.62	■■■□□ 2.81
FBXW11-208	ENST00000520376	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
FBXW11-208	ENST00000520376	KCNQ4	P56696	695 aa		32.61	■■■□□ 2.81
FBXW11-208	ENST00000520376	ZNF827	Q17R98	1081 aa		32.61	■■■□□ 2.81
FBXW11-208	ENST00000520376	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		32.61	■■■□□ 2.81
FBXW11-208	ENST00000520376	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
FBXW11-208	ENST00000520376	DCAF5	Q96JK2	942 aa		32.6	■■■□□ 2.81
FBXW11-208	ENST00000520376	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		32.59	■■■□□ 2.81
FBXW11-208	ENST00000520376	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
FBXW11-208	ENST00000520376	C4B	P0C0L5	1744 aa		32.57	■■■□□ 2.8
FBXW11-208	ENST00000520376	AKT1S1	Q96B36	256 aa		32.56	■■■□□ 2.8
FBXW11-208	ENST00000520376	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
FBXW11-208	ENST00000520376	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		32.55	■■■□□ 2.8
FBXW11-208	ENST00000520376	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
FBXW11-208	ENST00000520376	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		32.54	■■■□□ 2.8
FBXW11-208	ENST00000520376	MRC1	P22897	1456 aa		32.53	■■■□□ 2.8
FBXW11-208	ENST00000520376	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		32.52	■■■□□ 2.8
FBXW11-208	ENST00000520376	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		32.51	■■■□□ 2.79
FBXW11-208	ENST00000520376	SPON1	Q9HCB6	807 aa		32.51	■■■□□ 2.79
FBXW11-208	ENST00000520376	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		32.5	■■■□□ 2.79
FBXW11-208	ENST00000520376	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
FBXW11-208	ENST00000520376	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
FBXW11-208	ENST00000520376	NUDC	Q9Y266	331 aa		32.49	■■■□□ 2.79
FBXW11-208	ENST00000520376	ZBTB7A	O95365	584 aa		32.48	■■■□□ 2.79
FBXW11-208	ENST00000520376	CABP4	P57796	275 aa		32.48	■■■□□ 2.79
FBXW11-208	ENST00000520376	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		32.48	■■■□□ 2.79
FBXW11-208	ENST00000520376	ATG3	Q9NT62	314 aa		32.47	■■■□□ 2.79
FBXW11-208	ENST00000520376	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		32.47	■■■□□ 2.79
FBXW11-208	ENST00000520376	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		32.46	■■■□□ 2.79
FBXW11-208	ENST00000520376	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79

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